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Cistrome-Harvard / test-data / 1.axt

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6 chrX 3035181 3035230 chrX 132747590 132747639 - 3318
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gagcatacattttcctacttctagagtgaatgcGTGAAGGATGTGACAAC

7 chrX 3035231 3035841 chr9 84391632 84392261 - 18947
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ATTATTTttctttctttattcattattttatttatttacattttaaatgttgcccctcttcctggtcccccctcaaagagttctttaccccttct-ccttccccttgcttctgagagagtgatccccaccacccactcctacttcacccccactagcattccccttccctgggacatcaagtttctactggattaagtgcatcctttcctactgagattagaaaaagcagccctctgctacatatgtactgg--ggcccacagactagcccatgtttgctctttggttggtgggttagcctctgggagctccgggaggtccagttagttgctactgttgttcttcctatggggttgcaatccccgtcagctccttcagtccatcccctaactcttccataggagtctctgacctcagtccgaaggctggctgtaaataactgcatctgtctcagtcatctgctggtagagcctctcagaggacagcaatgctaggcttctgtctgcaagcacaacatggcattaataatagtgtc-aggtttggtacctctgcatgggatgaatctcaagttgcgctggtctctgtatggcctttctttcagtctctgccttatg-tttgtccctgcatttcctt

8 chrX 3036436 3036947 chrX 132751812 132752320 - 32759
tagaaatacctaaacgtctataggaattcactgACAGAAAGGAAAGGTGATGCTCAAAGTCTCAGGGCAGTGCTACAATGCATAGGCAAGCAATACCATTTAAATGGAGAGATTTAAAAAAAATCATTTCTTCACCCATAAACCAGAACCAATTATTCAATATGGTCAAGTACCATGTTTTATTAGAGTTATTTCTGAATTAGATCATTGAACAGGATTCTAACCTAAATAACAAATTT-TATCTAAAACATTTTCTAGACTAAAAAGCATGCTTTGAGCCCTCCTTAAATAAAAAGGCCCATAGTGTATGAAACTAATCAACCATAGATCCTATATTTACTCCACCAATCCTCAGGACAGTTTATACTCTTtgtcctagttgggattttatttatgtgaacagacatcatgaccatggcaagtattataaaggacaacatttaattggggccggcttacaggttcagaggttcaggccattatcatTG----TATTAGTCAGTGTTCTCTGGAGCC
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9 chrX 3040802 3041403 chr5 51053187 51053738 - 12815
ttttggttaaatggtctggg-ctgtgtattccttgcatctttttgggtgtatttacacttcttttcatgcagaatttttctttctagtttcttgtgtagtactgaattgctggatagatattacttaaatataataatatttgttttttaaatcaggaaatggtcttatttctccactgattataattgatagttt-gctaggtgttgtggtcctggctggcatt---ttttggtctttcataatg----tgtagaccatttgcccaggccctttgagctttcaaagtctccattaaaatcaggtt------ttattataatgggcctgactttatatataacttggtctttttcccttgcagatttcatatcatttctttgttctgtacatttaagtgttttcattattatgtgtcataggaaagggtgtgtgtgaacttttctagtcctgtctggggtgtgttctatatgcctcttgctccttgatatttcactcttgcactatctatgtctaggatattttgtt--------------aaaatattttctgtgcctttgacctgagctttgtctcctttttgtaaacttatcagtcataaattttggtctgtacatagtgtcccagat
ttttagtaaactgttcagggattacttgtttcttgtgtcctcttgggtagagctaa--------ccagaatgaagttgtccttctagtgtcttctgtagagctgattc--------------atttaaat-tccttacatttgttttt---attatgaaatgttttcctttctccctcagttaagattgctggttttgctggccatggtagtccgggctggcattatgtcattgttgttcataacaaacttgtaaaatgtctgcc-aggccctctg-gcttttaaaatctcgattgcaagtccattggaaagctctgctaatgaccctgtctttatatgtgacttcatttttaccc-----------------atatccttgttctgtacatgtacgtgcc---------------------aaggagagttt-----cttttctggtcctgtctgtctggtgtcctgtatacctcatgtacttcgata----ggaattgctttctttagatttgggatattttattctatgattttgttaaaggtattttctatggcttttacctgagtttcttctccttcctttatatcaattattcacaggttt-ggtct---cttcttgtcccagat

