Commits

Mathieu Lajoie committed a748676

edited the README.txt

Comments (0)

Files changed (7)

 
 # 1) Compile RED2 :
 
-make clean
-make
+  make clean
+  make
 
 # 2) Compile the DrawPics program used to generate the pics :
 
-javac SOFT/java/*.java
+  javac SOFT/java/*.java
 
 
 #### GETTING STARTED ####
 
 # 1) Run RED2 on a sample dataset
 
-./red2 -s SAMPLE_DATA/yeast_seq.fasta -e SAMPLE_DATA/gasch.csv -o OUT/
+  ./red2 -s SAMPLE_DATA/yeast_seq.fasta -e SAMPLE_DATA/gasch.csv -o OUT/
 
 # or simply use the sample configuration file with the "v" option :
 
-./red2 -v sample_yeast.cfg -o OUT/
+  ./red2 -v sample_yeast.cfg -o OUT/
 
 
 # 2) Generate the pics using the DrawPics java program
 
-java -cp SOFT/java/ DrawPics OUT/
+  java -cp SOFT/java/ DrawPics OUT/
 
 
 # 3) View the analysis results using a web browser
 
-google-chrome OUT/index.html &
+  google-chrome OUT/index.html &
 
 
 
 
 # To view the list of all the options and their default value :
 
-./red2 -h 
+  ./red2 -h 
 
-# Most of these options are explained in the RED2 paper or in the web usersguide (see file "USERSGUIDE/usersguide.xhtml")
+# Most of these options are explained in the RED2 paper or in the web usersguide
+# (see file "USERSGUIDE/usersguide.xhtml")
 
 # In addition, this standalone version allows the following options :
 
-# "-d " : specify a seed file (e.g. "OUT/seeds_all.txt") to start an analysis with if you want to try different optimization parameters only
+# "-d " : specify a seed file (e.g. "OUT/seeds_all.txt") to start an analysis with if 
+# you want to try different optimization parameters only
 
-# "-m " : specify a motif file (e.g. "OUT/motifs_all.txt") to start an analysis with if you want to try different filtering  parameters only
-
-
+# "-m " : specify a motif file (e.g. "OUT/motifs_all.txt") to start an analysis with if 
+# you want to try different filtering  parameters only
 
