multovl  1.3
Multiple overlaps of genomic regions
 All Classes Namespaces Files Functions Variables Typedefs Enumerations Enumerator Pages
Class Index
A | B | C | D | E | F | G | I | L | M | N | O | P | R | S | T | U
  A  
  E  
  L  
  P  
Stat (multovl::prob)   
  T  
AncestorRegion (multovl)   EmpirDistr (multovl::prob)   Linereader (multovl::io)   ParProbOpts (multovl::prob)   
  B  
Errors (multovl)   Linewriter (multovl::io)   ParProbPipeline (multovl::prob)   Tempfile   
EmpirDistr::Exception (multovl::prob)   
  M  
Pipeline (multovl)   TextReader (multovl::io)   
BamReader (multovl::io)   Linereader::Exception (multovl::io)   Polite (multovl)   Timer (multovl)   
BasePipeline (multovl)   
  F  
MultiOverlap (multovl)   ProbOpts (multovl::prob)   TrackReader (multovl::io)   
BedLinereader (multovl::io)   MultiRegion (multovl)   ProbPipeline (multovl::prob)   
  U  
BedLinewriter (multovl::io)   Fileformat (multovl::io)   MultiRegLimit (multovl)   
  R  
  C  
FileReader (multovl::io)   MultovlOptbase (multovl)   UniformGen (multovl::prob)   
FreeRegions (multovl::prob)   
  N  
RandomPlacer (multovl::prob)   
ClassicOpts (multovl)   
  G  
Region (multovl)   
ClassicPipeline (multovl)   Stat::NotfoundException (multovl::prob)   RegLimit (multovl)   
MultiOverlap::Counter (multovl)   GffLinereader (multovl::io)   
  O  
  S  
  D  
GffLinewriter (multovl::io)   
  I  
ProbPipeline::OvlenCounter (multovl::prob)   ShuffleOvl (multovl::prob)   
Stat::Distr (multovl::prob)   
BasePipeline::Input (multovl)   
A | B | C | D | E | F | G | I | L | M | N | O | P | R | S | T | U