Index

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__and__() (brain.dataformat.annotation.Annotation method)
(brain.dataformat.annotation.DataSelection method)
__axis_bounds__() (brain.dataformat.annotation.DataSelection method)
__collapse_selection__() (brain.dataformat.annotation.DataSelection static method)
__comparison_operator__() (brain.dataformat.annotation.DataSelection method)
__contains__() (brain.dataformat.annotation.Annotation method)
(brain.dataformat.annotation.DataSelection method)
(brain.dataformat.base.ManagedGroup method)
__dict__ (brain.dataformat.annotation.Annotation attribute)
(brain.dataformat.annotation.AnnotationCollection attribute)
(brain.dataformat.annotation.DataSelection attribute)
(brain.dataformat.base.ManagedObject attribute)
(brain.readers.htkcollection.HTKCollection attribute)
(brain.readers.htkfile.HTKFile attribute)
(brain.readers.htkfile.HTKFormat attribute)
(brain.tools.convert_braindata.ConvertBrainData attribute)
__eq__() (brain.dataformat.annotation.Annotation method)
(brain.dataformat.annotation.DataSelection method)
__ge__() (brain.dataformat.annotation.Annotation method)
(brain.dataformat.annotation.DataSelection method)
__getattr__() (brain.dataformat.base.ManagedObject method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataData method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataDescriptors method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataFile method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataInternalData method)
__getitem__() (brain.dataformat.annotation.AnnotationCollection method)
(brain.dataformat.annotation.AnnotationDataGroup method)
(brain.dataformat.annotation.DataSelection method)
(brain.dataformat.base.ManagedDataset method)
(brain.dataformat.base.ManagedGroup method)
(brain.dataformat.base.ManagedObjectFile method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataECoG method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataFile method)
__gt__() (brain.dataformat.annotation.Annotation method)
(brain.dataformat.annotation.DataSelection method)
__init__() (brain.dataformat.annotation.Annotation method)
(brain.dataformat.annotation.AnnotationCollection method)
(brain.dataformat.annotation.AnnotationDataGroup method)
(brain.dataformat.annotation.DataSelection method)
(brain.dataformat.base.ManagedDataset method)
(brain.dataformat.base.ManagedFile method)
(brain.dataformat.base.ManagedGroup method)
(brain.dataformat.base.ManagedObject method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataData method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataDescriptors method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataDynamicDescriptors method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataECoG method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataECoGProcessed method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataExternalData method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataFile method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataInternalData method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataStaticDescriptors method)
(brain.readers.htkcollection.HTKCollection method)
(brain.readers.htkfile.HTKFile method)
(brain.tools.convert_braindata.ConvertBrainData method)
__invert__() (brain.dataformat.annotation.Annotation method)
(brain.dataformat.annotation.DataSelection method)
__iter__() (brain.readers.htkfile.HTKFile method)
__le__() (brain.dataformat.annotation.Annotation method)
(brain.dataformat.annotation.DataSelection method)
__len__() (brain.dataformat.annotation.Annotation method)
(brain.dataformat.annotation.AnnotationCollection method)
(brain.dataformat.annotation.DataSelection method)
__logical_operations__() (brain.dataformat.annotation.Annotation method)
__lshift__() (brain.dataformat.annotation.Annotation method)
(brain.dataformat.annotation.DataSelection method)
__lt__() (brain.dataformat.annotation.Annotation method)
(brain.dataformat.annotation.DataSelection method)
__module__ (brain.dataformat.annotation.Annotation attribute)
(brain.dataformat.annotation.AnnotationCollection attribute)
(brain.dataformat.annotation.AnnotationDataGroup attribute)
(brain.dataformat.annotation.DataSelection attribute)
(brain.dataformat.base.ManagedDataset attribute)
(brain.dataformat.base.ManagedFile attribute)
(brain.dataformat.base.ManagedGroup attribute)
(brain.dataformat.base.ManagedObject attribute)
(brain.dataformat.base.ManagedObjectFile attribute)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataData attribute)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataDescriptors attribute)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataDynamicDescriptors attribute)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataECoG attribute)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataECoGProcessed attribute)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataExternalData attribute)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataFile attribute)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataInternalData attribute)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataMultiFile attribute)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataStaticDescriptors attribute)
(brain.readers.htkcollection.HTKCollection attribute)
(brain.readers.htkfile.HTKFile attribute)
(brain.readers.htkfile.HTKFormat attribute)
(brain.tools.convert_braindata.ConvertBrainData attribute)
__ne__() (brain.dataformat.annotation.Annotation method)
(brain.dataformat.annotation.DataSelection method)
__or__() (brain.dataformat.annotation.Annotation method)
(brain.dataformat.annotation.DataSelection method)
__rshift__() (brain.dataformat.annotation.Annotation method)
(brain.dataformat.annotation.DataSelection method)
__setitem__() (brain.dataformat.annotation.DataSelection method)
(brain.dataformat.base.ManagedDataset method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataECoG method)
__weakref__ (brain.dataformat.annotation.Annotation attribute)
(brain.dataformat.annotation.AnnotationCollection attribute)
(brain.dataformat.annotation.DataSelection attribute)
(brain.dataformat.base.ManagedObject attribute)
(brain.readers.htkcollection.HTKCollection attribute)
(brain.readers.htkfile.HTKFile attribute)
(brain.readers.htkfile.HTKFormat attribute)
(brain.tools.convert_braindata.ConvertBrainData attribute)
__xor__() (brain.dataformat.annotation.Annotation method)
(brain.dataformat.annotation.DataSelection method)
_HTKCollection__check_consistency() (brain.readers.htkcollection.HTKCollection method)
_HTKCollection__get_bands() (brain.readers.htkcollection.HTKCollection method)
_HTKCollection__get_block_channel_index_from_name() (brain.readers.htkcollection.HTKCollection static method)
_HTKCollection__get_htk_files() (brain.readers.htkcollection.HTKCollection method)
_HTKCollection__get_htk_metadata() (brain.readers.htkcollection.HTKCollection method)
_HTKCollection__get_layout() (brain.readers.htkcollection.HTKCollection method)
_HTKCollection__read_anatomy() (brain.readers.htkcollection.HTKCollection static method)
_HTKCollection__sort_files() (brain.readers.htkcollection.HTKCollection static method)
_HTKFile__is_big_endian() (brain.readers.htkfile.HTKFile static method)
_HTKFile__seek_sample() (brain.readers.htkfile.HTKFile method)
_HTKFile__swap_required() (brain.readers.htkfile.HTKFile method)