10 chrX 3042537 3043219 chr5 51053739 51054217 - 9161
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12 chrX 3044072 3044955 chrX 132759936 132760824 - 57490
GTGATGAATCCCAAGGGAATGGATATGGGCTTCAAGGAGGGGTTGAGGTGGGCAGGCACGGAGTAGG----TTTAAGGGGAATTTAAAGAGACTAGAATCAAGAAGATGAAGTAAGGCACAACCAGCCTGTCAACATTCATTGTCCTATGCATATCTGTCTGTAAGACCTAGGATTTGAAGACTTTAAAGAATGAAGCAGAACACAATCTAATACTGTAGACAACTTTATTTCAGTTTCAGTGTTTTTATTCAAAAATTTAATAAAGTAAGCAATGATTCAAGGAAGGTTGTTTGAGTTCAGAAAAAC----ATAAAAGCCAGCAAGCACATGCTAAATATTAACCGAGCAGCTCTTTCAGAGAACTTTCTTAAGACAGACCAATTTAAACACAAATGCCTAGCACCTATTATA---GACTATATCTGAGAAAGCTTGAAAGCAAGGCAGAAGGCCATAACCAGATTCAGGGTACACTGAAAAAAACACTCAGCCTATCCTTCCACCAGACTGGGCTCTGTAGTTGTCTTCCAGCATTTAACATGAATGAATAAACATGCCTTATGAATTGAATGTAAATACTTGACACAGGAGTCATGAAATCACATCCAAGAAAAATACAGGGAACAAAATCCACCTAA-GGAGTGGGAGGAACAGCTTCTTCTTTTTCCTCTGGAACCTCTCTAGCTTCTCTCACAGTTCCCCAAGGCATTCCCT--ATCATGTACCTCAACAGTAGCAGCCTACGTATGTCTCAGCCATATTGGCCATGGATCAATAGAAGAGAATGGAGAGCACAAAGTAATGGAGATGGGCTGGGAGGAATGGCTTAGGTGAGTGCTAGAGCAAAATCTAGGAAGACTCTGGACCTAAGCCACATGTGACATTCCACCCCCA
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13 chrX 3044956 3044983 chrX 132767880 132767907 - 2133
TGACATACTTCCTCCATCTAGGCCACAC
tgacacacttcctccctcaaggccacac