 
 ###########################################################################

SAMPLE_DATA/badis.matrix

-
->ABF1_TRH1
-A 0.1081560284 0.0017730496 0.0017730496 0.0017730496 0.4060283688 0.2216312057 0.3918439716 0.3421985816 0.3989361702 0.4131205674 0.115248227 0.0017730496 0.9166666667 0.0017730496 0.3705673759 0.335106383
-C 0.4131205674 0.9875886525 0.0017730496 0.0017730496 0.1719858156 0.2358156028 0.1578014184 0.1790780142 0.2074468085 0.0017730496 0.25 0.0017730496 0.079787234 0.4485815603 0.2216312057 0.1790780142
-G 0.0372340426 0.0017730496 0.9946808511 0.0017730496 0.2216312057 0.2570921986 0.2783687943 0.2003546099 0.2429078014 0.5833333333 0.0868794326 0.8102836879 0.0017730496 0.0939716312 0.1790780142 0.1436170213
-T 0.4414893617 0.0088652482 0.0017730496 0.9946808511 0.2003546099 0.2854609929 0.1719858156 0.2783687943 0.1507092199 0.0017730496 0.5478723404 0.1861702128 0.0017730496 0.4556737589 0.2287234043 0.3421985816
-
->ABF2_TRH1
-G 0.25 0.0178571429 0 0 0 1 0.0178571429 
-A 0.1785714286 0.0892857143 0 0 1 0 0.9464285714 
-T 0.1785714286 0.8035714286 0 1 0 0 0.0178571429 
-C 0.3928571429 0.0892857143 1 0 0 0 0.0178571429 
-
->ACE2_TRH1
-A 0.445114 0.00686 0 0.897196 0 0 0.489557 
-C 0.287353 0.924112 1 0.102804 0 1 0.2005 
-G 0.214361 0.063312 0 0 1 0 0.174565 
-T 0.053172 0.005716 0 0 0 0 0.135378 
-
->ADR1_v1_TRH1
-A 0.406675 0.001273 0 0 0 0.642138 0.341301 
-C 0.24165 0.996308 0.853403 1 1 0.059809 0.505578 
-G 0.13067 0.001304 0 0 0 0.202811 0.059999 
-T 0.221005 0.001114 0.146597 0 0 0.095242 0.093123 
-
->ADR1_v2_TRH1
-G 0.1428571429 0.0595238095 0 0 0 0 0.2857142857 0.0476190476
-A 0.1904761905 0.7261904762 0 0 0 0 0.7142857143 0.2380952381
-T 0.5238095238 0.1547619048 0 0 0 0 0 0.0476190476
-C 0.1428571429 0.0595238095 1 1 1 1 0 0.6666666667
-
->AFT2_TRH1
-G 0.2651515152 0.303030303 0 0 0 0 0 0.2727272727
-A 0.0833333333 0.696969697 0 1 0 0 0 0.0909090909
-T 0.2045454545 0 0 0 0 0 0 0.2121212121
-C 0.446969697 0 1 0 1 1 1 0.4242424242
-
->ASG1_TRH1
-A 0.001396648 0.001396648 0.001396648 0.001396648 0.7220670391 0.5265363128
-C 0.7555865922 0.9958100559 0.001396648 0.001396648 0.1131284916 0.001396648
-G 0.001396648 0.001396648 0.9958100559 0.9958100559 0.1634078212 0.001396648
-T 0.2416201117 0.001396648 0.001396648 0.001396648 0.001396648 0.4706703911
-
->AZF1_TRH1
-G 0.125 0 0 0 0.25 1 0.03125 0.0625 0.125 
-A 0.625 1 1 0.875 0.75 0 0.78125 0.8125 0.625 
-T 0.125 0 0 0 0 0 0.03125 0.0625 0.125 
-C 0.125 0 0 0.125 0 0 0.15625 0.0625 0.125 
-
->CAT8_TRH1
-A 0.0016339869 0.0016339869 0.0016339869 0.0016339869 0.6617647059 0.3153594771
-C 0.9950980392 0.9950980392 0.0016339869 0.0016339869 0.1258169935 0.1781045752
-G 0.0016339869 0.0016339869 0.9950980392 0.9950980392 0.2107843137 0.2826797386
-T 0.0016339869 0.0016339869 0.0016339869 0.0016339869 0.0016339869 0.2238562092
-
->CBF1_TRH1
-G 0.5277777778 0.0277777778 0 0 1 0 1 0.0555555556
-A 0.1944444444 0.0277777778 1 0 0 0 0 0.7222222222
-T 0.1944444444 0.0277777778 0 0 0 1 0 0.0555555556
-C 0.0833333333 0.9166666667 0 1 0 0 0 0.1666666667
-
->CEP3_TRH1
-G 0.0394736842 0 0 1 1 0.0131578947 0.0263157895 0.2105263158
-A 0.0394736842 0 0 0 0 0.9078947368 0.9210526316 0.4210526316
-T 0.3552631579 1 0 0 0 0.0657894737 0.0263157895 0.1578947368
-C 0.5657894737 0 1 0 0 0.0131578947 0.0263157895 0.2105263158
-
->CHA4_TRH1
-G 0.6770833333 1 0 1 1 0.2916666667 0.7604166667 0.1041666667
-A 0.21875 0 0 0 0 0.7083333333 0.21875 0.4791666667
-T 0.0520833333 0 0 0 0 0 0.0104166667 0.3125
-C 0.0520833333 0 1 0 0 0 0.0104166667 0.1041666667
-
->CIN5_TRH1
-A 0.0014880952 0.1324404762 0.9955357143 0.1086309524 0.1979166667 0.0014880952 0.90625 0.9955357143 0.0193452381 0.150297619
-C 0.0014880952 0.0729166667 0.0014880952 0.537202381 0.15625 0.0014880952 0.0907738095 0.0014880952 0.1383928571 0.6979166667
-G 0.0907738095 0.2276785714 0.0014880952 0.0491071429 0.5788690476 0.0014880952 0.0014880952 0.0014880952 0.3764880952 0.0848214286
-T 0.90625 0.5669642857 0.0014880952 0.3050595238 0.0669642857 0.9955357143 0.0014880952 0.0014880952 0.4657738095 0.0669642857
-
->CRZ1_TRH1
-A 0.201556 0.286035 0.366874 0.631234 0 0 0.003117 0.421755 0.074807 
-C 0.477983 0.21704 0.30201 0.356441 0 1 0.99072 0.295015 0.76413 
-G 0.177801 0.172824 0.221151 0.006838 1 0 0.003419 0.071026 0.082062 
-T 0.14266 0.324101 0.109965 0.005487 0 0 0.002743 0.212205 0.079001 
-
->CST6_TRH1
-G 0.3157894737 0.0131578947 0.9078947368 0 0 0.9473684211 0 0.0789473684 0.1973684211 
-A 0.4736842105 0.0131578947 0.0131578947 1 0 0.0526315789 0 0.4473684211 0.4605263158 
-T 0.1052631579 0.9605263158 0.0657894737 0 0 0 1 0.1842105263 0.1973684211 
-C 0.1052631579 0.0131578947 0.0131578947 0 1 0 0 0.2894736842 0.1447368421 
-
->CUP9_TRH1
-A 0.074627 0 0.835821 0.014925 0.910448 0 0.746269 0.402985 0.38806 
-C 0.104478 0 0 0.985075 0 0.641791 0.149254 0 0.134328 
-G 0.029851 1 0.089552 0 0.089552 0.089552 0 0 0.029851 
-T 0.791045 0 0.074627 0 0 0.268657 0.104478 0.597015 0.447761 
-
->DAL80_TRH1
-G 0.0555555556 1 0 0 0 0.0138888889 0.75 
-A 0.1111111111 0 1 0 1 0.9027777778 0.0277777778 
-T 0.1666666667 0 0 1 0 0.0694444444 0.0277777778 
-C 0.6666666667 0 0 0 0 0.0138888889 0.1944444444 
-
->DAL82_TRH1
-G 0.1447368421 0.0526315789 0.0263157895 0.4210526316 0 1 0 1 0.1052631579 
-A 0.5657894737 0.5263157895 0.3947368421 0.2631578947 0 0 0 0 0.1052631579 
-T 0.1447368421 0.3157894737 0.5526315789 0.2105263158 0.7368421053 0 0 0 0.1052631579 
-C 0.1447368421 0.1052631579 0.0263157895 0.1052631579 0.2631578947 0 1 0 0.6842105263 
-
->DOT6_TRH1
-A 0.2504340278 0.0004340278 0.9986979167 0.0004340278 0.0004340278 
-C 0.42578125 0.0004340278 0.0004340278 0.0004340278 0.0004340278 
-G 0.0993923611 0.9986979167 0.0004340278 0.0004340278 0.9986979167 
-T 0.2243923611 0.0004340278 0.0004340278 0.9986979167 0.0004340278 
-
->ECM22_TRH1
-G 0.0714285714 0.0714285714 0 0 0.8571428571 0.8571428571 0.0714285714 
-A 0.2857142857 0.1428571429 0 0 0 0 0.9285714286 
-T 0.2857142857 0.7142857143 0 0 0 0.1428571429 0 
-C 0.3571428571 0.0714285714 1 1 0.1428571429 0 0 
-
->ECM23_TRH1
-A 0.3076241135 0.3342198582 0.7216312057 0.0984042553 0.9973404255 0.0257092199 0.0088652482 0.1409574468 0.3014184397 0.3173758865 0.3023049645 
-C 0.2544326241 0.2491134752 0.1081560284 0.0203900709 0.0008865248 0.0008865248 0.8953900709 0.1870567376 0.2304964539 0.25 0.259751773 
-G 0.2296099291 0.2171985816 0.0975177305 0.8643617021 0.0008865248 0.0008865248 0.030141844 0.1409574468 0.2127659574 0.2464539007 0.2242907801 
-T 0.2083333333 0.1994680851 0.0726950355 0.0168439716 0.0008865248 0.9725177305 0.0656028369 0.5310283688 0.2553191489 0.1861702128 0.2136524823 
-
->EDS1_TRH1
-G 0.1428571429 1 1 0 0 0.0952380952 0 0.0119047619 0.1071428571 
-A 0.1428571429 0 0 1 0.7619047619 0.4761904762 1 0.8214285714 0.1547619048 
-T 0.1904761905 0 0 0 0.2380952381 0.1904761905 0 0.1547619048 0.5357142857 
-C 0.5238095238 0 0 0 0 0.2380952381 0 0.0119047619 0.2023809524 
-
->FHL1_TRH1
-G 0.9 0 0 1 0 0 0.175 0.15
-A 0 1 0 0 0 0.9 0.475 0.55
-T 0 0 0 0 0 0.1 0.075 0.15
-C 0.1 0 1 0 1 0 0.275 0.15
-
->FKH2_TRH1
-G 0.875 0 0 0 0 0 0 
-A 0.125 0 1 1 1 0 1 
-T 0 1 0 0 0 0 0 
-C 0 0 0 0 0 1 0 
-
->FZF1_TRH1
-G 0 0 0 0 0 0
-A 0 0 1 0 0 1
-T 0 1 0 1 0 0
-C 1 0 0 0 1 0
-
->GAT1_TRH1
-G 0.1875 0.046875 1 0 0 0 0 0.84375
-A 0.125 0.171875 0 1 0 1 1 0.03125
-T 0.25 0.359375 0 0 1 0 0 0.03125
-C 0.4375 0.421875 0 0 0 0 0 0.09375
-
->GAT3_TRH1
-A 0.6476608187 0.0847953216 0.9195906433 0.1198830409 0.0292397661 0.0599415205 0.514619883 0.283625731 0.3230994152 
-C 0.0862573099 0.0204678363 0.0014619883 0.0029239766 0.9415204678 0.2704678363 0.1871345029 0.3304093567 0.2529239766 
-G 0.2032163743 0.8801169591 0.0014619883 0.0087719298 0.0116959064 0.0423976608 0.1812865497 0.2134502924 0.2119883041 
-T 0.0628654971 0.014619883 0.0774853801 0.8684210526 0.0175438596 0.6271929825 0.1169590643 0.1725146199 0.2119883041 
-
->GAT4_TRH1
-A 0.3552631579 0.3092105263 0.8026315789 0.0296052632 0.9769736842 0.0032894737 0.0032894737 0.0460526316 0.3980263158 0.2861842105 0.3322368421 
-C 0.2105263158 0.2565789474 0.0394736842 0.0032894737 0.0032894737 0.0032894737 0.9901315789 0.2828947368 0.2006578947 0.2598684211 0.2401315789 
-G 0.2368421053 0.1776315789 0.1184210526 0.9638157895 0.0032894737 0.0032894737 0.0032894737 0.0328947368 0.2269736842 0.2335526316 0.2138157895 
-T 0.1973684211 0.2565789474 0.0394736842 0.0032894737 0.0164473684 0.9901315789 0.0032894737 0.6381578947 0.1743421053 0.2203947368 0.2138157895 
-
->GIS1_TRH1
-A 0.408313 0 0 0 0 0 0.486553 0.459658 0.322738 
-C 0.215159 0.97066 1 1 0.872861 0 0.04401 0.110024 0.193154 
-G 0.124694 0 0 0 0 0 0.151589 0.156479 0.183374 
-T 0.251834 0.02934 0 0 0.127139 1 0.317848 0.273839 0.300733 
-
->GLN3_TRH1
-A 0.0004537205 0.9986388385 0.0004537205 0.7427404719 0.6138838475 
-C 0.0004537205 0.0004537205 0.0004537205 0.0004537205 0.0004537205 
-G 0.9986388385 0.0004537205 0.0004537205 0.0004537205 0.2690562613 
-T 0.0004537205 0.0004537205 0.9986388385 0.2563520871 0.1166061706 
-
->GZF3_TRH1
-A 0.178571 0 1 0 1 0.732143 0.035714 0.392857
-C 0.392857 0 0 0 0 0.089286 0.375 0.178571
-G 0.017857 1 0 0 0 0 0.589286 0.267857
-T 0.410714 0 0 1 0 0.178571 0 0.160714
-
->HAC1_TRH1
-G 0.5568181818 0 0 0 0 1 0 0.4090909091
-A 0.2386363636 0.6818181818 0 1 0 0 0 0.2727272727
-T 0.1477272727 0 0 0 0 0 1 0.1363636364
-C 0.0568181818 0.3181818182 1 0 1 0 0 0.1818181818
-
->HAL9_TRH1
-A 0.0036764706 0.0036764706 0.0036764706 0.9889705882 0.6213235294 
-C 0.9889705882 0.0036764706 0.0036764706 0.0036764706 0.0036764706 
-G 0.0036764706 0.9889705882 0.9889705882 0.0036764706 0.3713235294 
-T 0.0036764706 0.0036764706 0.0036764706 0.0036764706 0.0036764706 
-
->HAP1_TRH1
-G 0 1 1 0.1052631579 0.5263157895 0.0394736842 0.0394736842 0.1052631579
-A 0 0 0 0.8947368421 0.0526315789 0.5131578947 0.0394736842 0.5789473684
-T 0 0 0 0 0.1578947368 0.4078947368 0.8815789474 0.2105263158
-C 1 0 0 0 0.2631578947 0.0394736842 0.0394736842 0.1052631579
-
->HCM1_TRH1
-A 0.513075 0.272549 0.670105 0.946809 1 0.007021 0.950104 0.580307
-C 0.160895 0.07678 0.315845 0.053191 0 0.855953 0.017114 0.170674
-G 0.248858 0.041351 0.006581 0 0 0.004388 0.015356 0.108697
-T 0.077172 0.60932 0.007468 0 0 0.132638 0.017426 0.140321
-
->HMRA2_TRH1
-G 0.0625 0.4642857143 0 1 0 0 0.0178571429 0.0803571429
-A 0.0625 0.5357142857 0.0357142857 0 0 0.9285714286 0.875 0.4017857143
-T 0.2053571429 0 0.9642857143 0 1 0.0714285714 0.0892857143 0.4375
-C 0.6696428571 0 0 0 0 0 0.0178571429 0.0803571429
-
->HSF1_TRH1
-G 0.125 0.015625 0.8125 1 0 0 0.1875 0.234375
-A 0.6875 0.015625 0.1875 0 1 1 0.0625 0.484375
-T 0.0625 0.953125 0 0 0 0 0.1875 0.171875
-C 0.125 0.015625 0 0 0 0 0.5625 0.109375
-
->LYS14_TRH1
-G 0.2083333333 0.0972222222 1 1 0 0 0 0.0694444444
-A 0.2083333333 0.0416666667 0 0 1 1 0.0555555556 0.125
-T 0.0972222222 0.0416666667 0 0 0 0 0.9444444444 0.6805555556
-C 0.4861111111 0.8194444444 0 0 0 0 0 0.125
-
->MBP1_TRH1
-A 0.548894 0.001401 0.148289 0 0.002335 0.349175 0.329496 
-C 0.095864 0.995872 0 0.878327 0.017835 0.172992 0.304358 
-G 0.182402 0.001506 0.851711 0 0.977795 0.091376 0.184759 
-T 0.17284 0.001221 0 0.121673 0.002036 0.386457 0.181387 
-
->MET31_TRH1
-A 0.3757668712 0.2039877301 0.1365030675 0.0015337423 0.0015337423 0.0015337423 0.0015337423 0.0015337423 0.0996932515 
-C 0.0996932515 0.2898773006 0.1365030675 0.0015337423 0.0015337423 0.0015337423 0.0015337423 0.995398773 0.0015337423 
-G 0.3757668712 0.3021472393 0.1794478528 0.995398773 0.0015337423 0.995398773 0.995398773 0.0015337423 0.6947852761 
-T 0.1487730061 0.2039877301 0.5475460123 0.0015337423 0.995398773 0.0015337423 0.0015337423 0.0015337423 0.2039877301 
-
->MET32_TRH1
-A 0.336119 0.107714 0.002152 0 0.931034 0.002152 0.635703 
-C 0.464981 0.051456 0.993823 1 0.034483 0.985203 0.151037 
-G 0.095446 0.771861 0.002177 0 0 0.002177 0.119043 
-T 0.103455 0.068969 0.001848 0 0.034483 0.010468 0.094217 
-
->MIG1_TRH1
-A 0.320756 0.010083 0 0 0 0.460255 0.047056 
-C 0.35371 0.969378 1 1 1 0.033741 0.583022 
-G 0.146057 0.011618 0 0 0 0.498571 0.298663 
-T 0.179476 0.008921 0 0 0 0.007434 0.071259 
-
->MIG2_TRH1
-A 0.014293 0 0 0 0.359426 0.045604 0.361456 
-C 0.957087 1 1 1 0.107529 0.765758 0.242841 
-G 0.016223 0 0 0 0.520648 0.130212 0.241668 
-T 0.012397 0 0 0 0.012397 0.058427 0.154035 
-
->MIG3_TRH1
-A 0.007957 0 0 0 0.412465 0.053707 0.40516 
-C 0.975933 0.939655 1 1 0.020831 0.690994 0.221607 
-G 0.009135 0 0 0 0.552753 0.165111 0.230826 
-T 0.006976 0.060345 0 0 0.013951 0.090188 0.142406 
-
->MSN2_TRH1
-A 0.6030120482 0.0006024096 0.0006024096 0.0006024096 0.0006024096 
-C 0.0728915663 0.0006024096 0.0006024096 0.0006024096 0.0006024096 
-G 0.3234939759 0.9981927711 0.9981927711 0.9981927711 0.9981927711 
-T 0.0006024096 0.0006024096 0.0006024096 0.0006024096 0.0006024096 
-
->MSN4_TRH1
-A 0.8311965812 0.0021367521 0.0021367521 0.0021367521 0.0021367521 
-C 0.0021367521 0.0021367521 0.0021367521 0.0021367521 0.0021367521 
-G 0.1645299145 0.9935897436 0.9935897436 0.9935897436 0.985042735 
-T 0.0021367521 0.0021367521 0.0021367521 0.0021367521 0.0106837607 
-
->NHP10_TRH1
-G 0.6 0.075 0 1 1 1 1 0.175
-A 0.2 0.075 0 0 0 0 0 0.675
-T 0.1 0.075 0 0 0 0 0 0.075
-C 0.1 0.775 1 0 0 0 0 0.075
-
->OAF1_TRH1
-G 0.1071428571 0 1 1 0.4285714286 0.8571428571 0.0357142857 0.0714285714 0.1428571429 
-A 0.1071428571 0 0 0 0.5714285714 0.0714285714 0.6785714286 0.1428571429 0.5714285714 
-T 0.4642857143 0 0 0 0 0.0714285714 0.25 0.7142857143 0.1428571429 
-C 0.3214285714 1 0 0 0 0 0.0357142857 0.0714285714 0.1428571429 
-
->PDR1_TRH1
-G 0.15 0 0 0.8666666667 0.0833333333 0.8833333333 0.8333333333 0.2166666667
-A 0.0833333333 0 0 0.1333333333 0.0166666667 0.0833333333 0.1 0.6166666667
-T 0.4833333333 0 0 0 0.0166666667 0.0166666667 0.0333333333 0.0833333333
-C 0.2833333333 1 1 0 0.8833333333 0.0166666667 0.0333333333 0.0833333333
-
->PDR8_TRH1
-G 0.3846153846 0 1 1 0 0.8461538462 0 0.0576923077
-A 0.3846153846 0 0 0 1 0.0769230769 1 0.1346153846
-T 0.0769230769 0 0 0 0 0 0 0.75
-C 0.1538461538 1 0 0 0 0.0769230769 0 0.0576923077
-
->PHD1_TRH1
-A 0.3582677165 0.094488189 0.374015748 0.0039370079 0.0019685039 0.0019685039 0.9114173228 0.0787401575 0.2165354331 0.3228346457
-C 0.2716535433 0.4330708661 0.4448818898 0.0984251969 0.0019685039 0.9862204724 0.0059055118 0.2204724409 0.4212598425 0.2755905512
-G 0.1929133858 0.3937007874 0.1535433071 0.0039370079 0.9940944882 0.0019685039 0.0688976378 0.3622047244 0.2244094488 0.2125984252
-T 0.1771653543 0.0787401575 0.0275590551 0.8937007874 0.0019685039 0.0098425197 0.0137795276 0.3385826772 0.1377952756 0.188976378
-
->PHO2_TRH1
-A 0.51640625 0.11640625 0.99765625 0.56328125 0.22890625 0.62890625
-C 0.00078125 0.00078125 0.00078125 0.00078125 0.00078125 0.00078125
-G 0.07578125 0.00078125 0.00078125 0.00078125 0.00078125 0.00078125
-T 0.40703125 0.88203125 0.00078125 0.43515625 0.76953125 0.36953125
-
->PHO4_TRH1
-A 0.0659090909 0.0568181818 0.3840909091 0.0022727273 0.275 0.0022727273 0.0204545455 
-C 0.0295454545 0.7295454545 0.0568181818 0.7022727273 0.0022727273 0.4386363636 0.0022727273 
-G 0.9022727273 0.0295454545 0.5568181818 0.0022727273 0.7204545455 0.0840909091 0.9113636364 
-T 0.0022727273 0.1840909091 0.0022727273 0.2931818182 0.0022727273 0.475 0.0659090909 
-
->PUT3_TRH1
-G 0.09375 0.0208333333 0 1 1 1 0.1875 0.1666666667
-A 0.09375 0.0208333333 0 0 0 0 0.5208333333 0.4583333333
-T 0.09375 0.0625 0 0 0 0 0.1458333333 0.25
-C 0.71875 0.8958333333 1 0 0 0 0.1458333333 0.125
-
->RDR1_TRH1
-G 0.1071428571 1 0 1 1 0 0 0.125
-A 0.25 0 0 0 0 1 0.8571428571 0.2678571429
-T 0.5357142857 0 0 0 0 0 0.1428571429 0.125
-C 0.1071428571 0 1 0 0 0 0 0.4821428571
-
->RDS1_TRH1
-G 0.0131578947 0.8947368421 1 0.1578947368 0.0526315789 0.8947368421 0.3157894737 
-A 0.0131578947 0 0 0 0 0 0.3157894737 
-T 0.0657894737 0 0 0 0 0 0.0526315789 
-C 0.9078947368 0.1052631579 0 0.8421052632 0.9473684211 0.1052631579 0.3157894737 