A

add_annotation() (brain.dataformat.annotation.AnnotationCollection method)
add_object() (brain.dataformat.brainformat.BrainDataMultiFile method)
anatomy() (brain.dataformat.brainformat.BrainDataECoG method)
Annotation (class in brain.dataformat.annotation)
AnnotationCollection (class in brain.dataformat.annotation)
AnnotationDataGroup (class in brain.dataformat.annotation)
annotations() (brain.dataformat.brainformat.BrainDataECoG method)
axes() (brain.dataformat.annotation.DataSelection method)
axis_filter() (brain.dataformat.annotation.AnnotationCollection method)

B

brain.__init__ (module)
brain.dataformat (module)
brain.dataformat.annotation (module)
brain.dataformat.base (module)
brain.dataformat.brainformat (module)
brain.readers (module)
brain.readers.htkcollection (module)
brain.readers.htkfile (module)
brain.tools (module)
brain.tools.convert_braindata (module)
BrainDataData (class in brain.dataformat.brainformat)
BrainDataDescriptors (class in brain.dataformat.brainformat)
BrainDataDynamicDescriptors (class in brain.dataformat.brainformat)
BrainDataECoG (class in brain.dataformat.brainformat)
BrainDataECoGProcessed (class in brain.dataformat.brainformat)
BrainDataExternalData (class in brain.dataformat.brainformat)
BrainDataFile (class in brain.dataformat.brainformat)
BrainDataInternalData (class in brain.dataformat.brainformat)
BrainDataMultiFile (class in brain.dataformat.brainformat)
BrainDataStaticDescriptors (class in brain.dataformat.brainformat)
byte_order (brain.readers.htkfile.HTKFormat attribute)