14 chrX 3045356 3046390 chrX 132767908 132769035 - 54561
CTActccaacaaggccatatctcataaccctaccaaagattctactccctgatgactaagctttcaaatatatgagcctgtgagggacattcttatttaaaccactacaGCTAGAAAAAT-TACAAATGTTTTTATTTGCATTTCCCTGATGGATACAGATTGTTTTAAtaatttcctttttgctcctgtgataaaacactgaccaaaagcagcttggatgaggaaagggtt-----gtttagtttacagattgcagccta--------------------------------------------------------------------------------------------tctttgaggtaagctaaggcaaaaactaaagTTAATTTTT---AAAATATAGTAATTTCATGTAATGATTCATTGATTCAACAAAT----------TACTGGCTATGTTATAGGTcagtagttatcaacctttctaacactgcaactccttttgctataatgacctcaaccataaaattacttttgttgctacttcaaaactgtaattt-gtttctattatgaattataatgtaaatatatgatatgcagggtatctgatatatgaccgtcaaaagagttataacccacaagttgagaagcacAGTTCTCGATGCTTTTTAAGGTACTAGGATGTAACTGAATGAGACACAATGTTGTTGTGCTCAAGATGATTTTTTCTTTGAGTAAAACTGACA--AATGAGCTGGCACTATAgagatggttcagccagtaaagtagttacaggacaatgtaataacgtgagactgagtccccagcatccaaagaaaagtctgggcattgcaacttgcatctgtagtcacagtactggggaggtggagacatgagaaccactagagttttctgaacaaatttgtgaactcgagattcattgatagattctatctggaaaTTGAAGGAAACACCTTAATGACTTCAGGCC---------ATGTGCTTGTATACTCATGTGCTATACACATTTAAATacacgcacacatacatacacacacacacacatacacacacgcac-----------CACATTCTATTAAAAATAATTCACATGATGTCCTACAGTGAAAAATGGAGCAACAGGATCATGGGTTTAAAAAA
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15 chrX 3046548 3047589 chrX 132769039 132770071 - 59414
CTTTGAGCAAGTGATGTTTAAGTCAAGACAGGAAAGACATCAACTTGGAAAGGTTGTGAAAAGCATTATAAGTAAGAAATACTTTTACTGCAAAAGTTTTCAAATTCAAAACAAACTTGTTACCTTTGAGAATGTACAGGCAACATTAGTGTGGCTGTCATAAACACTCAAAAAAAAAAAGTAATAACCCAGAGCAGTACTTTA--------------------------------------------AACCTTGCATAGTGGTACATAATTAAAATCCTAGCTCTGGAGAGACTAGGGCAGGAGGGTCATGACTACATAATGGTACACTCTCAAAAAGAAGAAAAACAACCCTCAAAGTAAGAAGCTCTTATAATATG-TTCCCAATTGTTTCTTTGTGAAAATGTAATGCCATTAACATGTTCTGTATCATTTTAGTACATTGTATCTGTATATGTGTTT---GttaatttataaaatattaaattttatCTATGACTAAAAATGAGTGAAAACTGAAAGTTAAAAATTAAAGAGTTGTCATCCAACAAGTATACCTGACATACAGCtttactgcaaattatttatctatgtaaattataacagaaaattgtatgtataaattatcaatttataaaagtatacaatagaaaattagcaatttattattatataaattgtttaaaattcattatttgatattttaatacataaatgaaatatatttagggagaaatttaacttcctagatattatttaagtaagtataacatttaaattttgcttaatgtaagaaaatgcattgctagatactcatataatgtcaatacattttctattcatcacttataaatagtgacaagttataaagcttct-------------gCTTGGTTAAAAGGTAAAAAGCATAAGGCACAAATACATTAAAGATAATGCATGAGACAAGGTGAGGGCAGCCAGTAGACAAACATAAGCTACTTGTTAATGCATGACTTCATGAATGATCACTGAATTGTAAATACTCCAGATGGTATGAAGAGCTCATCAGAGATGACCACTCAGACACCGTGTATCGCTAATTAAATGTGTTTAGTCTAGC
TTTTGAACAAGTGATGTTTAATTCAAGACAGGAAAGACATCAACTTTGAAAAGTTATGAAAAGCTCT----GTAAGAAATAATTTTAGTGCAAAAGCTTTCAAACCCAAAACAAACTTGTTACCTTGAAGAATGCACAGAGACCATTAGTATGGCTGTCATACATACTCAAAAGAAAGAA--AATCTCCCAGAGCAGCACTTTACTACTTTTCATCATTGTGTTTTCCCGACTAAAAATACATTTTTTAAACTGGCATAGTGGTACACAATTGAAATCCTAGCTCCTGAGACTCTAGGGCAGGAGGGTCATGGCTACATAATGGTACACTCTCAAAAAGAAAGAA---AACTCTTAAAGTAAGAAGCTTCTAAAATATGTTTTCCAATTGTTTCTTCACGAAAATTTAATATCA-----GTGTTCTGTATCTTTTTAATACA-TGTATCTGCATATGTGTTTATAGTTAATTTATAAAATAGTAAACTTTATCTAGAACTAAGAATGAGTAAAATTTGTAAGTTAAAAATCAAAAAGTTGTTATCTAACAAGTACACTTGACATATGGTATTACTGAAAATTATT----TATGTACATTATAAC--AAAATTATATGTACAAATTATCAATTTATAAAATTATACAATAGAAA----------------------------------------TTTTGGTAACTTCATACATAAACGAAATGTACATAGGGAGACAATTAACTTCCTAGATA----TTTAGTAAATATAACATCTGAATTTTGCTTAATGTAAGAAAATACATTTctagatacacatataatatcaatatatt-----ttcatcacttataaacagtgacaagttataaagctacttaataagatgtaaactacatctaattttaaaaagcataagacacaaggatactaaagataatacatgagacgaggtgagggcagccagtagacatacacgggctacttGTTAATGAATGAATTCATGAATGATCTCTGAATTGTAAATTCTTCTGAtggtatggggagctcatcagagatgagcactcagacacagtgtatagccaataaaaagtctttattctagc

16 chrX 3047590 3047634 chrX 14222368 14222417 + 1675
CTGTTAGGG-----ACCTGGGTATAGCCCCAAGTGTTCAGAATGTGAGAT
CTGGAAGGAACTACACCCAAGTACAGCCTTGAGTGTCCAGAACATAGGAT

