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情報生物学研究室
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分子進化学の手法を取り入れた、配列情報(塩基、アミノ酸)および構造の解析と 機能構築原理・生物多様性・分子進化に関する研究教育活動を行っています。
教授 遠藤俊徳 endo@ist.hokudai.ac.jp
##目標
配列決定技術の発展に伴い、多くの生物のゲノム配列が解読・公開されるようになった。 膨大なデータが次々に生み出され、そろそろ「生命とはなにか」の答えが出てきても良さそうだ。 しかし、多細胞生物では遺伝子数すら解明されたものは皆無である[1]。 それどころか「粒子としての遺伝子」の概念を「遺伝子機能情報を含むDNA領域」に 当てはめることが難しくなり、「遺伝子」の概念さえ議論の対象となった[2]。 バイオインフォマティクスは、生命に関わる分子の構造・状態の情報を用い、 既存知識や様々な尺度・手法に基づく類似度を規準に、 「遺伝子」や「タンパク質」の機能と振舞いの分類・予測方法開発と応用を扱ってきた。 一方で、配列や物理的構造の情報は観測可能な基盤であり、 遺伝子の定義が曖昧になったいま、既存知識への依存度の低い解析方法や 考え方がますます求められている。 我々は、こうした問題に取り組む研究の推進を目指している。
[1] Pertea M and Salzberg SL. Genome Biology, 2010 [2] Pearson H. What is a gene? Nature, 2006
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