C

check_attribute_format_compliance() (brain.dataformat.base.ManagedObject class method)
check_contained_managed_objects_format_compliance() (brain.dataformat.base.ManagedObject class method)
check_dataset_format_compliance() (brain.dataformat.base.ManagedObject class method)
check_dataset_format_compliance_contained() (brain.dataformat.base.ManagedObject class method)
check_dataset_format_compliance_single() (brain.dataformat.base.ManagedObject class method)
check_format_compliance() (brain.dataformat.base.ManagedObject method)
check_group_format_compliance() (brain.dataformat.base.ManagedObject class method)
check_group_format_compliance_contained() (brain.dataformat.base.ManagedObject class method)
check_group_format_compliance_single() (brain.dataformat.base.ManagedObject class method)
clear_data() (brain.readers.htkcollection.HTKCollection method)
close() (brain.dataformat.base.ManagedObject method)
collapse_selection() (brain.dataformat.annotation.DataSelection method)
convert() (brain.tools.convert_braindata.ConvertBrainData method)
ConvertBrainData (class in brain.tools.convert_braindata)
count() (brain.dataformat.annotation.DataSelection method)
counts() (brain.dataformat.annotation.DataSelection method)
create() (brain.dataformat.base.ManagedObject class method)

D

data() (brain.dataformat.annotation.Annotation method)
(brain.dataformat.annotation.DataSelection method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataFile method)
DataSelection (class in brain.dataformat.annotation)
description_attribute_name (brain.dataformat.base.ManagedObject attribute)
description_contains_filter() (brain.dataformat.annotation.AnnotationCollection method)
description_filter() (brain.dataformat.annotation.AnnotationCollection method)
descriptors() (brain.dataformat.brainformat.BrainDataFile method)
dims() (brain.dataformat.brainformat.BrainDataECoG method)
dynamic() (brain.dataformat.brainformat.BrainDataDescriptors method)

E

ecog_data() (brain.dataformat.brainformat.BrainDataECoG method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataInternalData method)
ecog_data_processed() (brain.dataformat.brainformat.BrainDataInternalData method)
external() (brain.dataformat.brainformat.BrainDataData method)

F

flush() (brain.dataformat.base.ManagedFile method)
format_spec_attribute_name (brain.dataformat.base.ManagedObject attribute)
format_specification_changed() (brain.dataformat.base.ManagedObject method)

G

get_all() (brain.dataformat.base.ManagedObject class method)
get_anatomy_dict() (brain.readers.htkcollection.HTKCollection method)
get_anatomy_map() (brain.readers.htkcollection.HTKCollection method)
get_annotations() (brain.dataformat.annotation.AnnotationCollection method)
get_block_index() (brain.readers.htkcollection.HTKCollection method)
get_channel_index() (brain.readers.htkcollection.HTKCollection method)
get_filename() (brain.dataformat.base.ManagedObject method)
get_format_specification() (brain.dataformat.annotation.AnnotationDataGroup class method)
(brain.dataformat.base.ManagedObject class method)
(brain.dataformat.base.ManagedObjectFile class method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataData class method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataDescriptors class method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataDynamicDescriptors class method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataECoG class method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataECoGProcessed class method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataExternalData class method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataFile class method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataInternalData class method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataMultiFile class method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataStaticDescriptors class method)
get_format_specification_from_file() (brain.dataformat.base.ManagedObject method)
get_format_specification_recursive() (brain.dataformat.base.ManagedObject class method)
get_h5py() (brain.dataformat.base.ManagedObject method)
get_managed_object() (brain.dataformat.base.ManagedObject class method)
get_managed_object_type() (brain.dataformat.base.ManagedDataset class method)
(brain.dataformat.base.ManagedFile class method)
(brain.dataformat.base.ManagedGroup class method)
(brain.dataformat.base.ManagedObject class method)
get_num_dimensions_from_dataset_specification() (brain.dataformat.base.ManagedObject class method)
get_number_of_blocks() (brain.readers.htkcollection.HTKCollection method)
get_number_of_channels_per_block() (brain.readers.htkcollection.HTKCollection method)
get_number_of_files() (brain.readers.htkcollection.HTKCollection method)
get_object_id() (brain.dataformat.base.ManagedObject method)