-
->RDS2_TRH1
-G 0.1842105263 0 0 1 1 0.8552631579 0.6973684211 
-A 0.3421052632 0 0 0 0 0.1184210526 0.1710526316 
-T 0.0789473684 1 0 0 0 0.0131578947 0.0657894737 
-C 0.3947368421 0 1 0 0 0.0131578947 0.0657894737 
-
->REB1_TRH1_flipped
-C 0.1 0 0 0 1 1 1 0 0.15 
-T 0.1 1 1 0 0 0 0 0.4 0.15 
-A 0.3 0 0 1 0 0 0 0 0.15 
-G 0.5 0 0 0 0 0 0 0.6 0.55 
-
->REI1_TRH1
-G 0 0 0 0 0 0.9523809524 0.2261904762 
-A 0 0.0476190476 0 0 0 0 0.5595238095 
-T 0.0476190476 0 0 0 1 0.0476190476 0.130952381 
-C 0.9523809524 0.9523809524 1 1 0 0 0.0833333333 
-
->RFX1_TRH1
-G 0.4230769231 1 0 0 0.6923076923 0 0.0192307692 0.0384615385
-A 0.1153846154 0 0 0 0.3076923077 0 0.0192307692 0.8846153846
-T 0.1923076923 0 1 1 0 0 0.4807692308 0.0384615385
-C 0.2692307692 0 0 0 0 1 0.4807692308 0.0384615385
-
->RGM1_TRH1
-A 0.997148289 0.0009505703 0.0009505703 0.0009505703 0.11121673 
-C 0.0009505703 0.0009505703 0.0009505703 0.0009505703 0.1188212928 
-G 0.0009505703 0.997148289 0.997148289 0.997148289 0.7690114068 
-T 0.0009505703 0.0009505703 0.0009505703 0.0009505703 0.0009505703 
-
->RGT1_TRH1
-A 0.421687 0.337349 0.373494 0.216867 0.26506 0.295181 0 0 0 0.036145 0.319277 
-C 0.13253 0.096386 0 0.018072 0.150602 0.180723 0.120482 1 1 0 0.126506 
-G 0.228916 0.343373 0 0 0.174699 0.042169 0 0 0 0.885542 0.331325 
-T 0.216867 0.222892 0.626506 0.76506 0.409639 0.481928 0.879518 0 0 0.078313 0.222892 
-
->RIM101_TRH1
-G 0.09375 1 0 0 0 0 1 
-A 0.09375 0 0 0 1 1 0 
-T 0.3854166667 0 0 0 0 0 0 
-C 0.4270833333 0 1 1 0 0 0 
-
->ROX1_TRH1
-A 0.3440054496 0.3549046322 0.3658038147 0.9979564033 0.0006811989 0.9979564033 0.9979564033 0.0006811989
-C 0.1805177112 0.1532697548 0.1914168937 0.0006811989 0.9979564033 0.0006811989 0.0006811989 0.0006811989
-G 0.2404632153 0.2295640327 0.2213896458 0.0006811989 0.0006811989 0.0006811989 0.0006811989 0.0006811989
-T 0.235013624 0.2622615804 0.2213896458 0.0006811989 0.0006811989 0.0006811989 0.0006811989 0.9979564033
-
->RPH1_TRH1
-G 0.1388888889 0 0 0 0 0 0.0694444444 0.0694444444
-A 0.5277777778 0 0 0 0 0 0.625 0.7361111111
-T 0.1944444444 0 0 0 0 1 0.2916666667 0.125
-C 0.1388888889 1 1 1 1 0 0.0138888889 0.0694444444
-
->RPN4_TRH1
-A 0.2319078947 0.0016447368 0.0016447368 0.0016447368 0.0016447368 0.0016447368 0.1266447368 
-C 0.0016447368 0.0016447368 0.0016447368 0.0016447368 0.0016447368 0.9950657895 0.0016447368 
-G 0.6726973684 0.9950657895 0.1200657895 0.9950657895 0.9950657895 0.0016447368 0.8700657895 
-T 0.09375 0.0016447368 0.8766447368 0.0016447368 0.0016447368 0.0016447368 0.0016447368 
-
->RSC3_TRH1
-A 0.0017482517 0.0017482517 0.0017482517 0.0017482517 0.0646853147 0.1905594406 0.2255244755 
-C 0.9108391608 0.0017482517 0.9947552448 0.0017482517 0.5472027972 0.3024475524 0.2604895105 
-G 0.0506993007 0.9947552448 0.0017482517 0.9947552448 0.1835664336 0.3653846154 0.3374125874 
-T 0.0367132867 0.0017482517 0.0017482517 0.0017482517 0.2045454545 0.1416083916 0.1765734266 
-
->RSC30_TRH1
-G 0.1923076923 0.4615384615 0.0769230769 0.9230769231 0.0769230769 1 0.1538461538 0.6923076923
-A 0.1923076923 0.1538461538 0 0 0 0 0 0
-T 0.1153846154 0 0 0 0 0 0 0
-C 0.5 0.3846153846 0.9230769231 0.0769230769 0.9230769231 0 0.8461538462 0.3076923077
-
->SIG1_TRH1
-A 0.9301470588 0.0036764706 0.9889705882 0.0036764706 0.9889705882 
-C 0.0183823529 0.0036764706 0.0036764706 0.0036764706 0.0036764706 
-G 0.0036764706 0.0036764706 0.0036764706 0.0036764706 0.0036764706 
-T 0.0477941176 0.9889705882 0.0036764706 0.9889705882 0.0036764706 
-
->SIP4_TRH1
-A 0.075949 0 0 0 0 0.227848 0.582278 
-C 0.481013 0.265823 0.987342 1 0 0 0.164557 
-G 0.126582 0 0 0 1 0.632911 0.253165 
-T 0.316456 0.734177 0.012658 0 0 0.139241 0 
-
->SKN7_TRH1
-A 0.0009615385 0.0009615385 0.0009615385 0.0009615385 0.4855769231 0.2086538462
-C 0.0009615385 0.0009615385 0.9971153846 0.8355769231 0.1471153846 0.1778846154
-G 0.9971153846 0.9971153846 0.0009615385 0.1625 0.3663461538 0.2932692308
-T 0.0009615385 0.0009615385 0.0009615385 0.0009615385 0.0009615385 0.3201923077
-
->SOK2_TRH1
-A 0.5 0.1465517241 0.4051724138 0.0431034483 0.0431034483 0.0431034483 0.974137931 0.0517241379 0.1724137931 0.2844827586 0.3017241379 
-C 0.1896551724 0.4913793103 0.474137931 0.0086206897 0.0086206897 0.9051724138 0.0086206897 0.0517241379 0.2068965517 0.3189655172 0.2327586207 
-G 0.1551724138 0.1810344828 0.0948275862 0.0431034483 0.9396551724 0.0086206897 0.0086206897 0.5 0.5172413793 0.2155172414 0.2327586207 
-T 0.1551724138 0.1810344828 0.025862069 0.9051724138 0.0086206897 0.0431034483 0.0086206897 0.3965517241 0.1034482759 0.1810344828 0.2327586207 
-
->SRD1_TRH1
-A 0.660646 0.061909 0.974138 0.12931 0.002351 0.04388 0.463939 0.244492
-C 0.08593 0.017162 0 0 0.993525 0.187352 0.295011 0.415463
-G 0.193842 0.903906 0 0.017241 0.001997 0.029952 0.127507 0.17543
-T 0.059583 0.017024 0.025862 0.853448 0.002128 0.738816 0.113544 0.164615
-
->STB4_TRH1
-G 0.0869565217 0 0 1 1 0 0.0108695652 
-A 0.0869565217 0 0 0 0 1 0.75 
-T 0.3913043478 1 0 0 0 0 0.2282608696 
-C 0.4347826087 0 1 0 0 0 0.0108695652 
-
->STB5_TRH1
-A 0.0046296296 0.0046296296 0.0046296296 0.2268518519 0.2268518519 0.1898148148 0.0601851852 0.9583333333
-C 0.9861111111 0.0046296296 0.0046296296 0.1898148148 0.2268518519 0.2453703704 0.1157407407 0.0138888889
-G 0.0046296296 0.9861111111 0.9861111111 0.2638888889 0.4675925926 0.1157407407 0.0601851852 0.0138888889
-T 0.0046296296 0.0046296296 0.0046296296 0.3194444444 0.0787037037 0.4490740741 0.7638888889 0.0138888889
-
->STE12_TRH1
-G 0.1944444444 0 1 0 0 0 0 0.1388888889
-A 0.4166666667 0 0 1 1 1 0 0.8055555556
-T 0.1944444444 1 0 0 0 0 0 0.0277777778
-C 0.1944444444 0 0 0 0 0 1 0.0277777778
-
->STP3_TRH1
-A 0.2489130435 0.1836956522 0.0010869565 0.9967391304 0.0010869565 0.0010869565 0.0010869565 0.0010869565 0.4489130435 
-C 0.0923913043 0.4184782609 0.0010869565 0.0010869565 0.0010869565 0.9967391304 0.0010869565 0.6445652174 0.1663043478 
-G 0.4793478261 0.2054347826 0.0010869565 0.0010869565 0.9967391304 0.0010869565 0.9967391304 0.175 0.1880434783 
-T 0.1793478261 0.1923913043 0.9967391304 0.0010869565 0.0010869565 0.0010869565 0.0010869565 0.1793478261 0.1967391304 
-
->STP4_TRH1
-A 0.18625 0.40125 0.00125 0.99625 0.00125 0.00125 0.00125 0.00125 0.54125 
-C 0.11125 0.28625 0.00125 0.00125 0.00125 0.99625 0.00125 0.73125 0.15125 
-G 0.55625 0.24125 0.00125 0.00125 0.99625 0.00125 0.99625 0.17125 0.16125 
-T 0.14625 0.07125 0.99625 0.00125 0.00125 0.00125 0.00125 0.09625 0.14625 
-
->SUM1_TRH1
-G 0.14 0.08 0.02 0 0 0 0 0.05 0.11 
-A 0.5 0.52 0.62 1 0 0.08 0.24 0.29 0.15 
-T 0.22 0.32 0.34 0 1 0.92 0.76 0.61 0.59 
-C 0.14 0.08 0.02 0 0 0 0 0.05 0.15 
-
->SWI4_TRH1
-G 0.1538461538 0 0.8461538462 0 1 0 0.0192307692 0.0769230769
-A 0.6153846154 0 0.1538461538 0 0 1 0.9423076923 0.6153846154
-T 0.1538461538 0 0 0 0 0 0.0192307692 0.2307692308
-C 0.0769230769 1 0 1 0 0 0.0192307692 0.0769230769
-
->SWI5_TRH1
-G 0.2307692308 1 0 0 1 1 0.2692307692 0.0961538462
-A 0.0769230769 0 0 0 0 0 0.0384615385 0.25
-T 0.6153846154 0 0 1 0 0 0.6538461538 0.4038461538
-C 0.0769230769 0 1 0 0 0 0.0384615385 0.25
-
->TBF1_TRH1
-A 0.608631 0.457553 0.14816 0 0 0 0.752237 0.380439
-C 0.11092 0.113679 0.838509 1 1 0.014085 0.083588 0.186065
-G 0.117262 0.349068 0.006819 0 0 0 0.110525 0.268113
-T 0.163187 0.0797 0.006512 0 0 0.985915 0.05365 0.165383
-
->TBS1_TRH1
-G 0.05 0.9 0.95 0.0833333333 0.1333333333 0 0 0.75
-A 0.1166666667 0.0333333333 0.0166666667 0.75 0.2 0 0 0.0833333333
-T 0.05 0.0333333333 0.0166666667 0.0833333333 0.5333333333 0 0 0.0833333333
-C 0.7833333333 0.0333333333 0.0166666667 0.0833333333 0.1333333333 1 1 0.0833333333
-
->TEA1_TRH1
-G 0.75 0 1 0.6 0.5 0.2 0.1 0.05
-A 0.05 0 0 0 0.5 0 0.6 0.15
-T 0.15 0 0 0 0 0 0.3 0.6
-C 0.05 1 0 0.4 0 0.8 0 0.2
-
->TEC1_TRH1
-G 0.3409090909 0.0454545455 0 0 0 0.0909090909 0 0.1477272727
-A 0.5227272727 0 1 0.0454545455 0 0 0 0.1022727273
-T 0.0681818182 0 0 0.9545454545 1 0 0.3181818182 0.2840909091
-C 0.0681818182 0.9545454545 0 0 0 0.9090909091 0.6818181818 0.4659090909
-
->TOS8_TRH1
-G 0.2019230769 0.0096153846 1 0 0 0 0.0673076923 0.1538461538
-A 0.2788461538 0.0096153846 0 0 0 1 0.6442307692 0.5
-T 0.0480769231 0.8173076923 0 1 0 0 0.2211538462 0.1923076923
-C 0.4711538462 0.1634615385 0 0 1 0 0.0673076923 0.1538461538
-
->TYE7_TRH1
-G 0.025 0 0 0.9 0 1 0.075 
-A 0.025 1 0 0 0 0 0.775 
-T 0.025 0 0 0 1 0 0.075 
-C 0.925 0 1 0.1 0 0 0.075 
-
->UGA3_TRH1
-G 0.2708333333 0.625 1 0 1 1 0.6875 0.0208333333
-A 0.1041666667 0.0416666667 0 0 0 0 0.0208333333 0.8541666667
-T 0.1875 0.0416666667 0 0 0 0 0.0208333333 0.1041666667
-C 0.4375 0.2916666667 0 1 0 0 0.2708333333 0.0208333333
-
->UME6_TRH1
-G 0.1875 0.21875 1 0 1 0.8125 0.078125 0.046875 0.1875 
-A 0.1875 0.09375 0 0 0 0 0.015625 0.421875 0.5625 
-T 0.1875 0.03125 0 0 0 0 0.390625 0.421875 0.125 
-C 0.4375 0.65625 0 1 0 0.1875 0.515625 0.109375 0.125 
-
->UPC2_TRH1
-A 0.156931 0.593216 0.378413 1 0 0.005119 0.828455 
-C 0.252915 0.027584 0.003065 0 1 0.004597 0.049279 
-G 0.19415 0.289317 0.00298 0 0 0.985719 0.085756 
-T 0.396005 0.089883 0.615543 0 0 0.004564 0.036511 
-
->XBP1_TRH1
-A 0.118605 0 0 0 1 0.397674 0.313953 
-C 0.506977 0 1 0 0 0.076744 0.22093 
-G 0.067442 0 0 1 0 0.497674 0.311628 
-T 0.306977 1 0 0 0 0.027907 0.153488 
-
->YAP3_TRH1
-G 0.1153846154 0 0 0 0 1 0.0192307692 0.1923076923
-A 0.6538461538 0 0 1 0 0 0.0192307692 0.5
-T 0.0384615385 1 1 0 0 0 0.9423076923 0.1923076923
-C 0.1923076923 0 0 0 1 0 0.0192307692 0.1153846154
-
->YBL054W_TRH1
-G 0.0227272727 1 0 0 1 0.3863636364 0.4090909091 0.2045454545
-A 0.0227272727 0 1 0 0 0.1136363636 0.0454545455 0.1136363636
-T 0.0227272727 0 0 1 0 0.0227272727 0.0454545455 0.1136363636
-C 0.9318181818 0 0 0 0 0.4772727273 0.5 0.5681818182
-
->YBR239C_TRH1
-G 0.2205882353 0.0588235294 0 1 1 0 0 0.0441176471
-A 0.5147058824 0.0588235294 0 0 0 1 1 0.0441176471
-T 0.1617647059 0.4117647059 0 0 0 0 0 0.2794117647
-C 0.1029411765 0.4705882353 1 0 0 0 0 0.6323529412
-
->YDR520c_TRH1
-A 0.2463235294 0.0012254902 0.0012254902 0.0012254902 0.7365196078 0.2267156863 0.5649509804 0.1433823529 0.9375 0.3639705882
-C 0.3786764706 0.9963235294 0.0012254902 0.0012254902 0.0943627451 0.1727941176 0.0012254902 0.0012254902 0.0600490196 0.1678921569
-G 0.1090686275 0.0012254902 0.9963235294 0.9963235294 0.1678921569 0.4620098039 0.0012254902 0.0012254902 0.0012254902 0.1482843137
-T 0.2659313725 0.0012254902 0.0012254902 0.0012254902 0.0012254902 0.1384803922 0.4325980392 0.8541666667 0.0012254902 0.3198529412
-
->YER130C_TRH1
-A 0.34715 0 0 0 0 0 0.601036 0.212435 0.321244 
-C 0.290155 0.974093 0.911917 1 1 0 0 0 0.290155 
-G 0.233161 0.005181 0 0 0 0 0.082902 0.036269 0.051813 
-T 0.129534 0.020725 0.088083 0 0 1 0.316062 0.751295 0.336788 
-
->YER184C_TRH1
-G 0.0576923077 0.0961538462 0.1538461538 0 1 1 0 0.2307692308
-A 0.2884615385 0.0192307692 0 0 0 0 0.6923076923 0.4615384615
-T 0.2884615385 0.7115384615 0.0769230769 0 0 0 0 0.1538461538
-C 0.3653846154 0.1730769231 0.7692307692 1 0 0 0.3076923077 0.1538461538
-
->YGR067C_TRH1
-A 0.358178 0 0 0 0.006211 0.407867 0 0.26501 0.229814 0.240166 0.252588 0.254658 0.219462 0.256729
-C 0.236025 1 0.987578 1 0.993789 0.004141 0.981366 0.26087 0.256729 0.258799 0.238095 0.219462 0.26087 0.238095
-G 0.269151 0 0 0 0 0.308489 0.008282 0.165631 0.202899 0.202899 0.252588 0.26087 0.256729 0.258799
-T 0.136646 0 0.012422 0 0 0.279503 0.010352 0.308489 0.310559 0.298137 0.256729 0.26501 0.26294 0.246377
-
->YJL103C_TRH1
-A 0.3933333333 0.26 0.1533333333 0.1233333333 0.02 0.0033333333 0.0033333333 0.05 0.58 0.26 0.3533333333 
-C 0.2066666667 0.2466666667 0.4333333333 0.2966666667 0.94 0.99 0.07 0.01 0.0733333333 0.1666666667 0.26 
-G 0.1933333333 0.2733333333 0.1666666667 0.0966666667 0.02 0.0033333333 0.9233333333 0.93 0.26 0.46 0.18 
-T 0.2066666667 0.22 0.2466666667 0.4833333333 0.02 0.0033333333 0.0033333333 0.01 0.0866666667 0.1133333333 0.2066666667 
-
->YKL222C_TRH1
-G 0.1458333333 0.1875 0 1 1 0.0833333333 0.4375 0.0625 0.1041666667 
-A 0.4791666667 0.6875 0 0 0 0.9166666667 0.5208333333 0.6458333333 0.1041666667 
-T 0.1458333333 0.0208333333 0 0 0 0 0.0208333333 0.2291666667 0.6875 
-C 0.2291666667 0.1041666667 1 0 0 0 0.0208333333 0.0625 0.1041666667 
-
->YLL054C_TRH1
-G 0 1 1 0.1428571429 0.1607142857 0.7678571429 0.0714285714 
-A 0 0 0 0.2142857143 0.0892857143 0.125 0.5714285714 
-T 0 0 0 0 0.0892857143 0.0535714286 0.2142857143 
-C 1 0 0 0.6428571429 0.6607142857 0.0535714286 0.1428571429 
-
->YLR278C_TRH1
-G 0.1339285714 0 1 1 0.0357142857 0.8214285714 0.0535714286 0.0535714286
-A 0.1339285714 0 0 0 0.9642857143 0.0357142857 0.2321428571 0.2678571429
-T 0.3125 0 0 0 0 0 0.6964285714 0.625
-C 0.4196428571 1 0 0 0 0.1428571429 0.0178571429 0.0535714286
-
->YML081W_TRH1
-A 0.315663 0 0 0 0 0.301205 0 0.436145 0.190361 
-C 0.240964 1 1 1 1 0 1 0.161446 0.349398 
-G 0.228916 0 0 0 0 0.356627 0 0.026506 0.146988 
-T 0.214458 0 0 0 0 0.342169 0 0.375904 0.313253 
-
->YNR063W_TRH1
-G 0.175 0 1 1 0 0.8 0 0.025
-A 0.075 0 0 0 1 0.1 0.9 0.325
-T 0.675 0 0 0 0 0.1 0.1 0.625
-C 0.075 1 0 0 0 0 0 0.025
-
->YOX1_TRH1
-G 0.0735294118 0 0 0 0 0 0.1470588235 0.1323529412
-A 0.0147058824 0 1 1 0 0 0.6176470588 0.5441176471
-T 0.6617647059 1 0 0 1 1 0.2058823529 0.1911764706
-C 0.25 0 0 0 0 0 0.0294117647 0.1323529412
-
->YPL230W_TRH1
-A 0.996835443 0.2035864979 0.0010548523 0.0010548523 0.0010548523 
-C 0.0010548523 0.0010548523 0.0010548523 0.0010548523 0.0010548523 
-G 0.0010548523 0.7943037975 0.996835443 0.996835443 0.996835443 
-T 0.0010548523 0.0010548523 0.0010548523 0.0010548523 0.0010548523 
-
->YPR013C_TRH1
-A 0.1122327791 0.0005938242 0.0932304038 0.6324228029 0.3996437055 0.9982185273 0.0005938242 0.0005938242 0.3616389549 
-C 0.3616389549 0.0005938242 0.2571258907 0.2618764846 0.0005938242 0.0005938242 0.0005938242 0.9982185273 0.2998812352 
-G 0.1122327791 0.9982185273 0.0005938242 0.0005938242 0.5991686461 0.0005938242 0.0005938242 0.0005938242 0.169239905 
-T 0.4138954869 0.0005938242 0.6490498812 0.1051068884 0.0005938242 0.0005938242 0.9982185273 0.0005938242 0.169239905 
-
->YPR022C_TRH1
-A 0.146245 0 0 0 1 0 0.225296 
-C 0.656126 1 1 1 0 1 0.256917 
-G 0 0 0 0 0 0 0.339921 
-T 0.197628 0 0 0 0 0 0.177866 
-
->YPR196W_TRH1
-A 0.608511 0.323404 0.170213 0.242553 0.170213 0.123404 0 0 0.025532 
-C 0 0 0 0.042553 0.438298 0.319149 0.92766 1 0 
-G 0.259574 0 0 0.021277 0.114894 0.068085 0.07234 0 0.92766 
-T 0.131915 0.676596 0.829787 0.693617 0.276596 0.489362 0 0 0.046809 
-
->YRM1_TRH1
-G 0.23 0.02 1 1 0 0.16 0.01 0.04
-A 0.51 0.02 0 0 1 0.6 0.93 0.12
-T 0.11 0.02 0 0 0 0.12 0.05 0.76
-C 0.15 0.94 0 0 0 0.12 0.01 0.08
-
->YRR1_TRH1
-A 0.208861 0.158228 0.221519 0.892405 0.189873 0.278481 0.037975 0 0 0.031646 0.063291 
-C 0.424051 0.158228 0.075949 0.006329 0.088608 0.329114 0.21519 1 1 0 0.411392 
-G 0.221519 0.101266 0.037975 0.018987 0.037975 0.075949 0.06962 0 0 0.949367 0.139241 
-T 0.14557 0.582278 0.664557 0.082278 0.683544 0.316456 0.677215 0 0 0.018987 0.386076 
-
->ZMS1_TRH1
-G 0.15 0.1125 0 0 0 0 0.5375 0.05 0.1 
-A 0.15 0.3125 0 0 0 0 0.1875 0.05 0.5 
-T 0.55 0.4625 0 0 0 0 0.2375 0.05 0.3 
-C 0.15 0.1125 1 1 1 1 0.0375 0.85 0.1 
-
->LEU3_DipChip_TRH1
-A 0.0001 0.0001 0.0001 0.2 0.2574257426 0.47 0.0001 0.0001 0.0001 0.0001
-C 0.9997 0.9997 0.0001 0.0001 0.3366336634 0.12 0.6098 0.9997 0.0001 0.32
-G 0.0001 0.0001 0.5698 0.35 0.0001 0.16 0.39 0.0001 0.9997 0.6798
-T 0.0001 0.0001 0.43 0.4499 0.4058405941 0.25 0.0001 0.0001 0.0001 0.0001
-
->RAP1_DipChip_TRH1
-T 0.0068 0.0068006801 0.2347234723 0.0068 0.0877 0.0215021502 0.6464353565 0.1392 0.0068 0.0068006801
-G 0.1219 0.00420042 0.00420042 0.0116 0.0042 0.2689268927 0.0777922208 0.1366 0.0042 0.00420042
-C 0.688 0.00420042 0.7542754275 0.9748 0.9013 0.00420042 0.1071892811 0.0042 0.9822 0.1292129213
-A 0.1833 0.9847984798 0.0068006801 0.0068 0.0068 0.7053705371 0.1685831417 0.72 0.0068 0.8597859786
-

