plotDiablo / plotVar

Issue #130 resolved
Kim-Anh Le Cao repo owner created an issue

Je te contacte pour signaler un bug d’affichage de noms sur plotDiablo. J’ai fait une analyse avec données transcripto et lipido et en fait les noms des blocks affichés sur le graphique plotDiablo sont inversés. Comme tu peux voir dans l’image jointe, en fait le nom de block « transcripts » doit être à la place de « Lipids ». J’ai vérifié sur les plotIndiv et la séparation des groupes « verts » et « bleus » est visible seulement sur le block des transcrits. En outre, tu remarqueras l’étendue des valeurs des variates qui est plus grande sur les données transcripto que sur lipides ce qui est logique vu la dimension des datasets (30000 transcrits vs 100 lipids). Donc tout va dans le sens d’une inversion du nom des datasets dans le plot… Bref ce n’est pas grave mais ce serait bien de le corriger je pense.

C’est pareil pour le plotVar en renseignant l’argument var.names, la légende pour chaque block est inversée.

A plus Yannick

Comments (4)

  1. Florian Rohart

    commit bbc7f70 solves the plotDiablo issue. For info, see screenshot: first row=before, second row=what it should have been.

    Can I have more details on the plotVar problem?

    Screen Shot 2018-04-26 at 2.05.26 pm.png

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