H

has_anatomy() (brain.dataformat.brainformat.BrainDataECoG method)
(brain.readers.htkcollection.HTKCollection method)
has_annotations() (brain.dataformat.brainformat.BrainDataECoG method)
has_layout() (brain.dataformat.brainformat.BrainDataECoG method)
has_object_id() (brain.dataformat.base.ManagedObject method)
header (brain.readers.htkfile.HTKFormat attribute)
header_format() (brain.readers.htkfile.HTKFormat class method)
header_length (brain.readers.htkfile.HTKFormat attribute)
HTKCollection (class in brain.readers.htkcollection)
HTKFile (class in brain.readers.htkfile)
HTKFormat (class in brain.readers.htkfile)

I

index_filter() (brain.dataformat.annotation.AnnotationCollection method)
internal() (brain.dataformat.brainformat.BrainDataData method)
is_managed() (brain.dataformat.base.ManagedObject class method)
is_managed_by() (brain.dataformat.base.ManagedObject class method)
items() (brain.dataformat.base.ManagedGroup method)

K

keys() (brain.dataformat.base.ManagedGroup method)

L

layout() (brain.dataformat.brainformat.BrainDataECoG method)
log_settings() (brain.tools.convert_braindata.ConvertBrainData method)

M

ManagedDataset (class in brain.dataformat.base)
ManagedFile (class in brain.dataformat.base)
ManagedGroup (class in brain.dataformat.base)
ManagedObject (class in brain.dataformat.base)
ManagedObjectFile (class in brain.dataformat.base)
merge_and() (brain.dataformat.annotation.AnnotationCollection method)
merge_or() (brain.dataformat.annotation.AnnotationCollection method)
merge_xor() (brain.dataformat.annotation.AnnotationCollection method)

N

next() (brain.readers.htkfile.HTKFile method)
num_annotations() (brain.dataformat.annotation.AnnotationCollection method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataECoG method)
num_ecog_data() (brain.dataformat.brainformat.BrainDataInternalData method)
num_ecog_data_processed() (brain.dataformat.brainformat.BrainDataInternalData method)

O

object_id_attribute_name (brain.dataformat.base.ManagedObject attribute)
original_name() (brain.dataformat.brainformat.BrainDataECoGProcessed method)

P

param_kind_base (brain.readers.htkfile.HTKFormat attribute)
param_kind_encoding (brain.readers.htkfile.HTKFormat attribute)
parse_arguments() (brain.tools.convert_braindata.ConvertBrainData static method)
populate() (brain.dataformat.annotation.AnnotationDataGroup method)
(brain.dataformat.base.ManagedObject method)
(brain.dataformat.base.ManagedObjectFile method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataData method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataDescriptors method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataDynamicDescriptors method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataECoG method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataECoGProcessed method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataExternalData method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataFile method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataInternalData method)
(brain.dataformat.brainformat.BrainDataStaticDescriptors method)
print_help() (brain.tools.convert_braindata.ConvertBrainData static method)

R

read_channel() (brain.readers.htkcollection.HTKCollection method)
read_data() (brain.readers.htkcollection.HTKCollection method)
(brain.readers.htkfile.HTKFile method)
read_sample() (brain.readers.htkfile.HTKFile method)

S

sampling_rate() (brain.dataformat.brainformat.BrainDataECoG method)
set_object_id() (brain.dataformat.base.ManagedObject method)
simplify_selection() (brain.dataformat.annotation.DataSelection method)
static() (brain.dataformat.brainformat.BrainDataDescriptors method)

T

type_attribute_name (brain.dataformat.base.ManagedObject attribute)
type_contains_filter() (brain.dataformat.annotation.AnnotationCollection method)
type_filter() (brain.dataformat.annotation.AnnotationCollection method)

V

validate() (brain.dataformat.annotation.DataSelection method)
values() (brain.dataformat.base.ManagedGroup method)