SAMPLE_DATA/badis.pwm

+
+>ABF1_TRH1
+A 0.1081560284 0.0017730496 0.0017730496 0.0017730496 0.4060283688 0.2216312057 0.3918439716 0.3421985816 0.3989361702 0.4131205674 0.115248227 0.0017730496 0.9166666667 0.0017730496 0.3705673759 0.335106383
+C 0.4131205674 0.9875886525 0.0017730496 0.0017730496 0.1719858156 0.2358156028 0.1578014184 0.1790780142 0.2074468085 0.0017730496 0.25 0.0017730496 0.079787234 0.4485815603 0.2216312057 0.1790780142
+G 0.0372340426 0.0017730496 0.9946808511 0.0017730496 0.2216312057 0.2570921986 0.2783687943 0.2003546099 0.2429078014 0.5833333333 0.0868794326 0.8102836879 0.0017730496 0.0939716312 0.1790780142 0.1436170213
+T 0.4414893617 0.0088652482 0.0017730496 0.9946808511 0.2003546099 0.2854609929 0.1719858156 0.2783687943 0.1507092199 0.0017730496 0.5478723404 0.1861702128 0.0017730496 0.4556737589 0.2287234043 0.3421985816
+
+>ABF2_TRH1
+G 0.25 0.0178571429 0 0 0 1 0.0178571429 
+A 0.1785714286 0.0892857143 0 0 1 0 0.9464285714 
+T 0.1785714286 0.8035714286 0 1 0 0 0.0178571429 
+C 0.3928571429 0.0892857143 1 0 0 0 0.0178571429 
+
+>ACE2_TRH1
+A 0.445114 0.00686 0 0.897196 0 0 0.489557 
+C 0.287353 0.924112 1 0.102804 0 1 0.2005 
+G 0.214361 0.063312 0 0 1 0 0.174565 
+T 0.053172 0.005716 0 0 0 0 0.135378 
+
+>ADR1_v1_TRH1
+A 0.406675 0.001273 0 0 0 0.642138 0.341301 
+C 0.24165 0.996308 0.853403 1 1 0.059809 0.505578 
+G 0.13067 0.001304 0 0 0 0.202811 0.059999 
+T 0.221005 0.001114 0.146597 0 0 0.095242 0.093123 
+
+>ADR1_v2_TRH1
+G 0.1428571429 0.0595238095 0 0 0 0 0.2857142857 0.0476190476
+A 0.1904761905 0.7261904762 0 0 0 0 0.7142857143 0.2380952381
+T 0.5238095238 0.1547619048 0 0 0 0 0 0.0476190476
+C 0.1428571429 0.0595238095 1 1 1 1 0 0.6666666667
+
+>AFT2_TRH1
+G 0.2651515152 0.303030303 0 0 0 0 0 0.2727272727
+A 0.0833333333 0.696969697 0 1 0 0 0 0.0909090909
+T 0.2045454545 0 0 0 0 0 0 0.2121212121
+C 0.446969697 0 1 0 1 1 1 0.4242424242
+
+>ASG1_TRH1
+A 0.001396648 0.001396648 0.001396648 0.001396648 0.7220670391 0.5265363128
+C 0.7555865922 0.9958100559 0.001396648 0.001396648 0.1131284916 0.001396648
+G 0.001396648 0.001396648 0.9958100559 0.9958100559 0.1634078212 0.001396648
+T 0.2416201117 0.001396648 0.001396648 0.001396648 0.001396648 0.4706703911
+
+>AZF1_TRH1
+G 0.125 0 0 0 0.25 1 0.03125 0.0625 0.125 
+A 0.625 1 1 0.875 0.75 0 0.78125 0.8125 0.625 
+T 0.125 0 0 0 0 0 0.03125 0.0625 0.125 
+C 0.125 0 0 0.125 0 0 0.15625 0.0625 0.125 
+
+>CAT8_TRH1
+A 0.0016339869 0.0016339869 0.0016339869 0.0016339869 0.6617647059 0.3153594771
+C 0.9950980392 0.9950980392 0.0016339869 0.0016339869 0.1258169935 0.1781045752
+G 0.0016339869 0.0016339869 0.9950980392 0.9950980392 0.2107843137 0.2826797386
+T 0.0016339869 0.0016339869 0.0016339869 0.0016339869 0.0016339869 0.2238562092
+
+>CBF1_TRH1
+G 0.5277777778 0.0277777778 0 0 1 0 1 0.0555555556
+A 0.1944444444 0.0277777778 1 0 0 0 0 0.7222222222
+T 0.1944444444 0.0277777778 0 0 0 1 0 0.0555555556
+C 0.0833333333 0.9166666667 0 1 0 0 0 0.1666666667
+
+>CEP3_TRH1
+G 0.0394736842 0 0 1 1 0.0131578947 0.0263157895 0.2105263158
+A 0.0394736842 0 0 0 0 0.9078947368 0.9210526316 0.4210526316
+T 0.3552631579 1 0 0 0 0.0657894737 0.0263157895 0.1578947368
+C 0.5657894737 0 1 0 0 0.0131578947 0.0263157895 0.2105263158
+
+>CHA4_TRH1
+G 0.6770833333 1 0 1 1 0.2916666667 0.7604166667 0.1041666667
+A 0.21875 0 0 0 0 0.7083333333 0.21875 0.4791666667
+T 0.0520833333 0 0 0 0 0 0.0104166667 0.3125
+C 0.0520833333 0 1 0 0 0 0.0104166667 0.1041666667
+
+>CIN5_TRH1
+A 0.0014880952 0.1324404762 0.9955357143 0.1086309524 0.1979166667 0.0014880952 0.90625 0.9955357143 0.0193452381 0.150297619
+C 0.0014880952 0.0729166667 0.0014880952 0.537202381 0.15625 0.0014880952 0.0907738095 0.0014880952 0.1383928571 0.6979166667
+G 0.0907738095 0.2276785714 0.0014880952 0.0491071429 0.5788690476 0.0014880952 0.0014880952 0.0014880952 0.3764880952 0.0848214286
+T 0.90625 0.5669642857 0.0014880952 0.3050595238 0.0669642857 0.9955357143 0.0014880952 0.0014880952 0.4657738095 0.0669642857
+
+>CRZ1_TRH1
+A 0.201556 0.286035 0.366874 0.631234 0 0 0.003117 0.421755 0.074807 
+C 0.477983 0.21704 0.30201 0.356441 0 1 0.99072 0.295015 0.76413 
+G 0.177801 0.172824 0.221151 0.006838 1 0 0.003419 0.071026 0.082062 
+T 0.14266 0.324101 0.109965 0.005487 0 0 0.002743 0.212205 0.079001 
+
+>CST6_TRH1
+G 0.3157894737 0.0131578947 0.9078947368 0 0 0.9473684211 0 0.0789473684 0.1973684211 
+A 0.4736842105 0.0131578947 0.0131578947 1 0 0.0526315789 0 0.4473684211 0.4605263158 
+T 0.1052631579 0.9605263158 0.0657894737 0 0 0 1 0.1842105263 0.1973684211 
+C 0.1052631579 0.0131578947 0.0131578947 0 1 0 0 0.2894736842 0.1447368421 
+
+>CUP9_TRH1
+A 0.074627 0 0.835821 0.014925 0.910448 0 0.746269 0.402985 0.38806 
+C 0.104478 0 0 0.985075 0 0.641791 0.149254 0 0.134328 
+G 0.029851 1 0.089552 0 0.089552 0.089552 0 0 0.029851 
+T 0.791045 0 0.074627 0 0 0.268657 0.104478 0.597015 0.447761 
+
+>DAL80_TRH1
+G 0.0555555556 1 0 0 0 0.0138888889 0.75 
+A 0.1111111111 0 1 0 1 0.9027777778 0.0277777778 
+T 0.1666666667 0 0 1 0 0.0694444444 0.0277777778 
+C 0.6666666667 0 0 0 0 0.0138888889 0.1944444444 
+
+>DAL82_TRH1
+G 0.1447368421 0.0526315789 0.0263157895 0.4210526316 0 1 0 1 0.1052631579 
+A 0.5657894737 0.5263157895 0.3947368421 0.2631578947 0 0 0 0 0.1052631579 
+T 0.1447368421 0.3157894737 0.5526315789 0.2105263158 0.7368421053 0 0 0 0.1052631579 
+C 0.1447368421 0.1052631579 0.0263157895 0.1052631579 0.2631578947 0 1 0 0.6842105263 
+
+>DOT6_TRH1
+A 0.2504340278 0.0004340278 0.9986979167 0.0004340278 0.0004340278 
+C 0.42578125 0.0004340278 0.0004340278 0.0004340278 0.0004340278 
+G 0.0993923611 0.9986979167 0.0004340278 0.0004340278 0.9986979167 
+T 0.2243923611 0.0004340278 0.0004340278 0.9986979167 0.0004340278 
+
+>ECM22_TRH1
+G 0.0714285714 0.0714285714 0 0 0.8571428571 0.8571428571 0.0714285714 
+A 0.2857142857 0.1428571429 0 0 0 0 0.9285714286 
+T 0.2857142857 0.7142857143 0 0 0 0.1428571429 0 
+C 0.3571428571 0.0714285714 1 1 0.1428571429 0 0 
+
+>ECM23_TRH1
+A 0.3076241135 0.3342198582 0.7216312057 0.0984042553 0.9973404255 0.0257092199 0.0088652482 0.1409574468 0.3014184397 0.3173758865 0.3023049645 
+C 0.2544326241 0.2491134752 0.1081560284 0.0203900709 0.0008865248 0.0008865248 0.8953900709 0.1870567376 0.2304964539 0.25 0.259751773 
+G 0.2296099291 0.2171985816 0.0975177305 0.8643617021 0.0008865248 0.0008865248 0.030141844 0.1409574468 0.2127659574 0.2464539007 0.2242907801 
+T 0.2083333333 0.1994680851 0.0726950355 0.0168439716 0.0008865248 0.9725177305 0.0656028369 0.5310283688 0.2553191489 0.1861702128 0.2136524823 
+
+>EDS1_TRH1
+G 0.1428571429 1 1 0 0 0.0952380952 0 0.0119047619 0.1071428571 
+A 0.1428571429 0 0 1 0.7619047619 0.4761904762 1 0.8214285714 0.1547619048 
+T 0.1904761905 0 0 0 0.2380952381 0.1904761905 0 0.1547619048 0.5357142857 
+C 0.5238095238 0 0 0 0 0.2380952381 0 0.0119047619 0.2023809524 
+
+>FHL1_TRH1
+G 0.9 0 0 1 0 0 0.175 0.15
+A 0 1 0 0 0 0.9 0.475 0.55
+T 0 0 0 0 0 0.1 0.075 0.15
+C 0.1 0 1 0 1 0 0.275 0.15
+
+>FKH2_TRH1
+G 0.875 0 0 0 0 0 0 
+A 0.125 0 1 1 1 0 1 
+T 0 1 0 0 0 0 0 
+C 0 0 0 0 0 1 0 
+
+>FZF1_TRH1
+G 0 0 0 0 0 0
+A 0 0 1 0 0 1
+T 0 1 0 1 0 0
+C 1 0 0 0 1 0
+
+>GAT1_TRH1
+G 0.1875 0.046875 1 0 0 0 0 0.84375
+A 0.125 0.171875 0 1 0 1 1 0.03125
+T 0.25 0.359375 0 0 1 0 0 0.03125
+C 0.4375 0.421875 0 0 0 0 0 0.09375
+
+>GAT3_TRH1
+A 0.6476608187 0.0847953216 0.9195906433 0.1198830409 0.0292397661 0.0599415205 0.514619883 0.283625731 0.3230994152 
+C 0.0862573099 0.0204678363 0.0014619883 0.0029239766 0.9415204678 0.2704678363 0.1871345029 0.3304093567 0.2529239766 
+G 0.2032163743 0.8801169591 0.0014619883 0.0087719298 0.0116959064 0.0423976608 0.1812865497 0.2134502924 0.2119883041 
+T 0.0628654971 0.014619883 0.0774853801 0.8684210526 0.0175438596 0.6271929825 0.1169590643 0.1725146199 0.2119883041 
+
+>GAT4_TRH1
+A 0.3552631579 0.3092105263 0.8026315789 0.0296052632 0.9769736842 0.0032894737 0.0032894737 0.0460526316 0.3980263158 0.2861842105 0.3322368421 
+C 0.2105263158 0.2565789474 0.0394736842 0.0032894737 0.0032894737 0.0032894737 0.9901315789 0.2828947368 0.2006578947 0.2598684211 0.2401315789 
+G 0.2368421053 0.1776315789 0.1184210526 0.9638157895 0.0032894737 0.0032894737 0.0032894737 0.0328947368 0.2269736842 0.2335526316 0.2138157895 
+T 0.1973684211 0.2565789474 0.0394736842 0.0032894737 0.0164473684 0.9901315789 0.0032894737 0.6381578947 0.1743421053 0.2203947368 0.2138157895 
+
+>GIS1_TRH1
+A 0.408313 0 0 0 0 0 0.486553 0.459658 0.322738 
+C 0.215159 0.97066 1 1 0.872861 0 0.04401 0.110024 0.193154 
+G 0.124694 0 0 0 0 0 0.151589 0.156479 0.183374 
+T 0.251834 0.02934 0 0 0.127139 1 0.317848 0.273839 0.300733 
+
+>GLN3_TRH1
+A 0.0004537205 0.9986388385 0.0004537205 0.7427404719 0.6138838475 
+C 0.0004537205 0.0004537205 0.0004537205 0.0004537205 0.0004537205 
+G 0.9986388385 0.0004537205 0.0004537205 0.0004537205 0.2690562613 
+T 0.0004537205 0.0004537205 0.9986388385 0.2563520871 0.1166061706 
+
+>GZF3_TRH1
+A 0.178571 0 1 0 1 0.732143 0.035714 0.392857
+C 0.392857 0 0 0 0 0.089286 0.375 0.178571
+G 0.017857 1 0 0 0 0 0.589286 0.267857
+T 0.410714 0 0 1 0 0.178571 0 0.160714
+
+>HAC1_TRH1
+G 0.5568181818 0 0 0 0 1 0 0.4090909091
+A 0.2386363636 0.6818181818 0 1 0 0 0 0.2727272727
+T 0.1477272727 0 0 0 0 0 1 0.1363636364
+C 0.0568181818 0.3181818182 1 0 1 0 0 0.1818181818
+
+>HAL9_TRH1
+A 0.0036764706 0.0036764706 0.0036764706 0.9889705882 0.6213235294 
+C 0.9889705882 0.0036764706 0.0036764706 0.0036764706 0.0036764706 
+G 0.0036764706 0.9889705882 0.9889705882 0.0036764706 0.3713235294 
+T 0.0036764706 0.0036764706 0.0036764706 0.0036764706 0.0036764706 
+
+>HAP1_TRH1
+G 0 1 1 0.1052631579 0.5263157895 0.0394736842 0.0394736842 0.1052631579
+A 0 0 0 0.8947368421 0.0526315789 0.5131578947 0.0394736842 0.5789473684
+T 0 0 0 0 0.1578947368 0.4078947368 0.8815789474 0.2105263158
+C 1 0 0 0 0.2631578947 0.0394736842 0.0394736842 0.1052631579
+
+>HCM1_TRH1
+A 0.513075 0.272549 0.670105 0.946809 1 0.007021 0.950104 0.580307
+C 0.160895 0.07678 0.315845 0.053191 0 0.855953 0.017114 0.170674
+G 0.248858 0.041351 0.006581 0 0 0.004388 0.015356 0.108697
+T 0.077172 0.60932 0.007468 0 0 0.132638 0.017426 0.140321
+
+>HMRA2_TRH1
+G 0.0625 0.4642857143 0 1 0 0 0.0178571429 0.0803571429
+A 0.0625 0.5357142857 0.0357142857 0 0 0.9285714286 0.875 0.4017857143
+T 0.2053571429 0 0.9642857143 0 1 0.0714285714 0.0892857143 0.4375
+C 0.6696428571 0 0 0 0 0 0.0178571429 0.0803571429
+
+>HSF1_TRH1
+G 0.125 0.015625 0.8125 1 0 0 0.1875 0.234375
+A 0.6875 0.015625 0.1875 0 1 1 0.0625 0.484375
+T 0.0625 0.953125 0 0 0 0 0.1875 0.171875
+C 0.125 0.015625 0 0 0 0 0.5625 0.109375
+
+>LYS14_TRH1
+G 0.2083333333 0.0972222222 1 1 0 0 0 0.0694444444
+A 0.2083333333 0.0416666667 0 0 1 1 0.0555555556 0.125
+T 0.0972222222 0.0416666667 0 0 0 0 0.9444444444 0.6805555556
+C 0.4861111111 0.8194444444 0 0 0 0 0 0.125
+
+>MBP1_TRH1
+A 0.548894 0.001401 0.148289 0 0.002335 0.349175 0.329496 
+C 0.095864 0.995872 0 0.878327 0.017835 0.172992 0.304358 
+G 0.182402 0.001506 0.851711 0 0.977795 0.091376 0.184759 
+T 0.17284 0.001221 0 0.121673 0.002036 0.386457 0.181387 
+
+>MET31_TRH1
+A 0.3757668712 0.2039877301 0.1365030675 0.0015337423 0.0015337423 0.0015337423 0.0015337423 0.0015337423 0.0996932515 
+C 0.0996932515 0.2898773006 0.1365030675 0.0015337423 0.0015337423 0.0015337423 0.0015337423 0.995398773 0.0015337423 
+G 0.3757668712 0.3021472393 0.1794478528 0.995398773 0.0015337423 0.995398773 0.995398773 0.0015337423 0.6947852761 
+T 0.1487730061 0.2039877301 0.5475460123 0.0015337423 0.995398773 0.0015337423 0.0015337423 0.0015337423 0.2039877301 
+
+>MET32_TRH1
+A 0.336119 0.107714 0.002152 0 0.931034 0.002152 0.635703 
+C 0.464981 0.051456 0.993823 1 0.034483 0.985203 0.151037 
+G 0.095446 0.771861 0.002177 0 0 0.002177 0.119043 
+T 0.103455 0.068969 0.001848 0 0.034483 0.010468 0.094217 
+
+>MIG1_TRH1
+A 0.320756 0.010083 0 0 0 0.460255 0.047056 
+C 0.35371 0.969378 1 1 1 0.033741 0.583022 
+G 0.146057 0.011618 0 0 0 0.498571 0.298663 
+T 0.179476 0.008921 0 0 0 0.007434 0.071259 
+
+>MIG2_TRH1
+A 0.014293 0 0 0 0.359426 0.045604 0.361456 
+C 0.957087 1 1 1 0.107529 0.765758 0.242841 
+G 0.016223 0 0 0 0.520648 0.130212 0.241668 
+T 0.012397 0 0 0 0.012397 0.058427 0.154035 
+
+>MIG3_TRH1
+A 0.007957 0 0 0 0.412465 0.053707 0.40516 
+C 0.975933 0.939655 1 1 0.020831 0.690994 0.221607 
+G 0.009135 0 0 0 0.552753 0.165111 0.230826 
+T 0.006976 0.060345 0 0 0.013951 0.090188 0.142406 
+
+>MSN2_TRH1
+A 0.6030120482 0.0006024096 0.0006024096 0.0006024096 0.0006024096 
+C 0.0728915663 0.0006024096 0.0006024096 0.0006024096 0.0006024096 
+G 0.3234939759 0.9981927711 0.9981927711 0.9981927711 0.9981927711 
+T 0.0006024096 0.0006024096 0.0006024096 0.0006024096 0.0006024096 
+
+>MSN4_TRH1
+A 0.8311965812 0.0021367521 0.0021367521 0.0021367521 0.0021367521 
+C 0.0021367521 0.0021367521 0.0021367521 0.0021367521 0.0021367521 
+G 0.1645299145 0.9935897436 0.9935897436 0.9935897436 0.985042735 
+T 0.0021367521 0.0021367521 0.0021367521 0.0021367521 0.0106837607 
+
+>NHP10_TRH1
+G 0.6 0.075 0 1 1 1 1 0.175
+A 0.2 0.075 0 0 0 0 0 0.675
+T 0.1 0.075 0 0 0 0 0 0.075
+C 0.1 0.775 1 0 0 0 0 0.075
+
+>OAF1_TRH1
+G 0.1071428571 0 1 1 0.4285714286 0.8571428571 0.0357142857 0.0714285714 0.1428571429 
+A 0.1071428571 0 0 0 0.5714285714 0.0714285714 0.6785714286 0.1428571429 0.5714285714 
+T 0.4642857143 0 0 0 0 0.0714285714 0.25 0.7142857143 0.1428571429 
+C 0.3214285714 1 0 0 0 0 0.0357142857 0.0714285714 0.1428571429 
+
+>PDR1_TRH1
+G 0.15 0 0 0.8666666667 0.0833333333 0.8833333333 0.8333333333 0.2166666667
+A 0.0833333333 0 0 0.1333333333 0.0166666667 0.0833333333 0.1 0.6166666667
+T 0.4833333333 0 0 0 0.0166666667 0.0166666667 0.0333333333 0.0833333333
+C 0.2833333333 1 1 0 0.8833333333 0.0166666667 0.0333333333 0.0833333333
+
+>PDR8_TRH1
+G 0.3846153846 0 1 1 0 0.8461538462 0 0.0576923077
+A 0.3846153846 0 0 0 1 0.0769230769 1 0.1346153846
+T 0.0769230769 0 0 0 0 0 0 0.75
+C 0.1538461538 1 0 0 0 0.0769230769 0 0.0576923077
+
+>PHD1_TRH1
+A 0.3582677165 0.094488189 0.374015748 0.0039370079 0.0019685039 0.0019685039 0.9114173228 0.0787401575 0.2165354331 0.3228346457
+C 0.2716535433 0.4330708661 0.4448818898 0.0984251969 0.0019685039 0.9862204724 0.0059055118 0.2204724409 0.4212598425 0.2755905512
+G 0.1929133858 0.3937007874 0.1535433071 0.0039370079 0.9940944882 0.0019685039 0.0688976378 0.3622047244 0.2244094488 0.2125984252
+T 0.1771653543 0.0787401575 0.0275590551 0.8937007874 0.0019685039 0.0098425197 0.0137795276 0.3385826772 0.1377952756 0.188976378
+
+>PHO2_TRH1
+A 0.51640625 0.11640625 0.99765625 0.56328125 0.22890625 0.62890625
+C 0.00078125 0.00078125 0.00078125 0.00078125 0.00078125 0.00078125
+G 0.07578125 0.00078125 0.00078125 0.00078125 0.00078125 0.00078125
+T 0.40703125 0.88203125 0.00078125 0.43515625 0.76953125 0.36953125
+
+>PHO4_TRH1
+A 0.0659090909 0.0568181818 0.3840909091 0.0022727273 0.275 0.0022727273 0.0204545455 
+C 0.0295454545 0.7295454545 0.0568181818 0.7022727273 0.0022727273 0.4386363636 0.0022727273 
+G 0.9022727273 0.0295454545 0.5568181818 0.0022727273 0.7204545455 0.0840909091 0.9113636364 
+T 0.0022727273 0.1840909091 0.0022727273 0.2931818182 0.0022727273 0.475 0.0659090909 
+
+>PUT3_TRH1
+G 0.09375 0.0208333333 0 1 1 1 0.1875 0.1666666667
+A 0.09375 0.0208333333 0 0 0 0 0.5208333333 0.4583333333
+T 0.09375 0.0625 0 0 0 0 0.1458333333 0.25
+C 0.71875 0.8958333333 1 0 0 0 0.1458333333 0.125
+
+>RDR1_TRH1
+G 0.1071428571 1 0 1 1 0 0 0.125
+A 0.25 0 0 0 0 1 0.8571428571 0.2678571429
+T 0.5357142857 0 0 0 0 0 0.1428571429 0.125
+C 0.1071428571 0 1 0 0 0 0 0.4821428571
+
+>RDS1_TRH1
+G 0.0131578947 0.8947368421 1 0.1578947368 0.0526315789 0.8947368421 0.3157894737 
+A 0.0131578947 0 0 0 0 0 0.3157894737 
+T 0.0657894737 0 0 0 0 0 0.0526315789 
+C 0.9078947368 0.1052631579 0 0.8421052632 0.9473684211 0.1052631579 0.3157894737 
+
+>RDS2_TRH1