17 chrX 3047635 3047719 chrX 14222571 14222648 + 3429
TAGTTAAACCTGGATTGGTCTCAGCAAGACTATAAGATAAAGGAACCTTACACCTTAACACTGTTTTGCCCAGTTACAAAGGTac
TAGTTTAACCTGCAGTGGCCTCAGCAAGAATACAAGATGGAGGA-------ATTTCTGCATTGCCTTGCCTGCTGACAAAGGGAC

18 chrX 3049058 3049300 chrX 132770073 132770321 - 14281
ctcctgtaccatgcctgcctggatgctgccatgctcctgcctagatgatagtagactgaacttctgaacctctaagccagcccaaattaaatgttgtccttataaaagatgccttggtcatagtgt----tctcatcagtaaaaccctaa----GACAGAAGTTGGTACCAGATACGGGGGTTATTTGTTTCTTGAGGAATCATGAACTCTGAATACTGTG--------CCCAGGGGCATTCTGAAGATCTCATTAGAA
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19 chrX 3049301 3049850 chr15 879492 880081 - 31160
GGTTTTGTTAGATATTCTTTCAGATTAAAACATTCCATCCTAGAAGGAGGAAGAGGGTTTATAAAACTCAAGGACTATCACAATTTAA--GACTAATGAAACTCTGGGAA-TTCACAAAAGTCACATGGCCATCCCCAATGTTCTACAAGTAGTGAACAATTGCAGGCAGGAGTG-AGGGGTTTCCTTCAGTGGGGATTCCTGAAAGTTGGTCAGAGAGCTCTAGGGACGTAGTTTTCATTAATCATTATCAACACTGAGTAAGGCTTTCTGGTAATGGAGCTGACATTGAAtcatctgtgttcctttcagtgacctcaataaactcattggttcactaagctaaaatcaggtgCAATGATGTTGGCTTTGTTTCACTC--------------------------------------------AACGTCCTACTTGGAGTAAACATATACTTGTTCATATATTTTCAGGAAAATTTACACAACAGAAGGTAGAAACTTCTAAACAAAAGAATATTTCTCTTTGTTAGTTTAGTCTACTCACTCTATATGGAAAATAAGGATGGAAAAGAACACCACCACCCCCTACAttaatttgggc
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20 chrX 3055000 3055956 chrX 27929767 27930764 + 46154
CATCTGTCTAAGATGt---aattatatattttattaataa---ttatattaGCCTAGTTGTTAAACAAG----TTAAGTGTTTCTAATgtgatcctatttaaatataataag-------------cttaactgcataaatgccaaaaatatctccttctctcactcaaggtaaaggcaaaattcacctgtagagtttgtaacctgcagagctttgagctttctgactccactatgacttctagaaaatcacct--cacagttctctgcctccctccatcagttccagccatgcctctatcccagctgcttctcctcatgcatgcaaggtcttctctgacaactgagcctcagcaactgtcatcactttagctggaatgcatatttctcTTGACTGCTGCTGGAGGCCACAGTCTACCTGCATGT-----------------------------------------TTTCATTCCACACCCAAAGGTTCCTTGATAACTTTCCTGGCTATTCTGACTCTCTGAAAAGAATGCTCACCCTGGAATTTCATTTCCTTGAAGCTAGGCCTTGTCATGCTCCCTCTTATCACTTACCAATATGAAAATATTTCATACTGACTTAATAGCTACATGGCTATATGGCTCAtttcccagactaggatgagaactccatgaggataagatctgttcatttgctgcctctggtccttgcagtgtccaaaacactgcactgCAGAGACCACTCACAGTGTTTATGGGACATAGGTAAAACAAATGAACTGAGTGATAATCCATGGGATTGAGCATGTAAAATTACACAGGCATGCCTGGGTCTAGCCATATAGCTACCTACTAATGCACTTCCCACCAGGATCTAGGCTTGCAGGGCACGGTGAAATAGGGCAACTGGAGGCATGGCCAAGAGAAATCTTTCCAAGGTTGAAAT------GACTTTTCCATATACCAGGGTGATTTTATCCTTTTTTTAGAATGTGAGGCCTATTCCAAAGCCATTACATGATATGAACt
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