+G 0.1842105263 0 0 1 1 0.8552631579 0.6973684211 
+A 0.3421052632 0 0 0 0 0.1184210526 0.1710526316 
+T 0.0789473684 1 0 0 0 0.0131578947 0.0657894737 
+C 0.3947368421 0 1 0 0 0.0131578947 0.0657894737 
+
+>REB1_TRH1_flipped
+C 0.1 0 0 0 1 1 1 0 0.15 
+T 0.1 1 1 0 0 0 0 0.4 0.15 
+A 0.3 0 0 1 0 0 0 0 0.15 
+G 0.5 0 0 0 0 0 0 0.6 0.55 
+
+>REI1_TRH1
+G 0 0 0 0 0 0.9523809524 0.2261904762 
+A 0 0.0476190476 0 0 0 0 0.5595238095 
+T 0.0476190476 0 0 0 1 0.0476190476 0.130952381 
+C 0.9523809524 0.9523809524 1 1 0 0 0.0833333333 
+
+>RFX1_TRH1
+G 0.4230769231 1 0 0 0.6923076923 0 0.0192307692 0.0384615385
+A 0.1153846154 0 0 0 0.3076923077 0 0.0192307692 0.8846153846
+T 0.1923076923 0 1 1 0 0 0.4807692308 0.0384615385
+C 0.2692307692 0 0 0 0 1 0.4807692308 0.0384615385
+
+>RGM1_TRH1
+A 0.997148289 0.0009505703 0.0009505703 0.0009505703 0.11121673 
+C 0.0009505703 0.0009505703 0.0009505703 0.0009505703 0.1188212928 
+G 0.0009505703 0.997148289 0.997148289 0.997148289 0.7690114068 
+T 0.0009505703 0.0009505703 0.0009505703 0.0009505703 0.0009505703 
+
+>RGT1_TRH1
+A 0.421687 0.337349 0.373494 0.216867 0.26506 0.295181 0 0 0 0.036145 0.319277 
+C 0.13253 0.096386 0 0.018072 0.150602 0.180723 0.120482 1 1 0 0.126506 
+G 0.228916 0.343373 0 0 0.174699 0.042169 0 0 0 0.885542 0.331325 
+T 0.216867 0.222892 0.626506 0.76506 0.409639 0.481928 0.879518 0 0 0.078313 0.222892 
+
+>RIM101_TRH1
+G 0.09375 1 0 0 0 0 1 
+A 0.09375 0 0 0 1 1 0 
+T 0.3854166667 0 0 0 0 0 0 
+C 0.4270833333 0 1 1 0 0 0 
+
+>ROX1_TRH1
+A 0.3440054496 0.3549046322 0.3658038147 0.9979564033 0.0006811989 0.9979564033 0.9979564033 0.0006811989
+C 0.1805177112 0.1532697548 0.1914168937 0.0006811989 0.9979564033 0.0006811989 0.0006811989 0.0006811989
+G 0.2404632153 0.2295640327 0.2213896458 0.0006811989 0.0006811989 0.0006811989 0.0006811989 0.0006811989
+T 0.235013624 0.2622615804 0.2213896458 0.0006811989 0.0006811989 0.0006811989 0.0006811989 0.9979564033
+
+>RPH1_TRH1
+G 0.1388888889 0 0 0 0 0 0.0694444444 0.0694444444
+A 0.5277777778 0 0 0 0 0 0.625 0.7361111111
+T 0.1944444444 0 0 0 0 1 0.2916666667 0.125
+C 0.1388888889 1 1 1 1 0 0.0138888889 0.0694444444
+
+>RPN4_TRH1
+A 0.2319078947 0.0016447368 0.0016447368 0.0016447368 0.0016447368 0.0016447368 0.1266447368 
+C 0.0016447368 0.0016447368 0.0016447368 0.0016447368 0.0016447368 0.9950657895 0.0016447368 
+G 0.6726973684 0.9950657895 0.1200657895 0.9950657895 0.9950657895 0.0016447368 0.8700657895 
+T 0.09375 0.0016447368 0.8766447368 0.0016447368 0.0016447368 0.0016447368 0.0016447368 
+
+>RSC3_TRH1
+A 0.0017482517 0.0017482517 0.0017482517 0.0017482517 0.0646853147 0.1905594406 0.2255244755 
+C 0.9108391608 0.0017482517 0.9947552448 0.0017482517 0.5472027972 0.3024475524 0.2604895105 
+G 0.0506993007 0.9947552448 0.0017482517 0.9947552448 0.1835664336 0.3653846154 0.3374125874 
+T 0.0367132867 0.0017482517 0.0017482517 0.0017482517 0.2045454545 0.1416083916 0.1765734266 
+
+>RSC30_TRH1
+G 0.1923076923 0.4615384615 0.0769230769 0.9230769231 0.0769230769 1 0.1538461538 0.6923076923
+A 0.1923076923 0.1538461538 0 0 0 0 0 0
+T 0.1153846154 0 0 0 0 0 0 0
+C 0.5 0.3846153846 0.9230769231 0.0769230769 0.9230769231 0 0.8461538462 0.3076923077
+
+>SIG1_TRH1
+A 0.9301470588 0.0036764706 0.9889705882 0.0036764706 0.9889705882 
+C 0.0183823529 0.0036764706 0.0036764706 0.0036764706 0.0036764706 
+G 0.0036764706 0.0036764706 0.0036764706 0.0036764706 0.0036764706 
+T 0.0477941176 0.9889705882 0.0036764706 0.9889705882 0.0036764706 
+
+>SIP4_TRH1
+A 0.075949 0 0 0 0 0.227848 0.582278 
+C 0.481013 0.265823 0.987342 1 0 0 0.164557 
+G 0.126582 0 0 0 1 0.632911 0.253165 
+T 0.316456 0.734177 0.012658 0 0 0.139241 0 
+
+>SKN7_TRH1
+A 0.0009615385 0.0009615385 0.0009615385 0.0009615385 0.4855769231 0.2086538462
+C 0.0009615385 0.0009615385 0.9971153846 0.8355769231 0.1471153846 0.1778846154
+G 0.9971153846 0.9971153846 0.0009615385 0.1625 0.3663461538 0.2932692308
+T 0.0009615385 0.0009615385 0.0009615385 0.0009615385 0.0009615385 0.3201923077
+
+>SOK2_TRH1
+A 0.5 0.1465517241 0.4051724138 0.0431034483 0.0431034483 0.0431034483 0.974137931 0.0517241379 0.1724137931 0.2844827586 0.3017241379 
+C 0.1896551724 0.4913793103 0.474137931 0.0086206897 0.0086206897 0.9051724138 0.0086206897 0.0517241379 0.2068965517 0.3189655172 0.2327586207 
+G 0.1551724138 0.1810344828 0.0948275862 0.0431034483 0.9396551724 0.0086206897 0.0086206897 0.5 0.5172413793 0.2155172414 0.2327586207 
+T 0.1551724138 0.1810344828 0.025862069 0.9051724138 0.0086206897 0.0431034483 0.0086206897 0.3965517241 0.1034482759 0.1810344828 0.2327586207 
+
+>SRD1_TRH1
+A 0.660646 0.061909 0.974138 0.12931 0.002351 0.04388 0.463939 0.244492
+C 0.08593 0.017162 0 0 0.993525 0.187352 0.295011 0.415463
+G 0.193842 0.903906 0 0.017241 0.001997 0.029952 0.127507 0.17543
+T 0.059583 0.017024 0.025862 0.853448 0.002128 0.738816 0.113544 0.164615
+
+>STB4_TRH1
+G 0.0869565217 0 0 1 1 0 0.0108695652 
+A 0.0869565217 0 0 0 0 1 0.75 
+T 0.3913043478 1 0 0 0 0 0.2282608696 
+C 0.4347826087 0 1 0 0 0 0.0108695652 
+
+>STB5_TRH1
+A 0.0046296296 0.0046296296 0.0046296296 0.2268518519 0.2268518519 0.1898148148 0.0601851852 0.9583333333
+C 0.9861111111 0.0046296296 0.0046296296 0.1898148148 0.2268518519 0.2453703704 0.1157407407 0.0138888889
+G 0.0046296296 0.9861111111 0.9861111111 0.2638888889 0.4675925926 0.1157407407 0.0601851852 0.0138888889
+T 0.0046296296 0.0046296296 0.0046296296 0.3194444444 0.0787037037 0.4490740741 0.7638888889 0.0138888889
+
+>STE12_TRH1
+G 0.1944444444 0 1 0 0 0 0 0.1388888889
+A 0.4166666667 0 0 1 1 1 0 0.8055555556
+T 0.1944444444 1 0 0 0 0 0 0.0277777778
+C 0.1944444444 0 0 0 0 0 1 0.0277777778
+
+>STP3_TRH1
+A 0.2489130435 0.1836956522 0.0010869565 0.9967391304 0.0010869565 0.0010869565 0.0010869565 0.0010869565 0.4489130435 
+C 0.0923913043 0.4184782609 0.0010869565 0.0010869565 0.0010869565 0.9967391304 0.0010869565 0.6445652174 0.1663043478 
+G 0.4793478261 0.2054347826 0.0010869565 0.0010869565 0.9967391304 0.0010869565 0.9967391304 0.175 0.1880434783 
+T 0.1793478261 0.1923913043 0.9967391304 0.0010869565 0.0010869565 0.0010869565 0.0010869565 0.1793478261 0.1967391304 
+
+>STP4_TRH1
+A 0.18625 0.40125 0.00125 0.99625 0.00125 0.00125 0.00125 0.00125 0.54125 
+C 0.11125 0.28625 0.00125 0.00125 0.00125 0.99625 0.00125 0.73125 0.15125 
+G 0.55625 0.24125 0.00125 0.00125 0.99625 0.00125 0.99625 0.17125 0.16125 
+T 0.14625 0.07125 0.99625 0.00125 0.00125 0.00125 0.00125 0.09625 0.14625 
+
+>SUM1_TRH1
+G 0.14 0.08 0.02 0 0 0 0 0.05 0.11 
+A 0.5 0.52 0.62 1 0 0.08 0.24 0.29 0.15 
+T 0.22 0.32 0.34 0 1 0.92 0.76 0.61 0.59 
+C 0.14 0.08 0.02 0 0 0 0 0.05 0.15 
+
+>SWI4_TRH1
+G 0.1538461538 0 0.8461538462 0 1 0 0.0192307692 0.0769230769
+A 0.6153846154 0 0.1538461538 0 0 1 0.9423076923 0.6153846154
+T 0.1538461538 0 0 0 0 0 0.0192307692 0.2307692308
+C 0.0769230769 1 0 1 0 0 0.0192307692 0.0769230769
+
+>SWI5_TRH1
+G 0.2307692308 1 0 0 1 1 0.2692307692 0.0961538462
+A 0.0769230769 0 0 0 0 0 0.0384615385 0.25
+T 0.6153846154 0 0 1 0 0 0.6538461538 0.4038461538
+C 0.0769230769 0 1 0 0 0 0.0384615385 0.25
+
+>TBF1_TRH1
+A 0.608631 0.457553 0.14816 0 0 0 0.752237 0.380439
+C 0.11092 0.113679 0.838509 1 1 0.014085 0.083588 0.186065
+G 0.117262 0.349068 0.006819 0 0 0 0.110525 0.268113
+T 0.163187 0.0797 0.006512 0 0 0.985915 0.05365 0.165383
+
+>TBS1_TRH1
+G 0.05 0.9 0.95 0.0833333333 0.1333333333 0 0 0.75
+A 0.1166666667 0.0333333333 0.0166666667 0.75 0.2 0 0 0.0833333333
+T 0.05 0.0333333333 0.0166666667 0.0833333333 0.5333333333 0 0 0.0833333333
+C 0.7833333333 0.0333333333 0.0166666667 0.0833333333 0.1333333333 1 1 0.0833333333
+
+>TEA1_TRH1
+G 0.75 0 1 0.6 0.5 0.2 0.1 0.05
+A 0.05 0 0 0 0.5 0 0.6 0.15
+T 0.15 0 0 0 0 0 0.3 0.6
+C 0.05 1 0 0.4 0 0.8 0 0.2
+
+>TEC1_TRH1
+G 0.3409090909 0.0454545455 0 0 0 0.0909090909 0 0.1477272727
+A 0.5227272727 0 1 0.0454545455 0 0 0 0.1022727273
+T 0.0681818182 0 0 0.9545454545 1 0 0.3181818182 0.2840909091
+C 0.0681818182 0.9545454545 0 0 0 0.9090909091 0.6818181818 0.4659090909
+
+>TOS8_TRH1
+G 0.2019230769 0.0096153846 1 0 0 0 0.0673076923 0.1538461538
+A 0.2788461538 0.0096153846 0 0 0 1 0.6442307692 0.5
+T 0.0480769231 0.8173076923 0 1 0 0 0.2211538462 0.1923076923
+C 0.4711538462 0.1634615385 0 0 1 0 0.0673076923 0.1538461538
+
+>TYE7_TRH1
+G 0.025 0 0 0.9 0 1 0.075 
+A 0.025 1 0 0 0 0 0.775 
+T 0.025 0 0 0 1 0 0.075 
+C 0.925 0 1 0.1 0 0 0.075 
+
+>UGA3_TRH1
+G 0.2708333333 0.625 1 0 1 1 0.6875 0.0208333333
+A 0.1041666667 0.0416666667 0 0 0 0 0.0208333333 0.8541666667
+T 0.1875 0.0416666667 0 0 0 0 0.0208333333 0.1041666667
+C 0.4375 0.2916666667 0 1 0 0 0.2708333333 0.0208333333
+
+>UME6_TRH1
+G 0.1875 0.21875 1 0 1 0.8125 0.078125 0.046875 0.1875 
+A 0.1875 0.09375 0 0 0 0 0.015625 0.421875 0.5625 
+T 0.1875 0.03125 0 0 0 0 0.390625 0.421875 0.125 
+C 0.4375 0.65625 0 1 0 0.1875 0.515625 0.109375 0.125 
+
+>UPC2_TRH1
+A 0.156931 0.593216 0.378413 1 0 0.005119 0.828455 
+C 0.252915 0.027584 0.003065 0 1 0.004597 0.049279 
+G 0.19415 0.289317 0.00298 0 0 0.985719 0.085756 
+T 0.396005 0.089883 0.615543 0 0 0.004564 0.036511 
+
+>XBP1_TRH1
+A 0.118605 0 0 0 1 0.397674 0.313953 
+C 0.506977 0 1 0 0 0.076744 0.22093 
+G 0.067442 0 0 1 0 0.497674 0.311628 
+T 0.306977 1 0 0 0 0.027907 0.153488 
+
+>YAP3_TRH1
+G 0.1153846154 0 0 0 0 1 0.0192307692 0.1923076923
+A 0.6538461538 0 0 1 0 0 0.0192307692 0.5
+T 0.0384615385 1 1 0 0 0 0.9423076923 0.1923076923
+C 0.1923076923 0 0 0 1 0 0.0192307692 0.1153846154
+
+>YBL054W_TRH1
+G 0.0227272727 1 0 0 1 0.3863636364 0.4090909091 0.2045454545
+A 0.0227272727 0 1 0 0 0.1136363636 0.0454545455 0.1136363636
+T 0.0227272727 0 0 1 0 0.0227272727 0.0454545455 0.1136363636
+C 0.9318181818 0 0 0 0 0.4772727273 0.5 0.5681818182
+
+>YBR239C_TRH1
+G 0.2205882353 0.0588235294 0 1 1 0 0 0.0441176471
+A 0.5147058824 0.0588235294 0 0 0 1 1 0.0441176471
+T 0.1617647059 0.4117647059 0 0 0 0 0 0.2794117647
+C 0.1029411765 0.4705882353 1 0 0 0 0 0.6323529412
+
+>YDR520c_TRH1
+A 0.2463235294 0.0012254902 0.0012254902 0.0012254902 0.7365196078 0.2267156863 0.5649509804 0.1433823529 0.9375 0.3639705882
+C 0.3786764706 0.9963235294 0.0012254902 0.0012254902 0.0943627451 0.1727941176 0.0012254902 0.0012254902 0.0600490196 0.1678921569
+G 0.1090686275 0.0012254902 0.9963235294 0.9963235294 0.1678921569 0.4620098039 0.0012254902 0.0012254902 0.0012254902 0.1482843137
+T 0.2659313725 0.0012254902 0.0012254902 0.0012254902 0.0012254902 0.1384803922 0.4325980392 0.8541666667 0.0012254902 0.3198529412
+
+>YER130C_TRH1
+A 0.34715 0 0 0 0 0 0.601036 0.212435 0.321244 
+C 0.290155 0.974093 0.911917 1 1 0 0 0 0.290155 
+G 0.233161 0.005181 0 0 0 0 0.082902 0.036269 0.051813 
+T 0.129534 0.020725 0.088083 0 0 1 0.316062 0.751295 0.336788 
+
+>YER184C_TRH1
+G 0.0576923077 0.0961538462 0.1538461538 0 1 1 0 0.2307692308
+A 0.2884615385 0.0192307692 0 0 0 0 0.6923076923 0.4615384615
+T 0.2884615385 0.7115384615 0.0769230769 0 0 0 0 0.1538461538
+C 0.3653846154 0.1730769231 0.7692307692 1 0 0 0.3076923077 0.1538461538
+
+>YGR067C_TRH1
+A 0.358178 0 0 0 0.006211 0.407867 0 0.26501 0.229814 0.240166 0.252588 0.254658 0.219462 0.256729
+C 0.236025 1 0.987578 1 0.993789 0.004141 0.981366 0.26087 0.256729 0.258799 0.238095 0.219462 0.26087 0.238095
+G 0.269151 0 0 0 0 0.308489 0.008282 0.165631 0.202899 0.202899 0.252588 0.26087 0.256729 0.258799
+T 0.136646 0 0.012422 0 0 0.279503 0.010352 0.308489 0.310559 0.298137 0.256729 0.26501 0.26294 0.246377
+
+>YJL103C_TRH1
+A 0.3933333333 0.26 0.1533333333 0.1233333333 0.02 0.0033333333 0.0033333333 0.05 0.58 0.26 0.3533333333 
+C 0.2066666667 0.2466666667 0.4333333333 0.2966666667 0.94 0.99 0.07 0.01 0.0733333333 0.1666666667 0.26 
+G 0.1933333333 0.2733333333 0.1666666667 0.0966666667 0.02 0.0033333333 0.9233333333 0.93 0.26 0.46 0.18 
+T 0.2066666667 0.22 0.2466666667 0.4833333333 0.02 0.0033333333 0.0033333333 0.01 0.0866666667 0.1133333333 0.2066666667 
+
+>YKL222C_TRH1
+G 0.1458333333 0.1875 0 1 1 0.0833333333 0.4375 0.0625 0.1041666667 
+A 0.4791666667 0.6875 0 0 0 0.9166666667 0.5208333333 0.6458333333 0.1041666667 
+T 0.1458333333 0.0208333333 0 0 0 0 0.0208333333 0.2291666667 0.6875 
+C 0.2291666667 0.1041666667 1 0 0 0 0.0208333333 0.0625 0.1041666667 
+
+>YLL054C_TRH1
+G 0 1 1 0.1428571429 0.1607142857 0.7678571429 0.0714285714 
+A 0 0 0 0.2142857143 0.0892857143 0.125 0.5714285714 
+T 0 0 0 0 0.0892857143 0.0535714286 0.2142857143 
+C 1 0 0 0.6428571429 0.6607142857 0.0535714286 0.1428571429 
+
+>YLR278C_TRH1
+G 0.1339285714 0 1 1 0.0357142857 0.8214285714 0.0535714286 0.0535714286
+A 0.1339285714 0 0 0 0.9642857143 0.0357142857 0.2321428571 0.2678571429
+T 0.3125 0 0 0 0 0 0.6964285714 0.625
+C 0.4196428571 1 0 0 0 0.1428571429 0.0178571429 0.0535714286
+
+>YML081W_TRH1
+A 0.315663 0 0 0 0 0.301205 0 0.436145 0.190361 
+C 0.240964 1 1 1 1 0 1 0.161446 0.349398 
+G 0.228916 0 0 0 0 0.356627 0 0.026506 0.146988 
+T 0.214458 0 0 0 0 0.342169 0 0.375904 0.313253 
+
+>YNR063W_TRH1
+G 0.175 0 1 1 0 0.8 0 0.025
+A 0.075 0 0 0 1 0.1 0.9 0.325
+T 0.675 0 0 0 0 0.1 0.1 0.625
+C 0.075 1 0 0 0 0 0 0.025
+
+>YOX1_TRH1
+G 0.0735294118 0 0 0 0 0 0.1470588235 0.1323529412
+A 0.0147058824 0 1 1 0 0 0.6176470588 0.5441176471
+T 0.6617647059 1 0 0 1 1 0.2058823529 0.1911764706
+C 0.25 0 0 0 0 0 0.0294117647 0.1323529412
+
+>YPL230W_TRH1
+A 0.996835443 0.2035864979 0.0010548523 0.0010548523 0.0010548523 
+C 0.0010548523 0.0010548523 0.0010548523 0.0010548523 0.0010548523 
+G 0.0010548523 0.7943037975 0.996835443 0.996835443 0.996835443 
+T 0.0010548523 0.0010548523 0.0010548523 0.0010548523 0.0010548523 
+
+>YPR013C_TRH1
+A 0.1122327791 0.0005938242 0.0932304038 0.6324228029 0.3996437055 0.9982185273 0.0005938242 0.0005938242 0.3616389549 
+C 0.3616389549 0.0005938242 0.2571258907 0.2618764846 0.0005938242 0.0005938242 0.0005938242 0.9982185273 0.2998812352 
+G 0.1122327791 0.9982185273 0.0005938242 0.0005938242 0.5991686461 0.0005938242 0.0005938242 0.0005938242 0.169239905 
+T 0.4138954869 0.0005938242 0.6490498812 0.1051068884 0.0005938242 0.0005938242 0.9982185273 0.0005938242 0.169239905 
+
+>YPR022C_TRH1
+A 0.146245 0 0 0 1 0 0.225296 
+C 0.656126 1 1 1 0 1 0.256917 
+G 0 0 0 0 0 0 0.339921 
+T 0.197628 0 0 0 0 0 0.177866 
+
+>YPR196W_TRH1
+A 0.608511 0.323404 0.170213 0.242553 0.170213 0.123404 0 0 0.025532 
+C 0 0 0 0.042553 0.438298 0.319149 0.92766 1 0 
+G 0.259574 0 0 0.021277 0.114894 0.068085 0.07234 0 0.92766 
+T 0.131915 0.676596 0.829787 0.693617 0.276596 0.489362 0 0 0.046809 
+
+>YRM1_TRH1
+G 0.23 0.02 1 1 0 0.16 0.01 0.04
+A 0.51 0.02 0 0 1 0.6 0.93 0.12
+T 0.11 0.02 0 0 0 0.12 0.05 0.76
+C 0.15 0.94 0 0 0 0.12 0.01 0.08
+
+>YRR1_TRH1
+A 0.208861 0.158228 0.221519 0.892405 0.189873 0.278481 0.037975 0 0 0.031646 0.063291 
+C 0.424051 0.158228 0.075949 0.006329 0.088608 0.329114 0.21519 1 1 0 0.411392 
+G 0.221519 0.101266 0.037975 0.018987 0.037975 0.075949 0.06962 0 0 0.949367 0.139241 
+T 0.14557 0.582278 0.664557 0.082278 0.683544 0.316456 0.677215 0 0 0.018987 0.386076 
+
+>ZMS1_TRH1
+G 0.15 0.1125 0 0 0 0 0.5375 0.05 0.1 
+A 0.15 0.3125 0 0 0 0 0.1875 0.05 0.5 
+T 0.55 0.4625 0 0 0 0 0.2375 0.05 0.3 
+C 0.15 0.1125 1 1 1 1 0.0375 0.85 0.1 
+
+>LEU3_DipChip_TRH1
+A 0.0001 0.0001 0.0001 0.2 0.2574257426 0.47 0.0001 0.0001 0.0001 0.0001
+C 0.9997 0.9997 0.0001 0.0001 0.3366336634 0.12 0.6098 0.9997 0.0001 0.32
+G 0.0001 0.0001 0.5698 0.35 0.0001 0.16 0.39 0.0001 0.9997 0.6798
+T 0.0001 0.0001 0.43 0.4499 0.4058405941 0.25 0.0001 0.0001 0.0001 0.0001
+
+>RAP1_DipChip_TRH1
+T 0.0068 0.0068006801 0.2347234723 0.0068 0.0877 0.0215021502 0.6464353565 0.1392 0.0068 0.0068006801
+G 0.1219 0.00420042 0.00420042 0.0116 0.0042 0.2689268927 0.0777922208 0.1366 0.0042 0.00420042
+C 0.688 0.00420042 0.7542754275 0.9748 0.9013 0.00420042 0.1071892811 0.0042 0.9822 0.1292129213
+A 0.1833 0.9847984798 0.0068006801 0.0068 0.0068 0.7053705371 0.1685831417 0.72 0.0068 0.8597859786
+

SAMPLE_DATA/jaspar.matrix

->RSC30
-A 0.19 0.151515151515152 0 0 0 0 0 0
-C 0.5 0.383838383838384 0.92 0.08 0.92 0 0.85 0.31
-G 0.19 0.464646464646465 0.08 0.92 0.08 1 0.15 0.69
-T 0.12 0 0 0 0 0 0 0
->NHP10
-A 0.2 0.0784313725490196 0 0 0 0 0 0.666666666666667
-C 0.1 0.764705882352941 1 0 0 0 0 0.0784313725490196
-G 0.6 0.0784313725490196 0 1 1 1 1 0.176470588235294
-T 0.1 0.0784313725490196 0 0 0 0 0 0.0784313725490196
->MET31
-A 0.376237623762376 0.204081632653061 0.138613861386139 0 0 0 0 0 0.101010101010101
-C 0.099009900990099 0.285714285714286 0.138613861386139 0 0 0 0 1 0
-G 0.376237623762376 0.306122448979592 0.178217821782178 1 0 1 1 0 0.696969696969697
-T 0.148514851485149 0.204081632653061 0.544554455445545 0 1 0 0 0 0.202020202020202
->PHD1
-A 0.36 0.0909090909090909 0.373737373737374 0 0 0 0.91 0.08 0.22 0.32
-C 0.27 0.434343434343434 0.444444444444444 0.101010101010101 0 0.99 0.01 0.22 0.42 0.28
-G 0.19 0.393939393939394 0.151515151515152 0 1 0 0.07 0.36 0.22 0.21
-T 0.18 0.0808080808080808 0.0303030303030303 0.898989898989899 0 0.01 0.01 0.34 0.14 0.19
->LEU3
-A 0 0 0 0.2 0.257425742574257 0.47 0 0 0 0
-C 1 1 0 0 0.336633663366337 0.12 0.61 1 0 0.32
-G 0 0 0.565656565656566 0.35 0 0.16 0.39 0 1 0.68
-T 0 0 0.434343434343434 0.45 0.405940594059406 0.25 0 0 0 0
->DAL80
-A 0.108910891089109 0 1 0 1 0.909090909090909 0.03
-C 0.663366336633663 0 0 0 0 0.0101010101010101 0.19
-G 0.0594059405940594 1 0 0 0 0.0101010101010101 0.75
-T 0.168316831683168 0 0 1 0 0.0707070707070707 0.03
->PDR3
-A 0 0 0 0 0 0 0 1
-C 0 1 1 0 1 0 0 0
-G 0 0 0 1 0 1 1 0
-T 1 0 0 0 0 0 0 0
->GSM1
-A 0.322645290581162 0.16016016016016 0.219438877755511 0.461923847695391 0.349349349349349 0.342685370741483 0.567134268537074 0.850701402805611 0.400801603206413 0.0030060120240481 0.00401203610832497 0.0030060120240481 0 0 0.13627254509018 0.710130391173521 0.289869608826479 0.164164164164164 0.37374749498998 0.225450901803607 0.32296890672016
-C 0.207414829659319 0.172172172172172 0.289579158316633 0.124248496993988 0.201201201201201 0.144288577154309 0.0220440881763527 0.00901803607214429 0.164328657314629 0.917835671342685 0.17753259779338 0.986973947895792 0.974924774322969 0.030060120240481 0.00400801603206413 0.0601805416248746 0.183550651955868 0.172172172172172 0.101202404809619 0.168336673346693 0.212637913741224
-G 0.190380761523046 0.229229229229229 0.168336673346693 0.18436873747495 0.233233233233233 0.281563126252505 0.0170340681362725 0.0200400801603206 0.182364729458918 0.0100200400801603 0.0381143430290873 0.00100200400801603 0.0250752256770311 0.968937875751503 0.850701402805611 0.197592778335005 0.439317953861585 0.205205205205205 0.232464929859719 0.299599198396794 0.195586760280843
-T 0.279559118236473 0.438438438438438 0.322645290581162 0.229458917835671 0.216216216216216 0.231462925851703 0.393787575150301 0.120240480961924 0.25250501002004 0.0691382765531062 0.780341023069208 0.00901803607214429 0 0.00100200400801603 0.00901803607214429 0.0320962888665998 0.0872617853560682 0.458458458458458 0.292585170340681 0.306613226452906 0.268806419257773
->HCM1
-A 0.51 0.27 0.663366336633663 0.95 1 0.01 0.940594059405941 0.575757575757576
-C 0.16 0.08 0.316831683168317 0.05 0 0.86 0.0198019801980198 0.171717171717172
-G 0.25 0.04 0.0099009900990099 0 0 0 0.0198019801980198 0.111111111111111
-T 0.08 0.61 0.0099009900990099 0 0 0.13 0.0198019801980198 0.141414141414141
->ASH1
-A 0 0 0.271111111111111 0.257777777777778 0.706521739130435 0 0.146017699115044 0.404040404040404 0 0
-C 0.836501901140684 0.989795918367347 0.0933333333333333 0.24 0 0.0662650602409639 0.663716814159292 0 0.0289855072463768 0
-G 0.0304182509505703 0 0.591111111111111 0.448888888888889 0.293478260869565 0.0481927710843374 0.0353982300884956 0.464646464646465 0.902173913043478 0.934306569343066
-T 0.133079847908745 0.0102040816326531 0.0444444444444444 0.0533333333333333 0 0.885542168674699 0.154867256637168 0.131313131313131 0.0688405797101449 0.0656934306569343
->TEC1
-A 0.52 0 1 0.05 0 0 0 0.1
-C 0.07 0.95 0 0 0 0.91 0.68 0.47
-G 0.34 0.05 0 0 0 0.09 0 0.15
-T 0.07 0 0 0.95 1 0 0.32 0.28
->YDR520C
-A 0.247524752475248 0 0 0 0.74 0.23 0.565656565656566 0.141414141414141 0.94 0.36
-C 0.376237623762376 1 0 0 0.09 0.17 0 0 0.06 0.17
-G 0.108910891089109 0 1 1 0.17 0.46 0 0 0 0.15
-T 0.267326732673267 0 0 0 0 0.14 0.434343434343434 0.858585858585859 0 0.32
->ABF1
-A 0.11 0 0 0 0.41 0.22 0.39 0.34 0.4 0.418367346938776 0.118811881188119 0 0.92 0 0.37 0.34
-C 0.41 0.99 0 0 0.17 0.24 0.16 0.18 0.21 0 0.247524752475248 0 0.08 0.45 0.22 0.18
-G 0.04 0 1 0 0.22 0.26 0.28 0.2 0.24 0.581632653061224 0.0891089108910891 0.81 0 0.09 0.18 0.14
-T 0.44 0.01 0 1 0.2 0.28 0.17 0.28 0.15 0 0.544554455445545 0.19 0 0.46 0.23 0.34
->ZAP1
-A 1 0 0 0 0 0.532338308457711 1 0.616580310880829 0 0 0 0.0985915492957746 0.643243243243243 0.0526315789473684 0.188524590163934
-C 0 1 1 0.475490196078431 0 0.383084577114428 0 0.0880829015544041 0 0 0 0.455399061032864 0 0.0994152046783626 0
-G 0 0 0 0 0 0.0845771144278607 0 0.295336787564767 1 1 0 0.173708920187793 0.308108108108108 0 0.811475409836066
-T 0 0 0 0.524509803921569 1 0 0 0 0 0 1 0.272300469483568 0.0486486486486487 0.847953216374269 0
->YAP5
-A 0.782051282051282 0.649214659685864 0.387387387387387 0 1 0.121794871794872
-C 0 0 0 0.939501779359431 0 0
-G 0 0.350785340314136 0.612612612612613 0 0 0
-T 0.217948717948718 0 0 0.0604982206405694 0 0.878205128205128
->GAT4
-A 0.356435643564356 0.306930693069307 0.8 0.0303030303030303 0.98 0 0 0.05 0.4 0.282828282828283 0.333333333333333
-C 0.207920792079208 0.257425742574257 0.04 0 0 0 1 0.28 0.2 0.262626262626263 0.242424242424242
-G 0.237623762376238 0.178217821782178 0.12 0.96969696969697 0 0 0 0.03 0.23 0.232323232323232 0.212121212121212
-T 0.198019801980198 0.257425742574257 0.04 0 0.02 1 0 0.64 0.17 0.222222222222222 0.212121212121212
->UGA3
-A 0.1 0.0404040404040404 0 0 0 0 0.02 0.858585858585859
-C 0.44 0.282828282828283 0 1 0 0 0.27 0.0202020202020202
-G 0.27 0.636363636363636 1 0 1 1 0.69 0.0202020202020202
-T 0.19 0.0404040404040404 0 0 0 0 0.02 0.101010101010101
->FKH1
-A 0.17753259779338 0.24749498997996 0.520520520520521 0.527054108216433 0.365365365365365 0.119238476953908 0.146292585170341 0.00702106318956871 0.961885656970913 0.978957915831663 0.991983967935872 0.00100200400801603 0.991983967935872 0.875751503006012 0.672344689378757 0.248496993987976 0.374749498997996 0.284569138276553 0.205410821643287 0.421843687374749
-C 0.287863590772317 0.192384769539078 0.0840840840840841 0.0761523046092184 0.0730730730730731 0.146292585170341 0.00400801603206413 0.00300902708124373 0.037111334002006 0.0110220440881764 0.00100200400801603 0.92685370741483 0.00100200400801603 0.0390781563126252 0.0490981963927856 0.191382765531062 0.158316633266533 0.18436873747495 0.11623246492986 0.192384769539078
-G 0.207622868605817 0.334669338677355 0.0980980980980981 0.129258517034068 0.15015015015015 0.133266533066132 0.848697394789579 0 0 0.00100200400801603 0.00200400801603206 0.00100200400801603 0.0030060120240481 0.0160320641282565 0.0701402805611222 0.407815631262525 0.296593186372746 0.330661322645291 0.452905811623247 0.248496993987976
-T 0.326980942828485 0.225450901803607 0.297297297297297 0.267535070140281 0.411411411411411 0.601202404809619 0.00100200400801603 0.989969909729188 0.00100300902708124 0.00901803607214429 0.00501002004008016 0.0711422845691383 0.00400801603206413 0.0691382765531062 0.208416833667335 0.152304609218437 0.170340681362725 0.200400801603206 0.225450901803607 0.137274549098196
->MSN4
-A 0.838383838383838 0 0 0 0
-C 0 0 0 0 0
-G 0.161616161616162 1 1 1 0.99
-T 0 0 0 0 0.01
->DAL81
-A 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0
-C 0 0 0 0 0 1 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0
-G 0 0 0 0 1 0 0 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 0
-T 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1
->YER184C
-A 0.282828282828283 0.02 0 0 0 0 0.69 0.464646464646465
-C 0.373737373737374 0.17 0.77 1 0 0 0.31 0.151515151515152
-G 0.0606060606060606 0.1 0.15 0 1 1 0 0.232323232323232
-T 0.282828282828283 0.71 0.08 0 0 0 0 0.151515151515152
->YRR1
-A 0.21 0.161616161616162 0.22 0.89 0.19 0.277227722772277 0.0396039603960396 0 0 0.03 0.06
-C 0.42 0.161616161616162 0.08 0.01 0.09 0.326732673267327 0.217821782178218 1 1 0 0.41
-G 0.22 0.101010101010101 0.04 0.02 0.04 0.0792079207920792 0.0693069306930693 0 0 0.95 0.14
-T 0.15 0.575757575757576 0.66 0.08 0.68 0.316831683168317 0.673267326732673 0 0 0.02 0.39
->STP4
-A 0.188118811881188 0.404040404040404 0 1 0 0 0 0 0.54
-C 0.108910891089109 0.282828282828283 0 0 0 1 0 0.73 0.15
-G 0.554455445544555 0.242424242424242 0 0 1 0 1 0.17 0.16
-T 0.148514851485149 0.0707070707070707 1 0 0 0 0 0.1 0.15
->YPR022C
-A 0.148514851485149 0 0 0 1 0 0.227722772277228
-C 0.653465346534653 1 1 1 0 1 0.257425742574257
-G 0 0 0 0 0 0 0.336633663366337
-T 0.198019801980198 0 0 0 0 0 0.178217821782178
->ROX1
-A 0 0 0.25 0.875 0 0 0 0 0 0 0.125 0
-C 0.5 0.75 0.5 0.125 0 0 0 0 0 0.625 0 0.625
-G 0 0 0 0 0 0.125 1 0 0 0.125 0.125 0.25
-T 0.5 0.25 0.25 0 1 0.875 0 1 1 0.25 0.75 0.125
->RLM1
-A 0.263157894736842 0.333333333333333 0.261904761904762 0 0 0 1 0.380952380952381 0.523809523809524 0.547619047619048 0.761904761904762 0 1 0 0.642857142857143 0.0975609756097561 0.166666666666667 0.25
-C 0.263157894736842 0.0476190476190476 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.333333333333333 0.365853658536585 0.380952380952381 0.325
-G 0.263157894736842 0.380952380952381 0.0238095238095238 0.119047619047619 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0.0487804878048781 0.0714285714285714 0.25
-T 0.210526315789474 0.238095238095238 0.714285714285714 0.880952380952381 0 1 0 0.619047619047619 0.476190476190476 0.452380952380952 0.238095238095238 1 0 0 0.0238095238095238 0.48780487804878 0.380952380952381 0.175
->DOT6
-A 0.278557114228457 0.194194194194194 0.156312625250501 0.131131131131131 0.239719157472417 0.141282565130261 0.517034068136273 0.0791583166332665 0.029029029029029 0.00600600600600601 0.00100300902708124 0.973947895791583 0.00100300902708124 0 0.036036036036036 0.223671013039117 0.28028028028028 0.188188188188188 0.163326653306613 0.15346038114343 0.185370741482966
-C 0.135270541082164 0.25025025025025 0.332665330661323 0.249249249249249 0.0852557673019057 0.480961923847695 0.0591182364729459 0.420841683366733 0.770770770770771 0.0520520520520521 0.992978936810431 0 0 0.970912738214644 0.00900900900900901 0.576730190571715 0.265265265265265 0.298298298298298 0.435871743486974 0.372116349047141 0.149298597194389
-G 0.231462925851703 0.266266266266266 0.223446893787575 0.268268268268268 0.401203610832498 0.145290581162325 0.138276553106212 0.392785571142285 0.197197197197197 0.0830830830830831 0.00401203610832497 0.00100200400801603 0.0270812437311936 0.00100300902708124 0.876876876876877 0.17753259779338 0.252252252252252 0.0720720720720721 0.208416833667335 0.183550651955868 0.202404809619238
-T 0.354709418837675 0.289289289289289 0.287575150300601 0.351351351351351 0.27382146439318 0.232464929859719 0.285571142284569 0.107214428857715 0.003003003003003 0.858858858858859 0.00200601805416249 0.0250501002004008 0.971915747241725 0.0280842527582748 0.0780780780780781 0.0220661985957874 0.202202202202202 0.441441441441441 0.192384769539078 0.290872617853561 0.462925851703407
->OPI1
-A 0.155251141552511 0 0.988095238095238 1 0 0 0.271889400921659
-C 0.497716894977169 0 0.0119047619047619 0 1 1 0.267281105990783
-G 0.191780821917808 1 0 0 0 0 0.405529953917051
-T 0.155251141552511 0 0 0 0 0 0.0552995391705069
->AFT1
-A 0.106212424849699 0.155310621242485 0.362725450901804 0.179538615847543 0.42685370741483 0.136409227683049 0.717434869739479 0.145145145145145 0.0340681362725451 0.160320641282565 0.0100300902708124 0.961961961961962 0.00800800800800801 0.0250501002004008 0.0190571715145436 0.181544633901705 0.265531062124248 0.287575150300601 0.276553106212425 0.123370110330993 0.154308617234469
-C 0.205410821643287 0.249498997995992 0.197394789579158 0.397191574724172 0.231462925851703 0.078234704112337 0.0250501002004008 0.031031031031031 0.0470941883767535 0.0100200400801603 0.968906720160481 0.00900900900900901 0.972972972972973 0.956913827655311 0.74222668004012 0.25777331995988 0.25250501002004 0.155310621242485 0.180360721442886 0.22567703109328 0.236472945891784
-G 0.231462925851703 0.220440881763527 0.221442885771543 0.222668004012036 0.154308617234469 0.142427281845537 0.031062124248497 0.288288288288288 0.0390781563126252 0.813627254509018 0.0110330992978937 0.015015015015015 0.00900900900900901 0.00200400801603206 0.0130391173520562 0.495486459378134 0.241482965931864 0.183366733466934 0.0681362725450902 0.358074222668004 0.458917835671343
-T 0.456913827655311 0.374749498997996 0.218436873747495 0.200601805416249 0.187374749498998 0.642928786359077 0.226452905811623 0.535535535535536 0.879759519038076 0.0160320641282565 0.0100300902708124 0.014014014014014 0.01001001001001 0.0160320641282565 0.22567703109328 0.0651955867602808 0.240480961923848 0.37374749498998 0.474949899799599 0.292878635907723 0.150300601202405
->REI1
-A 0 0.05 0 0 0 0 0.56
-C 0.95 0.95 1 1 0 0 0.08
-G 0 0 0 0 0 0.95 0.23
-T 0.05 0 0 0 1 0.05 0.13
->GCN4
-A 0.218436873747495 0.371743486973948 0.362725450901804 0.282565130260521 0.275551102204409 0.169169169169169 0.536072144288577 0.0110220440881764 0.00200400801603206 0.969939879759519 0.00200400801603206 0.0130260521042084 0.0571142284569138 0.974949899799599 0.0150300601202405 0.376376376376376 0.207207207207207 0.284569138276553 0.226452905811623 0.254509018036072 0.337675350701403
-C 0.295591182364729 0.217434869739479 0.213426853707415 0.119238476953908 0.177354709418838 0.14014014014014 0.0350701402805611 0.00801603206412826 0.00501002004008016 0.0130260521042084 0.433867735470942 0.00400801603206413 0.935871743486974 0.00601202404809619 0.413827655310621 0.29029029029029 0.354354354354354 0.216432865731463 0.234468937875752 0.329659318637275 0.169338677354709
-G 0.245490981963928 0.268537074148297 0.150300601202405 0.32565130260521 0.316633266533066 0.365365365365365 0.413827655310621 0.00601202404809619 0.935871743486974 0.00400801603206413 0.56312625250501 0.0130260521042084 0.00501002004008016 0.00801603206412826 0.0350701402805611 0.131131131131131 0.194194194194194 0.202404809619238 0.177354709418838 0.232464929859719 0.195390781563126
-T 0.240480961923848 0.142284569138277 0.273547094188377 0.272545090180361 0.230460921843687 0.325325325325325 0.0150300601202405 0.974949899799599 0.0571142284569138 0.0130260521042084 0.00100200400801603 0.969939879759519 0.00200400801603206 0.0110220440881764 0.536072144288577 0.202202202202202 0.244244244244244 0.296593186372746 0.361723446893788 0.183366733466934 0.297595190380762
->YOX1
-A 0.0101010101010101 0 1 1 0 0 0.613861386138614 0.545454545454545
-C 0.252525252525253 0 0 0 0 0 0.0297029702970297 0.131313131313131
-G 0.0707070707070707 0 0 0 0 0 0.148514851485149 0.131313131313131
-T 0.666666666666667 1 0 0 1 1 0.207920792079208 0.191919191919192
->STP2
-A 0.180360721442886 0.288866599799398 0.438438438438438 0.276830491474423 0.126126126126126 0.238716148445336 0.113226452905812 0.0340681362725451 0.00200400801603206 0 0.00100200400801603 0.00801603206412826 0.0140280561122244 0.619238476953908 0.0860860860860861 0.218436873747495 0.326653306613226 0.231462925851703 0.158316633266533 0.343029087261785
-C 0.258517034068136 0.242728184553661 0.193193193193193 0.20962888665998 0.405405405405405 0.111334002006018 0.0110220440881764 0.648296593186373 0.00501002004008016 0.850701402805611 0.867735470941884 0.0130260521042084 0.521042084168337 0.0120240480961924 0.433433433433433 0.312625250501002 0.240480961923848 0.427855711422846 0.2374749498998 0.26579739217653
-G 0.175350701402806 0.293881644934804 0.211211211211211 0.176529588766299 0.143143143143143 0.568706118355065 0.830661322645291 0.00501002004008016 0.988977955911824 0.148296593186373 0.128256513026052 0.949899799599198 0.00400801603206413 0.338677354709419 0.139139139139139 0.359719438877756 0.205410821643287 0.161322645290581 0.344689378757515 0.122367101303912
-T 0.385771543086172 0.174523570712136 0.157157157157157 0.337011033099298 0.325325325325325 0.0812437311935807 0.0450901803607214 0.312625250501002 0.00400801603206413 0.00100200400801603 0.0030060120240481 0.0290581162324649 0.460921843687375 0.030060120240481 0.341341341341341 0.109218436873747 0.227454909819639 0.17935871743487 0.259519038076152 0.268806419257773
->YDR026C
-A 0.0913385826771654 0 0 1 0 0 0.0635433494884222 0 0.0267321331151118 0.384122287968442
-C 0 0 0.0545839957604663 0 1 1 0.936456650511578 0 0 0.414694280078895
-G 0.143832020997375 0.0215401184706516 0 0 0 0 0 1 0.973267866884888 0.0576923076923077
-T 0.764829396325459 0.978459881529348 0.945416004239534 0 0 0 0 0 0 0.143491124260355
->INO2
-A 0.072289156626506 0 0.933734939759036 0 0.0264150943396226 0.0481927710843374 0 0.783333333333333 0.812121212121212
-C 0.116465863453815 1 0.0421686746987952 0.142857142857143 0 0 0.123636363636364 0.0888888888888889 0.0121212121212121
-G 0.795180722891566 0 0 0 0.973584905660377 0.0662650602409639 0.876363636363636 0.127777777777778 0.0303030303030303
-T 0.0160642570281124 0 0.0240963855421687 0.857142857142857 0 0.885542168674699 0 0 0.145454545454545
->ADR1
-A 0.41 0 0 0 0 0.64 0.34
-C 0.24 1 0.85 1 1 0.06 0.51
-G 0.13 0 0 0 0 0.2 0.06
-T 0.22 0 0.15 0 0 0.1 0.09
->MET28
-A 0 0 0 0 0 0
-C 1 0 0 0 0 0
-G 0 0 1 0 1 1
-T 0 1 0 1 0 0
->RDS2
-A 0.343434343434343 0 0 0 0 0.12 0.168316831683168
-C 0.393939393939394 0 1 0 0 0.01 0.0693069306930693
-G 0.181818181818182 0 0 1 1 0.86 0.693069306930693
-T 0.0808080808080808 1 0 0 0 0.01 0.0693069306930693
->HAP1
-A 0 0 0 0.89 0.05 0.51 0.04 0.57
-C 1 0 0 0 0.26 0.04 0.04 0.11
-G 0 1 1 0.11 0.53 0.04 0.04 0.11
-T 0 0 0 0 0.16 0.41 0.88 0.21
->ACE2
-A 0.454545454545455 0.01 0 0.9 0 0 0.49
-C 0.282828282828283 0.92 1 0.1 0 1 0.2
-G 0.212121212121212 0.06 0 0 1 0 0.17
-T 0.0505050505050505 0.01 0 0 0 0 0.14
->RDR1
-A 0.247524752475248 0 0 0 0 1 0.86 0.267326732673267
-C 0.108910891089109 0 1 0 0 0 0 0.475247524752475
-G 0.108910891089109 1 0 1 1 0 0 0.128712871287129
-T 0.534653465346535 0 0 0 0 0 0.14 0.128712871287129
->YAP7
-A 0.663684161977677 0.0183875530410184 0 0.965176961761078 0.117089489824366 0 0.740694907187054 1 0.00913156913902348 0.205903923725706 0.585949973390101
-C 0.238169910524859 0 0 0.00929879495208274 0.108540098503857 0.00920915218836039 0.240456925273679 0 0 0.711312797946461 0.0998758204718822
-G 0.0179872705469975 0 0.202912344151518 0.00920390928930639 0.774370411671778 0 0.018848167539267 0 0.588054416697726 0.0466629996332967 0.205162320383183
-T 0.0801586569504658 0.981612446958982 0.797087655848482 0.016320333997533 0 0.99079084781164 0 0 0.40281401416325 0.0361202786945361 0.109011885754834
->YPR015C
-A 0.0751503006012024 0.158316633266533 0.382382382382382 0.376753507014028 0.274549098196393 0.55310621242485 0.0160320641282565 0.00400801603206413 0.002002002002002 0.98496993987976 0.885771543086172 0.987975951903808 0.00501002004008016 0.00401203610832497 0.326326326326326 0.086258776328987 0.258517034068136 0.45045045045045 0.281281281281281 0.334002006018054
-C 0.24248496993988 0.204408817635271 0.17017017017017 0.240480961923848 0.0501002004008016 0.169338677354709 0.748496993987976 0.00400801603206413 0.016016016016016 0.00701402805611222 0.00100200400801603 0.00200400801603206 0.00200400801603206 0.985957873620863 0.575575575575576 0.221664994984955 0.190380761523046 0.11011011011011 0.396396396396396 0.33099297893681
-G 0.144288577154309 0.341683366733467 0.173173173173173 0.137274549098196 0.462925851703407 0.240480961923848 0.0170340681362725 0.98997995991984 0.003003003003003 0.0030060120240481 0.109218436873747 0.00400801603206413 0.00200400801603206 0.00100300902708124 0.0550550550550551 0.0772316950852558 0.196392785571142 0.173173173173173 0.0620620620620621 0.0682046138415246
-T 0.538076152304609 0.295591182364729 0.274274274274274 0.245490981963928 0.212424849699399 0.0370741482965932 0.218436873747495 0.00200400801603206 0.978978978978979 0.00501002004008016 0.00400801603206413 0.00601202404809619 0.990981963927856 0.00902708124373119 0.043043043043043 0.614844533600802 0.354709418837675 0.266266266266266 0.26026026026026 0.266800401203611
->TOS8
-A 0.28 0.01 0 0 0 1 0.64 0.505050505050505
-C 0.47 0.16 0 0 1 0 0.07 0.151515151515152
-G 0.2 0.01 1 0 0 0 0.07 0.151515151515152
-T 0.05 0.82 0 1 0 0 0.22 0.191919191919192
->RFX1
-A 0.12 0 0 0 0.31 0 0.02 0.88
-C 0.27 0 0 0 0 1 0.48 0.04
-G 0.42 1 0 0 0.69 0 0.02 0.04
-T 0.19 0 1 1 0 0 0.48 0.04
->AZF1
-A 0.617647058823529 1 1 0.871287128712871 0.75 0 0.78 0.818181818181818 0.617647058823529
-C 0.127450980392157 0 0 0.128712871287129 0 0 0.16 0.0606060606060606 0.127450980392157
-G 0.127450980392157 0 0 0 0.25 1 0.03 0.0606060606060606 0.127450980392157
-T 0.127450980392157 0 0 0 0 0 0.03 0.0606060606060606 0.127450980392157
->STE12
-A 0 0.150076837105337 0.955 0.898082386363636 1 0.00350325302066204 0.510629067245119
-C 0.114908911519081 0 0 0.00593039772727273 0 0.993029241438479 0.100183547472051
-G 0.00338278304379999 0.843007823414362 0.045 0.0959872159090909 0 0 0.313265476389121
-T 0.881708305437119 0.00691533948030176 0 0 0 0.00346750554085937 0.0759219088937093
->SPT23
-A 0.44392523364486 1 0.856287425149701 0.853503184713376 0.00581395348837209 0 0.603351955307263 0.96319018404908
-C 0 0 0 0 0.209302325581395 0.549800796812749 0.206703910614525 0
-G 0.55607476635514 0 0.131736526946108 0 0 0.266932270916335 0.100558659217877 0.0368098159509202
-T 0 0 0.0119760479041916 0.146496815286624 0.784883720930233 0.183266932270916 0.0893854748603352 0
->CIN5
-A 0 0.131313131313131 1 0.108910891089109 0.2 0 0.91 1 0.0198019801980198 0.15
-C 0 0.0707070707070707 0 0.534653465346535 0.16 0 0.09 0 0.138613861386139 0.7
-G 0.09 0.232323232323232 0 0.0495049504950495 0.57 0 0 0 0.376237623762376 0.08
-T 0.91 0.565656565656566 0 0.306930693069307 0.07 1 0 0 0.465346534653465 0.07
->SMP1
-A 0.111111111111111 0.18937875751503 0.56956956956957 0.0851703406813627 0.17935871743487 0.13013013013013 0.408817635270541 0.0971943887775551 0.751503006012024 0.866733466933868 0.0971943887775551 0.0771543086172345 0.635270541082164 0.495991983967936 0.637637637637638 0.197394789579158 0.174174174174174 0.525525525525526 0.156312625250501 0.249249249249249 0.336673346693387
-C 0.244244244244244 0.188376753507014 0.0970970970970971 0.555110220440882 0.624248496993988 0.147147147147147 0.128256513026052 0.234468937875752 0.125250501002004 0.0180360721442886 0.0180360721442886 0.0460921843687375 0.0330661322645291 0.0410821643286573 0.0850850850850851 0.2625250501002 0.275275275275275 0.104104104104104 0.290581162324649 0.381381381381381 0.172344689378758
-G 0.235235235235235 0.265531062124248 0.137137137137137 0.158316633266533 0.0470941883767535 0.0850850850850851 0.112224448897796 0.0330661322645291 0.0460921843687375 0.0180360721442886 0.0180360721442886 0.125250501002004 0.234468937875752 0.0601202404809619 0.147147147147147 0.146292585170341 0.271271271271271 0.101101101101101 0.455911823647295 0.201201201201201 0.229458917835671
-T 0.409409409409409 0.356713426853707 0.196196196196196 0.201402805611222 0.149298597194389 0.637637637637638 0.350701402805611 0.635270541082164 0.0771543086172345 0.0971943887775551 0.866733466933868 0.751503006012024 0.0971943887775551 0.402805611222445 0.13013013013013 0.393787575150301 0.279279279279279 0.269269269269269 0.0971943887775551 0.168168168168168 0.261523046092184
->SUT2
-A 0.333667334669339 0.225450901803607 0.269809428284855 0.354354354354354 0.248496993987976 0.523046092184369 0.94188376753507 0.972945891783567 0 0.00100200400801603 0.00200601805416249 0.00100200400801603 0.00200400801603206 0.791374122367101 0.52457372116349 0.375751503006012 0.338338338338338 0.279559118236473 0.163326653306613 0.281281281281281
-C 0.232464929859719 0.206412825651303 0.218655967903711 0.2002002002002 0.216432865731463 0.0851703406813627 0.00601202404809619 0 0.710420841683367 0.0160320641282565 0.994984954864594 0.985971943887776 0.00100200400801603 0.0160481444332999 0.0802407221664995 0.25250501002004 0.214214214214214 0.204408817635271 0.253507014028056 0.136136136136136
-G 0.112224448897796 0.264529058116232 0.277833500501505 0.1001001001001 0.153306613226453 0.287575150300601 0.0120240480961924 0.0110220440881764 0.287575150300601 0 0.00100300902708124 0.0120240480961924 0.99498997995992 0.168505516549649 0.25777331995988 0.154308617234469 0.168168168168168 0.209418837675351 0.25250501002004 0.244244244244244
-T 0.321643286573146 0.303607214428858 0.23370110330993 0.345345345345345 0.381763527054108 0.104208416833667 0.0400801603206413 0.0160320641282565 0.00200400801603206 0.982965931863727 0.00200601805416249 0.00100200400801603 0.00200400801603206 0.0240722166499498 0.13741223671013 0.217434869739479 0.279279279279279 0.306613226452906 0.330661322645291 0.338338338338338
->DAL82
-A 0.571428571428571 0.524752475247525 0.39 0.26 0 0 0 0 0.108910891089109
-C 0.142857142857143 0.108910891089109 0.03 0.11 0.26 0 1 0 0.673267326732673
-G 0.142857142857143 0.0495049504950495 0.03 0.42 0 1 0 1 0.108910891089109
-T 0.142857142857143 0.316831683168317 0.55 0.21 0.74 0 0 0 0.108910891089109
->IME1
-A 0 0 0 0 0 0 1 0.0567375886524823
-C 1 0.791808873720137 0 1 0.67741935483871 0 0 0
-G 0 0.208191126279863 1 0 0.268817204301075 1 0 0.943262411347518
-T 0 0 0 0 0.0537634408602151 0 0 0
->SPT2
-A 0.617834394904459 0.366666666666667 0 0.0256410256410256 0.706521739130435 0.634920634920635 0.393364928909953 0 1 0.638743455497382
-C 0 0.244444444444444 0 0 0 0.121693121693122 0.312796208530806 0 0 0
-G 0.0191082802547771 0.0666666666666667 0 0 0.293478260869565 0.243386243386243 0.28436018957346 0.507246376811594 0 0.361256544502618
-T 0.363057324840764 0.322222222222222 1 0.974358974358974 0 0 0.00947867298578199 0.492753623188406 0 0
->YGR067C
-A 0.356435643564356 0 0 0 0.01 0.41 0 0.267326732673267 0.23 0.24 0.25 0.25 0.22 0.257425742574257
-C 0.237623762376238 1 0.99 1 0.99 0 0.98 0.257425742574257 0.26 0.26 0.24 0.22 0.26 0.237623762376238
-G 0.267326732673267 0 0 0 0 0.31 0.01 0.168316831683168 0.2 0.2 0.25 0.26 0.26 0.257425742574257
-T 0.138613861386139 0 0.01 0 0 0.28 0.01 0.306930693069307 0.31 0.3 0.26 0.27 0.26 0.247524752475248
->MSN2
-A 0.606060606060606 0 0 0 0
-C 0.0707070707070707 0 0 0 0
-G 0.323232323232323 1 1 1 1
-T 0 0 0 0 0
->MOT3
-A 0.333333333333333 1 0 0 0 1
-C 0.333333333333333 0 0 0 0.5 0
-G 0 0 1 1 0 0
-T 0.333333333333333 0 0 0 0.5 0
->INO4
-A 0.119834710743802 0 0.816568047337278 0 0.037593984962406 0 0.0658914728682171 0.829545454545455 0.811428571428571
-C 0.190082644628099 0.925490196078431 0.0828402366863905 0 0 0 0 0.0397727272727273 0.04
-G 0.669421487603306 0 0 0 0.962406015037594 0 0.934108527131783 0.130681818181818 0.148571428571429
-T 0.0206611570247934 0.0745098039215686 0.100591715976331 1 0 1 0 0 0
->MATALPHA2
-A 0 0.818181818181818 0 0 0 0.909090909090909 0.818181818181818 0.363636363636364 0
-C 0.909090909090909 0 0 0 0 0 0.0909090909090909 0 0
-G 0 0.181818181818182 0 1 0 0 0 0 0
-T 0.0909090909090909 0 1 0 1 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.636363636363636 1
->TEA1
-A 0.05 0 0 0 0.5 0 0.6 0.15
-C 0.05 1 0 0.4 0 0.8 0 0.2
-G 0.75 0 1 0.6 0.5 0.2 0.1 0.05
-T 0.15 0 0 0 0 0 0.3 0.6
->NHP6B
-A 0.182182182182182 0.217217217217217 0.135406218655968 0.377131394182548 0.195390781563126 0.154308617234469 0.393787575150301 0.579739217652959 0.169169169169169 0.808617234468938 0.0921843687374749 0.74974974974975 0.279839518555667 0.511022044088176 0.461923847695391 0.372745490981964 0.465931863727455 0.202404809619238 0.287575150300601 0.287575150300601
-C 0.304304304304304 0.225225225225225 0.108324974924774 0.208625877632899 0.316633266533066 0.317635270541082 0.0691382765531062 0.0892678034102307 0.0650650650650651 0.032064128256513 0.0671342685370741 0.016016016016016 0.0511534603811434 0.0260521042084168 0.0961923847695391 0.106212424849699 0.0841683366733467 0.160320641282565 0.120240480961924 0.25751503006012
-G 0.0990990990990991 0.216216216216216 0.107321965897693 0.0772316950852558 0.11122244488978 0.143286573146293 0.0260521042084168 0.0511534603811434 0.016016016016016 0.0671342685370741 0.032064128256513 0.0650650650650651 0.0892678034102307 0.0691382765531062 0.12124248496994 0.11122244488978 0.336673346693387 0.302605210420842 0.339679358717435 0.25250501002004
-T 0.414414414414414 0.341341341341341 0.648946840521565 0.337011033099298 0.376753507014028 0.384769539078156 0.511022044088176 0.279839518555667 0.74974974974975 0.0921843687374749 0.808617234468938 0.169169169169169 0.579739217652959 0.393787575150301 0.32064128256513 0.409819639278557 0.113226452905812 0.334669338677355 0.25250501002004 0.202404809619238
->ASG1
-A 0 0 0 0 0.727272727272727 0.53
-C 0.76 1 0 0 0.111111111111111 0
-G 0 0 1 1 0.161616161616162 0
-T 0.24 0 0 0 0 0.47
->YAP3
-A 0.65 0 0 1 0 0 0.02 0.5
-C 0.19 0 0 0 1 0 0.02 0.12
-G 0.12 0 0 0 0 1 0.02 0.19
-T 0.04 1 1 0 0 0 0.94 0.19
->TYE7
-A 0.0294117647058824 1 0 0 0 0 0.764705882352941
-C 0.911764705882353 0 1 0.1 0 0 0.0784313725490196
-G 0.0294117647058824 0 0 0.9 0 1 0.0784313725490196
-T 0.0294117647058824 0 0 0 1 0 0.0784313725490196
->GZF3
-A 0.18 0 1 0 1 0.73 0.0396039603960396 0.39
-C 0.39 0 0 0 0 0.09 0.376237623762376 0.18
-G 0.02 1 0 0 0 0 0.584158415841584 0.27
-T 0.41 0 0 1 0 0.18 0 0.16
->RTG3
-A 0.393787575150301 0.220440881763527 0.357715430861723 0.164328657314629 0.156156156156156 0.535070140280561 0.0340681362725451 0.0190380761523046 0.906813627254509 0.00501002004008016 0.0280561122244489 0.00701402805611222 0.00701402805611222 0.275551102204409 0.152304609218437 0.11122244488978 0.398797595190381 0.275275275275275 0.323647294589178 0.249498997995992
-C 0.145290581162325 0.147294589178357 0.322645290581162 0.176352705410822 0.121121121121121 0.113226452905812 0.0270541082164329 0.954909819639279 0.00501002004008016 0.950901803607214 0.0160320641282565 0.0811623246492986 0.0190380761523046 0.663326653306613 0.332665330661323 0.270541082164329 0.122244488977956 0.257257257257257 0.165330661322645 0.396793587174349
-G 0.330661322645291 0.267535070140281 0.207414829659319 0.295591182364729 0.25025025025025 0.203406813627255 0.663326653306613 0.0190380761523046 0.0811623246492986 0.0160320641282565 0.950901803607214 0.00501002004008016 0.954909819639279 0.0270541082164329 0.156312625250501 0.187374749498998 0.276553106212425 0.296296296296296 0.0330661322645291 0.108216432865731
-T 0.130260521042084 0.364729458917836 0.112224448897796 0.36372745490982 0.472472472472472 0.148296593186373 0.275551102204409 0.00701402805611222 0.00701402805611222 0.0280561122244489 0.00501002004008016 0.906813627254509 0.0190380761523046 0.0340681362725451 0.35871743486974 0.430861723446894 0.202404809619238 0.171171171171171 0.477955911823647 0.245490981963928
->YNR063W
-A 0.0784313725490196 0 0 0 1 0.1 0.9 0.323529411764706
-C 0.0784313725490196 1 0 0 0 0 0 0.0294117647058824
-G 0.176470588235294 0 1 1 0 0.8 0 0.0294117647058824
-T 0.666666666666667 0 0 0 0 0.1 0.1 0.617647058823529
->MIG3
-A 0.0099009900990099 0 0 0 0.414141414141414 0.05 0.41
-C 0.97029702970297 0.94 1 1 0.0202020202020202 0.69 0.22
-G 0.0099009900990099 0 0 0 0.555555555555556 0.17 0.23
-T 0.0099009900990099 0.06 0 0 0.0101010101010101 0.09 0.14
->SNT2
-A 0 0 0.413843888070692 0 0.988906497622821 0.00223143130379343 0 0 0.00253565768621236 0.0535543512910424 0.275218658892128
-C 0.0276483379931656 0 0.0792341678939617 0 0 0 1 0 0.973692551505547 0.946445648708958 0.0673469387755102
-G 0.0972351662006834 1 0.506921944035346 0 0.0110935023771791 0.997768568696207 0 1 0.0237717908082409 0 0.485714285714286
-T 0.875116495806151 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0.171720116618076
->LYS14
-A 0.207920792079208 0.04 0 0 1 1 0.06 0.128712871287129
-C 0.485148514851485 0.82 0 0 0 0 0 0.128712871287129
-G 0.207920792079208 0.1 1 1 0 0 0 0.0693069306930693
-T 0.099009900990099 0.04 0 0 0 0 0.94 0.673267326732673
->ABF2
-A 0.18 0.09 0 0 1 0 0.940594059405941
-C 0.39 0.09 1 0 0 0 0.0198019801980198
-G 0.25 0.02 0 0 0 1 0.0198019801980198
-T 0.18 0.8 0 1 0 0 0.0198019801980198
->GCR1
-A 0.271423178557946 0 0 1 0.876472978464039 0.00364520048602673 0.221554487179487 0
-C 0.0117025292563231 0.0577235772357724 0.00894308943089431 0 0.00406338886631451 0.0052652895909275 0.682291666666667 0.74364896073903
-G 0.0290675726689317 0.942276422764228 0.991056910569106 0 0 0.942081814499797 0 0.00577367205542725
-T 0.687806719516799 0 0 0 0.119463632669646 0.0490076954232483 0.0961538461538462 0.250577367205543
->CRZ1
-A 0.2 0.282828282828283 0.37 0.623762376237624 0 0 0 0.42 0.0707070707070707
-C 0.48 0.222222222222222 0.3 0.356435643564356 0 1 1 0.3 0.767676767676768
-G 0.18 0.171717171717172 0.22 0.0099009900990099 1 0 0 0.07 0.0808080808080808
-T 0.14 0.323232323232323 0.11 0.0099009900990099 0 0 0 0.21 0.0808080808080808
->TBP
-A 0.277833500501505 0.337675350701403 0.253253253253253 0.160320641282565 0.546092184368738 0.115230460921844 0.287575150300601 0.332665330661323 0.908817635270541 0.0120361083249749 0.981981981981982 0.0380761523046092 0.971943887775551 0.0440881763527054 0.884769539078156 0.186186186186186 0.264529058116232 0.137274549098196 0.266266266266266 0.35035035035035 0.248746238716148
-C 0.250752256770311 0.191382765531062 0.345345345345345 0.200400801603206 0.139278557114228 0.0981963927855711 0.198396793587174 0.110220440881764 0.00701402805611222 0.00702106318956871 0.002002002002002 0.00100200400801603 0.00200400801603206 0.00400801603206413 0.0100200400801603 0.0620620620620621 0.122244488977956 0.380761523046092 0.228228228228228 0.176176176176176 0.19358074222668
-G 0.38716148445336 0.147294589178357 0.0880880880880881 0.154308617234469 0.154308617234469 0.702404809619238 0.266533066132265 0.0270541082164329 0.0250501002004008 0.0230692076228686 0.004004004004004 0.00501002004008016 0.00601202404809619 0.0030060120240481 0.0240480961923848 0.0940940940940941 0.129258517034068 0.369739478957916 0.384384384384384 0.172172172172172 0.270812437311936
-T 0.0842527582748245 0.323647294589178 0.313313313313313 0.48496993987976 0.160320641282565 0.0841683366733467 0.24749498997996 0.530060120240481 0.0591182364729459 0.957873620862588 0.012012012012012 0.955911823647295 0.0200400801603206 0.948897795591182 0.0811623246492986 0.657657657657658 0.483967935871743 0.112224448897796 0.121121121121121 0.301301301301301 0.286860581745236
->MAC1
-A 0.0620689655172414 0.0505969300739056 0 0.0670945157526254 0 0 0 0.555040556199305
-C 0 0 0 0 1 0 1 0
-G 0 0.124502558271745 0 0.932905484247375 0 0 0 0.379490150637312
-T 0.937931034482759 0.824900511654349 1 0 0 1 0 0.0654692931633835
->YJL103C
-A 0.39 0.26 0.15 0.12 0.02 0 0 0.05 0.575757575757576 0.26 0.35
-C 0.21 0.25 0.43 0.3 0.94 1 0.0707070707070707 0.01 0.0707070707070707 0.17 0.26
-G 0.19 0.27 0.17 0.1 0.02 0 0.929292929292929 0.93 0.262626262626263 0.46 0.18
-T 0.21 0.22 0.25 0.48 0.02 0 0 0.01 0.0909090909090909 0.11 0.21
->TOD6
-A 0.362725450901804 0.144144144144144 0.101202404809619 0.239478957915832 0.369739478957916 0.212212212212212 0.650300601202405 0.0672016048144433 0.0200400801603206 0.00200400801603206 0.00200400801603206 0.977933801404213 0.00100200400801603 0 0.0521564694082247 0.135270541082164 0.181181181181181 0.232232232232232 0.187187187187187 0.306306306306306 0.201402805611222
-C 0.188376753507014 0.213213213213213 0.261523046092184 0.327655310621242 0.11623246492986 0.366366366366366 0.0501002004008016 0.397191574724172 0.785571142284569 0.0290581162324649 0.992985971943888 0 0.00100200400801603 0.980942828485456 0.0190571715145436 0.656312625250501 0.3003003003003 0.282282282282282 0.28028028028028 0.213213213213213 0.150300601202405
-G 0.218436873747495 0.369369369369369 0.370741482965932 0.206412825651303 0.235470941883768 0.133133133133133 0.0961923847695391 0.437311935807422 0.193386773547094 0.0460921843687375 0.00200400801603206 0.00100300902708124 0.0180360721442886 0.00100300902708124 0.871614844533601 0.186372745490982 0.383383383383383 0.109109109109109 0.111111111111111 0.172172172172172 0.32064128256513
-T 0.230460921843687 0.273273273273273 0.266533066132265 0.226452905811623 0.278557114228457 0.288288288288288 0.203406813627255 0.0982948846539619 0.00100200400801603 0.922845691382766 0.0030060120240481 0.0210631895687061 0.979959919839679 0.0180541624874624 0.0571715145436309 0.0220440881763527 0.135135135135135 0.376376376376376 0.421421421421421 0.308308308308308 0.327655310621242
->CST6
-A 0.465346534653465 0.0101010101010101 0.01 1 0 0.05 0 0.454545454545455 0.46
-C 0.108910891089109 0.0101010101010101 0.01 0 1 0 0 0.282828282828283 0.14
-G 0.316831683168317 0.0101010101010101 0.91 0 0 0.95 0 0.0808080808080808 0.2
-T 0.108910891089109 0.96969696969697 0.07 0 0 0 1 0.181818181818182 0.2
->SIG1
-A 0.93 0 1 0 1
-C 0.02 0 0 0 0
-G 0 0 0 0 0
-T 0.05 1 0 1 0
->CBF1
-A 0.191919191919192 0.0297029702970297 1 0 0 0 0 0.712871287128713
-C 0.0808080808080808 0.910891089108911 0 1 0 0 0 0.168316831683168
-G 0.535353535353535 0.0297029702970297 0 0 1 0 1 0.0594059405940594
-T 0.191919191919192 0.0297029702970297 0 0 0 1 0 0.0594059405940594
->HAP2
-A 0 0 0.00557809330628803 0 0.158005617977528
-C 0 0 0 0 0.378979400749064
-G 0 0.0101600203200406 0.994421906693712 0.998222899212998 0.0306647940074906
-T 1 0.989839979679959 0 0.00177710078700178 0.432350187265918
->RIM101
-A 0.09 0 0 0 1 1 0
-C 0.43 0 1 1 0 0 0
-G 0.09 1 0 0 0 0 1
-T 0.39 0 0 0 0 0 0
->PHO2
-A 0.514851485148515 0.12 1 0.56 0.23 0.63
-C 0 0 0 0 0 0
-G 0.0792079207920792 0 0 0 0 0
-T 0.405940594059406 0.88 0 0.44 0.77 0.37
->ARG81
-A 0.297979797979798 0.0365853658536585 0.0772200772200772 1 0 0.00606060606060606 0 0.317204301075269
-C 0.0606060606060606 0 0 0 0.996323529411765 0 1 0.317204301075269
-G 0.419191919191919 0.024390243902439 0.922779922779923 0 0 0 0 0.021505376344086
-T 0.222222222222222 0.939024390243902 0 0 0.00367647058823529 0.993939393939394 0 0.344086021505376
->EDS1
-A 0.141414141414141 0 0 1 0.76 0.475247524752475 1 0.828282828282828 0.15
-C 0.525252525252525 0 0 0 0 0.237623762376238 0 0.0101010101010101 0.2
-G 0.141414141414141 1 1 0 0 0.099009900990099 0 0.0101010101010101 0.11
-T 0.191919191919192 0 0 0 0.24 0.188118811881188 0 0.151515151515152 0.54
->HAP4
-A 0.38265306122449 0 0.0225563909774436 1 1 0 0.036734693877551 0.91566265060241 0.309859154929577 0.326732673267327 0.182692307692308 0.206730769230769 0.162790697674419 0.161290322580645 0.38265306122449
-C 0.163265306122449 0.985074626865672 0.977443609022556 0 0 0.0919540229885057 0.742857142857143 0 0.103286384976526 0.247524752475248 0.264423076923077 0.274038461538462 0.4 0.290322580645161 0.239795918367347
-G 0.295918367346939 0.0111940298507463 0 0 0 0 0.126530612244898 0.0602409638554217 0.511737089201878 0.272277227722772 0.317307692307692 0.302884615384615 0.251162790697674 0.377880184331797 0.219387755102041
-T 0.158163265306122 0.00373134328358209 0 0 0 0.908045977011494 0.0938775510204082 0.0240963855421687 0.0751173708920188 0.153465346534653 0.235576923076923 0.216346153846154 0.186046511627907 0.170506912442396 0.158163265306122
->SFL1
-A 0.272272272272272 0.3687374749499 0.281563126252505 0.382382382382382 0.314629258517034 0.368368368368368 0.727727727727728 0.127127127127127 0.506506506506507 0.0180360721442886 0.957915831663327 0.960921843687375 0.0220440881763527 0.616616616616617 0.597194388777555 0.536072144288577 0.256513026052104 0.492985971943888 0.43186372745491 0.369739478957916 0.410230692076229
-C 0.183183183183183 0.2625250501002 0.244488977955912 0.256256256256256 0.0981963927855711 0.221221221221221 0.03003003003003 0.178178178178178 0.261261261261261 0.0100200400801603 0.0160320641282565 0.00901803607214429 0.0470941883767535 0.129129129129129 0.134268537074148 0.221442885771543 0.156312625250501 0.0961923847695391 0.0671342685370741 0.123246492985972 0.12136409227683
-G 0.13013013013013 0.124248496993988 0.332665330661323 0.117117117117117 0.349699398797595 0.198198198198198 0.124124124124124 0.108108108108108 0.226226226226226 0.961923847695391 0.00501002004008016 0.0210420841683367 0.807615230460922 0.218218218218218 0.0360721442885772 0.0480961923847695 0.146292585170341 0.217434869739479 0.0991983967935872 0.146292585170341 0.0722166499498496
-T 0.414414414414414 0.244488977955912 0.141282565130261 0.244244244244244 0.2374749498998 0.212212212212212 0.118118118118118 0.586586586586587 0.00600600600600601 0.0100200400801603 0.0210420841683367 0.00901803607214429 0.123246492985972 0.036036036036036 0.232464929859719 0.19438877755511 0.440881763527054 0.193386773547094 0.401803607214429 0.360721442885772 0.396188565697091
->MBP1
-A 0.55 0 0.15 0 0 0.35 0.333333333333333
-C 0.1 1 0 0.88 0.02 0.17 0.303030303030303
-G 0.18 0 0.85 0 0.98 0.09 0.181818181818182
-T 0.17 0 0 0.12 0 0.39 0.181818181818182
->YPR196W
-A 0.61 0.32 0.17 0.242424242424242 0.17 0.12 0 0 0.0297029702970297
-C 0 0 0 0.0404040404040404 0.44 0.32 0.93 1 0
-G 0.26 0 0 0.0202020202020202 0.11 0.07 0.07 0 0.920792079207921
-T 0.13 0.68 0.83 0.696969696969697 0.28 0.49 0 0 0.0495049504950495
->CUP2
-A 0 1 0 0.222222222222222 0.666666666666667 0.444444444444444 1 1 0.777777777777778 0.444444444444444 0.222222222222222
-C 0.777777777777778 0 0 0.777777777777778 0 0.111111111111111 0 0 0 0 0
-G 0 0 1 0 0.333333333333333 0.444444444444444 0 0 0.222222222222222 0 0.777777777777778
-T 0.222222222222222 0 0 0 0 0 0 0 0 0.555555555555556 0
->ZMS1
-A 0.15 0.313131313131313 0 0 0 0 0.188118811881188 0.05 0.5
-C 0.15 0.111111111111111 1 1 1 1 0.0396039603960396 0.85 0.1
-G 0.15 0.111111111111111 0 0 0 0 0.534653465346535 0.05 0.1
-T 0.55 0.464646464646465 0 0 0 0 0.237623762376238 0.05 0.3
->YLL054C
-A 0 0 0 0.212121212121212 0.09 0.13 0.571428571428571
-C 1 0 0 0.646464646464647 0.66 0.05 0.142857142857143
-G 0 1 1 0.141414141414141 0.16 0.77 0.0714285714285714
-T 0 0 0 0 0.09 0.05 0.214285714285714
->SFP1
-A 0.428284854563691 0.202404809619238 0.289579158316633 0.250501002004008 0.353707414829659 0.533533533533533 0.782782782782783 0.899799599198397 0.905811623246493 0.857572718154463 0.541541541541542 0.086258776328987 0.0350701402805611 0.0180360721442886 0.0730730730730731 0.12625250501002 0.0821643286573146 0.327327327327327 0.115230460921844 0.217434869739479 0.216432865731463
-C 0.159478435305918 0.293587174348697 0.17434869739479 0.217434869739479 0.0771543086172345 0.042042042042042 0.0730730730730731 0.0360721442885772 0.00901803607214429 0.0140421263791374 0.034034034034034 0.0421263791374122 0.0501002004008016 0.0460921843687375 0.0710710710710711 0.405811623246493 0.354709418837675 0.201201201201201 0.428857715430862 0.0831663326653307 0.169338677354709
-G 0.16148445336008 0.19438877755511 0.192384769539078 0.293587174348697 0.297595190380762 0.342342342342342 0.0710710710710711 0.0460921843687375 0.0501002004008016 0.0421263791374122 0.016016016016016 0.0140421263791374 0.00901803607214429 0.0360721442885772 0.0730730730730731 0.0911823647294589 0.103206412825651 0.165165165165165 0.154308617234469 0.374749498997996 0.405811623246493
-T 0.250752256770311 0.309619238476954 0.343687374749499 0.238476953907816 0.271543086172345 0.0820820820820821 0.0730730730730731 0.0180360721442886 0.0350701402805611 0.086258776328987 0.408408408408408 0.857572718154463 0.905811623246493 0.899799599198397 0.782782782782783 0.376753507014028 0.459919839679359 0.306306306306306 0.301603206412826 0.324649298597194 0.208416833667335
->YPR013C
-A 0.111111111111111 0 0.09 0.63 0.4 1 0 0 0.36
-C 0.363636363636364 0 0.26 0.26 0 0 0 1 0.3
-G 0.111111111111111 1 0 0 0.6 0 0 0 0.17
-T 0.414141414141414 0 0.65 0.11 0 0 1 0 0.17
->YHP1
-A 0 1 1 0 0 0
-C 0 0 0 0 0 0
-G 0 0 0 0 0 1
-T 1 0 0 1 1 0
->PDR1
-A 0.0808080808080808 0 0 0.13 0.02 0.08 0.101010101010101 0.62
-C 0.282828282828283 1 1 0 0.88 0.02 0.0303030303030303 0.08
-G 0.151515151515152 0 0 0.87 0.08 0.88 0.838383838383838 0.22
-T 0.484848484848485 0 0 0 0.02 0.02 0.0303030303030303 0.08
->BAS1
-A 0.064128256513026 0.104208416833667 0.485456369107322 0.0781563126252505 0.455911823647295 0.248496993987976 0.0981963927855711 0.0521564694082247 0.348697394789579 0.0120240480961924 0.967935871743487 0.0260521042084168 0.00901803607214429 0.047047047047047 0.892892892892893 0.487975951903808 0.288288288288288 0.37374749498998 0.178535606820461 0.40320962888666 0.435435435435435
-C 0.217434869739479 0.55310621242485 0.111334002006018 0.401803607214429 0.0511022044088176 0.0340681362725451 0.725450901803607 0.920762286860582 0.346693386773547 0.0030060120240481 0.00501002004008016 0.00601202404809619 0.0100200400801603 0.930930930930931 0.042042042042042 0.123246492985972 0.14014014014014 0.110220440881764 0.368104312938816 0.140421263791374 0.229229229229229
-G 0.425851703406814 0.150300601202405 0.114343029087262 0.186372745490982 0.370741482965932 0.671342685370741 0.143286573146293 0.00702106318956871 0.280561122244489 0.978957915831663 0.0230460921843687 0.963927855711423 0.00400801603206413 0.00700700700700701 0.016016016016016 0.32064128256513 0.317317317317317 0.0811623246492986 0.184553660982949 0.342026078234704 0.241241241241241
-T 0.292585170340681 0.192384769539078 0.288866599799398 0.333667334669339 0.122244488977956 0.0460921843687375 0.0330661322645291 0.0200601805416249 0.0240480961923848 0.00601202404809619 0.00400801603206413 0.00400801603206413 0.976953907815631 0.015015015015015 0.049049049049049 0.0681362725450902 0.254254254254254 0.434869739478958 0.268806419257773 0.114343029087262 0.0940940940940941
->YLR278C
-A 0.131313131313131 0 0 0 0.96 0.04 0.23 0.27
-C 0.424242424242424 1 0 0 0 0.14 0.02 0.05
-G 0.131313131313131 0 1 1 0.04 0.82 0.05 0.05
-T 0.313131313131313 0 0 0 0 0 0.7 0.63
->RGT1
-A 0.42 0.34 0.37 0.217821782178218 0.27 0.3 0 0 0 0.0396039603960396 0.32
-C 0.13 0.1 0 0.0198019801980198 0.15 0.18 0.12 1 1 0 0.13
-G 0.23 0.34 0 0 0.17 0.04 0 0 0 0.881188118811881 0.33
-T 0.22 0.22 0.63 0.762376237623762 0.41 0.48 0.88 0 0 0.0792079207920792 0.22
->STB4
-A 0.09 0 0 0 0 1 0.75
-C 0.43 0 1 0 0 0 0.01
-G 0.09 0 0 1 1 0 0.01
-T 0.39 1 0 0 0 0 0.23
->USV1
-A 0.269809428284855 0.306613226452906 0.342342342342342 0.1312625250501 0.133400200601805 0.318637274549098 0.00100300902708124 0 0.0030060120240481 0.00100200400801603 0 0 0.958876629889669 0.851703406813627 0.17434869739479 0.233233233233233 0.212212212212212 0.181362725450902 0.205410821643287 0.219658976930792
-C 0.223671013039117 0.182364729458918 0.168168168168168 0.193386773547094 0.0551654964894684 0.552104208416834 0.969909729187563 0.979939819458375 0.99498997995992 0.982965931863727 0.00601202404809619 0.00200601805416249 0 0.0921843687374749 0.25751503006012 0.235235235235235 0.191191191191191 0.185370741482966 0.100200400801603 0.297893681043129
-G 0.250752256770311 0.216432865731463 0.206206206206206 0.146292585170341 0.157472417251755 0.101202404809619 0.0260782347041123 0 0.00100200400801603 0 0.0030060120240481 0.871614844533601 0.0361083249749248 0.0210420841683367 0.162324649298597 0.0930930930930931 0.197197197197197 0.321643286573146 0.265531062124248 0.366098294884654
-T 0.255767301905717 0.294589178356713 0.283283283283283 0.529058116232465 0.653961885656971 0.0280561122244489 0.00300902708124373 0.0200601805416249 0.00100200400801603 0.0160320641282565 0.990981963927856 0.126379137412237 0.00501504513540622 0.0350701402805611 0.405811623246493 0.438438438438438 0.399399399399399 0.311623246492986 0.428857715430862 0.116349047141424
->IXR1
-A 1 0.765822784810127 0.326923076923077 0.106870229007634 0.239837398373984 0.239837398373984 0.11965811965812 0.630208333333333 0.765822784810127 0 0 0.102941176470588 0.0206185567010309 0 0
-C 0 0 0 0.870229007633588 0.760162601626016 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0
-G 0 0 0.538461538461538 0 0 0.760162601626016 0.722222222222222 0.369791666666667 0 1 0 0.897058823529412 0.979381443298969 0.530805687203792 0.897058823529412
-T 0 0.234177215189873 0.134615384615385 0.0229007633587786 0 0 0.158119658119658 0 0.234177215189873 0 0 0 0 0.469194312796209 0.102941176470588
->MET4
-A 1 0.527363184079602 0 0 0 0 0 0
-C 0 0.233830845771144 0.796 0 0 0 0 0
-G 0 0.238805970149254 0 0 1 0 1 1
-T 0 0 0.204 1 0 1 0 0
->SKO1
-A 1 0 0.100300902708124 0 1 0.619246861924686 0 0
-C 0 1 0 0 0 0 0 0
-G 0 0 0.899699097291876 0 0 0 0 1
-T 0 0 0 1 0 0.380753138075314 1 0
->ARO80
-A 0.102204408817635 0.330661322645291 0.12625250501002 0.407407407407407 0.390781563126253 0.31062124248497 0.0830830830830831 0.04004004004004 0.00501504513540622 0.00501002004008016 0.001001001001001 0.00100200400801603 0.0150300601202405 0.671342685370741 0.690690690690691 0.105210420841683 0.269269269269269 0.353707414829659 0.257257257257257 0.236472945891784 0.278557114228457
-C 0.155310621242485 0.193386773547094 0.232464929859719 0.253253253253253 0.193386773547094 0.198396793587174 0.154154154154154 0.744744744744745 0.231695085255767 0.988977955911824 0.022022022022022 0.00501002004008016 0.359719438877756 0.00400801603206413 0.0680680680680681 0.222444889779559 0.119119119119119 0.210420841683367 0.217217217217217 0.103206412825651 0.25250501002004
-G 0.532064128256513 0.301603206412826 0.317635270541082 0.203203203203203 0.229458917835671 0.135270541082164 0.336336336336336 0.03003003003003 0.00802407221664995 0.00100200400801603 0.975975975975976 0.991983967935872 0.295591182364729 0.00601202404809619 0.0600600600600601 0.372745490981964 0.193193193193193 0.205410821643287 0.178178178178178 0.349699398797595 0.170340681362725
-T 0.210420841683367 0.17434869739479 0.323647294589178 0.136136136136136 0.186372745490982 0.355711422845691 0.426426426426426 0.185185185185185 0.755265797392176 0.00501002004008016 0.001001001001001 0.00200400801603206 0.329659318637275 0.318637274549098 0.181181181181181 0.299599198396794 0.418418418418418 0.230460921843687 0.347347347347347 0.31062124248497 0.298597194388778
->RGM1
-A 1 0 0 0 0.11
-C 0 0 0 0 0.12
-G 0 1 1 1 0.77
-T 0 0 0 0 0
->PDR8
-A 0.383838383838384 0 0 0 1 0.0792079207920792 1 0.13
-C 0.151515151515152 1 0 0 0 0.0792079207920792 0 0.06
-G 0.383838383838384 0 1 1 0 0.841584158415842 0 0.06
-T 0.0808080808080808 0 0 0 0 0 0 0.75
->UPC2
-A 0.16 0.595959595959596 0.38 1 0 0.01 0.821782178217822
-C 0.25 0.0303030303030303 0 0 1 0 0.0495049504950495
-G 0.19 0.282828282828283 0 0 0 0.99 0.0891089108910891
-T 0.4 0.0909090909090909 0.62 0 0 0 0.0396039603960396
->MATA1
-A 0.5 0 1 0 1 1 0
-C 0 1 0 1 0 0 0
-G 0.5 0 0 0 0 0 0
-T 0 0 0 0 0 0 1
->ECM23
-A 0.31 0.33 0.72 0.1 1 0.03 0.0099009900990099 0.14 0.3 0.316831683168317 0.303030303030303
-C 0.25 0.25 0.11 0.02 0 0 0.891089108910891 0.19 0.23 0.247524752475248 0.262626262626263
-G 0.23 0.22 0.1 0.86 0 0 0.0297029702970297 0.14 0.21 0.247524752475248 0.222222222222222
-T 0.21 0.2 0.07 0.02 0 0.97 0.0693069306930693 0.53 0.26 0.188118811881188 0.212121212121212
->SIP4
-A 0.0792079207920792 0 0 0 0 0.23 0.581632653061224
-C 0.475247524752475 0.27 0.99 1 0 0 0.163265306122449
-G 0.128712871287129 0 0 0 1 0.63 0.255102040816327
-T 0.316831683168317 0.73 0.01 0 0 0.14 0
->ECM22
-A 0.282828282828283 0.141414141414141 0 0 0 0 0.93
-C 0.363636363636364 0.0707070707070707 1 1 0.14 0 0
-G 0.0707070707070707 0.0707070707070707 0 0 0.86 0.86 0.07
-T 0.282828282828283 0.717171717171717 0 0 0 0.14 0
->YRM1
-A 0.51 0.02 0 0 1 0.6 0.93 0.12
-C 0.15 0.94 0 0 0 0.12 0.01 0.08
-G 0.23 0.02 1 1 0 0.16 0.01 0.04
-T 0.11 0.02 0 0 0 0.12 0.05 0.76
->SKN7
-A 0 0 0 0 0.485148514851485 0.212121212121212
-C 0 0 1 0.84 0.148514851485149 0.181818181818182
-G 1 1 0 0.16 0.366336633663366 0.282828282828283
-T 0 0 0 0 0 0.323232323232323
->AFT2
-A 0.08 0.7 0 1 0 0 0 0.0909090909090909
-C 0.45 0 1 0 1 1 1 0.424242424242424
-G 0.27 0.3 0 0 0 0 0 0.272727272727273
-T 0.2 0 0 0 0 0 0 0.212121212121212
->MET32
-A 0.34 0.11 0 0 0.939393939393939 0 0.64
-C 0.46 0.05 1 1 0.0303030303030303 0.99 0.15
-G 0.1 0.77 0 0 0 0 0.12
-T 0.1 0.07 0 0 0.0303030303030303 0.01 0.09
->YAP6
-A 0.17434869739479 0.228686058174524 0.134268537074148 0.114114114114114 0.252252252252252 0.0430861723446894 0.492477432296891 0.0270541082164329 0.0250501002004008 0.890781563126252 0.0380761523046092 0.172344689378758 0.0671342685370741 0.647647647647648 0.831494483450351 0.162487462387161 0.228228228228228 0.337675350701403 0.430861723446894 0.166332665330661
-C 0.297595190380762 0.141424272818455 0.0921843687374749 0.434434434434434 0.231231231231231 0.114228456913828 0.413239719157472 0.0230460921843687 0.0210420841683367 0.032064128256513 0.556112224448898 0.0480961923847695 0.0851703406813627 0.193193193193193 0.0621865596790371 0.0762286860581745 0.474474474474474 0.0851703406813627 0.127254509018036 0.439879759519038
-G 0.371743486973948 0.58876629889669 0.332665330661323 0.109109109109109 0.0720720720720721 0.647294589178357 0.0361083249749248 0.0561122244488978 0.112224448897796 0.0490981963927856 0.103206412825651 0.723446893787575 0.0370741482965932 0.0640640640640641 0.0722166499498496 0.482447342026078 0.142142142142142 0.428857715430862 0.302605210420842 0.243486973947896
-T 0.156312625250501 0.041123370110331 0.440881763527054 0.342342342342342 0.444444444444444 0.195390781563126 0.0581745235707121 0.893787575150301 0.841683366733467 0.0280561122244489 0.302605210420842 0.0561122244488978 0.81062124248497 0.0950950950950951 0.0341023069207623 0.278836509528586 0.155155155155155 0.148296593186373 0.139278557114228 0.150300601202405
->MGA1
-A 0.384769539078156 0.305305305305305 0.240480961923848 0.367735470941884 0.252252252252252 0.11623246492986 0.787787787787788 0.192192192192192 0.702404809619238 0.00501002004008016 0.992978936810431 0.990990990990991 0.0120240480961924 0.84653961885657 0.0681362725450902 0.203610832497492 0.301603206412826 0.291583166332665 0.442326980942828 0.440881763527054 0.343029087261785
-C 0.0911823647294589 0.124124124124124 0.268537074148297 0.171342685370741 0.28028028028028 0.204408817635271 0.003003003003003 0.11011011011011 0.197394789579158 0.00200400801603206 0.00200601805416249 0.002002002002002 0.816633266533066 0.0391173520561685 0.506012024048096 0.180541624874624 0.353707414829659 0.268537074148297 0.0702106318956871 0.168336673346693 0.295887662988967
-G 0.206412825651303 0.376376376376376 0.318637274549098 0.306613226452906 0.194194194194194 0.230460921843687 0.198198198198198 0.166166166166166 0.0981963927855711 0.990981963927856 0.00300902708124373 0.002002002002002 0.0150300601202405 0.082246740220662 0.0701402805611222 0.195586760280843 0.0841683366733467 0.0971943887775551 0.229689067201605 0.105210420841683 0.216649949849549
-T 0.317635270541082 0.194194194194194 0.172344689378758 0.154308617234469 0.273273273273273 0.448897795591182 0.011011011011011 0.531531531531532 0.00200400801603206 0.00200400801603206 0.00200601805416249 0.005005005005005 0.156312625250501 0.0320962888665998 0.355711422845691 0.420260782347041 0.260521042084168 0.342685370741483 0.25777331995988 0.285571142284569 0.144433299899699
->RAP1
-A 0.18 0.98989898989899 0.0101010101010101 0.01 0.01 0.71 0.168316831683168 0.72 0.01 0.86
-C 0.69 0 0.757575757575758 0.97 0.9 0 0.108910891089109 0 0.98 0.13
-G 0.12 0 0 0.01 0 0.27 0.0792079207920792 0.14 0 0
-T 0.01 0.0101010101010101 0.232323232323232 0.01 0.09 0.02 0.643564356435644 0.14 0.01 0.01
->YKL222C
-A 0.475247524752475 0.69 0 0 0 0.92 0.52 0.65 0.101010101010101
-C 0.227722772277228 0.1 1 0 0 0 0.02 0.06 0.101010101010101
-G 0.148514851485149 0.19 0 1 1 0.08 0.44 0.06 0.101010101010101
-T 0.148514851485149 0.02 0 0 0 0 0.02 0.23 0.696969696969697
->YER130C
-A 0.353535353535354 0 0 0 0 0 0.6 0.21 0.323232323232323
-C 0.282828282828283 0.97 0.91 1 1 0 0 0 0.282828282828283
-G 0.232323232323232 0.01 0 0 0 0 0.08 0.04 0.0505050505050505
-T 0.131313131313131 0.02 0.09 0 0 1 0.32 0.75 0.343434343434343
->HMRA2
-A 0.06 0.54 0.04 0 0 0.93 0.871287128712871 0.4
-C 0.67 0 0 0 0 0 0.0198019801980198 0.08
-G 0.06 0.46 0 1 0 0 0.0198019801980198 0.08
-T 0.21 0 0.96 0 1 0.07 0.0891089108910891 0.44
->GAL4
-A 0 0 0 0.252843678908027 0.0948667966211826 0.316361378453896 0.786218487394958 0.197767701430066 0.640871021775544 0.206001875586121 0.0305440661788101 0.366082603254068 0 0.077125041023958 0
-C 1 0 0.155982905982906 0.212869678258044 0.369395711500975 0.251474697298975 0 0.45204046041158 0.112227805695142 0.185057830572054 0.244034362074451 0.161764705882353 0.480602006688963 0.128651132261241 1
-G 0 1 0.809472934472934 0.301267468313292 0.373944119558155 0.31108351443651 0.180840336134454 0.282525287757238 0 0.545170365739294 0.15717467387846 0.345744680851064 0.2438127090301 0.137512307187397 0
-T 0 0 0.0345441595441595 0.233019174520637 0.161793372319688 0.121080409810618 0.0329411764705882 0.0676665504011161 0.246901172529313 0.063769928102532 0.568246897868279 0.126408010012516 0.275585284280936 0.656711519527404 0
->CHA4
-A 0.22 0 0 0 0 0.717171717171717 0.22 0.484848484848485
-C 0.05 0 1 0 0 0 0.01 0.101010101010101
-G 0.68 1 0 1 1 0.282828282828283 0.76 0.101010101010101
-T 0.05 0 0 0 0 0 0.01 0.313131313131313
->GLN3
-A 0 1 0 0.74 0.61
-C 0 0 0 0 0
-G 1 0 0 0 0.27
-T 0 0 1 0.26 0.12
->HAC1
-A 0.237623762376238 0.68 0 1 0 0 0 0.27
-C 0.0594059405940594 0.32 1 0 1 0 0 0.18
-G 0.554455445544555 0 0 0 0 1 0 0.41
-T 0.148514851485149 0 0 0 0 0 1 0.14
->MIG2
-A 0.01 0 0 0 0.36 0.0495049504950495 0.363636363636364
-C 0.96 1 1 1 0.11 0.762376237623762 0.242424242424242
-G 0.02 0 0 0 0.52 0.128712871287129 0.242424242424242
-T 0.01 0 0 0 0.01 0.0594059405940594 0.151515151515152
->STP3
-A 0.25 0.18 0 1 0 0 0 0 0.445544554455446
-C 0.09 0.42 0 0 0 1 0 0.64 0.168316831683168
-G 0.48 0.21 0 0 1 0 1 0.18 0.188118811881188
-T 0.18 0.19 1 0 0 0 0 0.18 0.198019801980198
->ARR1
-A 1 0.119402985074627 0.160427807486631 0 0.311965811965812 0.708791208791209 0.810650887573965 0.0670731707317073
-C 0 0.373134328358209 0.374331550802139 0 0 0.225274725274725 0 0
-G 0 0.144278606965174 0 0 0.688034188034188 0.0659340659340659 0.171597633136095 0.146341463414634
-T 0 0.36318407960199 0.46524064171123 1 0 0 0.0177514792899408 0.786585365853659
->MCM1
-A 0.122422400694595 0.007028476197377 0.184954716283655 0.392778139232271 0.556794624347702 0.0680281997238171 0.0799700537671 0.42161921141474 0.0445220427760803 0.00859156998090762 0.752379599374911 0.910663455222247
-C 0.821648216482165 0.922614303311354 0.363317109235414 0.144437215354587 0.0139395239116449 0.0172250890326332 0.262710134077452 0.074909229887254 0.00232794994907609 0.00983991775591129 0.0686177013780366 0.0291219619005912
-G 0.0293032342088127 0 0.186248536750662 0.223292127521145 0.0458932018014154 0 0.036888314163207 0.378813937193452 0.953150007274844 0.980393596710236 0.0226594686745276 0.0255455806145537
-T 0.0266261486144273 0.0703572204912687 0.265479637730269 0.239492517891997 0.383372649939238 0.91474671124355 0.620431497992241 0.124657621504554 0 0.00117491555294463 0.156343230572524 0.0346690022626086
->CAD1
-A 0.912156166814552 0.0442518248175182 0 0.874942102825382 0.264150943396226 0 0.904319554110543 1 0 0
-C 0.0443655723158829 0 0 0.0453913849004169 0.0934620447564721 0 0.0956804458894566 0 0 0.955606407322654
-G 0.0434782608695652 0 0 0 0.642387